MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	TTAT	2	8	1995	2002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021821	TTTA	2	8	2228	2235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021821	TAGC	2	8	2323	2330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021821	TCAA	2	8	6523	6530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021821	ACCA	2	8	6729	6736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021821	TCTT	2	8	6868	6875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021821	ATCA	2	8	6993	7000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021821	ATAA	3	12	9149	9160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021821	ATCC	2	8	9981	9988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021821	CATT	2	8	11615	11622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021821	TACT	2	8	12887	12894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021821	AGAA	2	8	16824	16831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021821	AATA	2	8	16960	16967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021821	TAGT	2	8	18831	18838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021821	GTCA	2	8	19018	19025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021821	ATTT	2	8	19240	19247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021821	TAAG	2	8	21590	21597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021821	GAAC	2	8	25040	25047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021821	GACA	2	8	25474	25481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021821	TCGG	2	8	26185	26192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021821	CAAA	2	8	26202	26209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021821	ACTT	2	8	26545	26552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021821	AAAT	2	8	26753	26760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021821	TTAA	2	8	26873	26880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021821	AATA	2	8	27475	27482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021821	CGCA	2	8	28219	28226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021821	CTAA	2	8	29264	29271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021821	TAAC	2	8	34217	34224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021821	CTAT	2	8	34781	34788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021821	AGAT	2	8	37839	37846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021821	CAGC	2	8	42665	42672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021821	AATA	2	8	45309	45316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021821	CTCG	2	8	48418	48425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021821	AAGA	2	8	52221	52228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021821	AAAG	2	8	52459	52466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021821	TGAT	2	8	52708	52715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021821	ACTT	2	8	53059	53066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021821	CAAA	2	8	53182	53189	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021821	CGCT	2	8	53258	53265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021821	CCAG	2	8	53747	53754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021821	GAAC	2	8	61967	61974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021821	AAGG	2	8	63057	63064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021821	TCAT	2	8	63800	63807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021821	TAAA	2	8	65486	65493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021821	CTGA	2	8	66490	66497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021821	TAGT	2	8	71026	71033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021821	ATAA	2	8	75400	75407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021821	ATTA	2	8	75428	75435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021821	CTCA	2	8	75584	75591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021821	GAAA	2	8	76397	76404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021821	ATCA	2	8	76421	76428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021821	GAAC	2	8	76432	76439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021821	ACAA	2	8	79352	79359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021821	CAAG	2	8	79470	79477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021821	CCAC	2	8	83590	83597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_021821	GACA	2	8	83609	83616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021821	GAAA	2	8	108849	108856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021821	AAAC	2	8	108971	108978	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021821	TTAT	2	8	112868	112875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021821	TTAG	2	8	113917	113924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021821	TAGA	2	8	114658	114665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021821	GAAC	2	8	117154	117161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021821	AAAT	2	8	117194	117201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021821	GTGA	2	8	118330	118337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021821	CAAT	2	8	126610	126617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021821	TTAT	2	8	126761	126768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021821	AGAT	2	8	126771	126778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021821	AGTA	2	8	130668	130675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021821	TGAA	2	8	132434	132441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021821	TAAA	2	8	141032	141039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021821	TCAG	2	8	142654	142661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021821	TAGA	2	8	142745	142752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021821	AATT	2	8	147663	147670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021821	TACT	2	8	147688	147695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021821	GTAC	2	8	153571	153578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021821	GTAA	2	8	153691	153698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021821	TCAT	2	8	155223	155230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021821	CAGA	2	8	155303	155310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021821	TGCT	2	8	155362	155369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021821	ATTT	2	8	161919	161926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021821	TATT	2	8	166809	166816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021821	TAAT	2	8	169335	169342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021821	TGGT	2	8	171707	171714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021821	AATT	2	8	174909	174916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021821	ACTG	2	8	176868	176875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021821	AAGT	2	8	176938	176945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021821	CTTG	2	8	178678	178685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021821	CAAA	2	8	180888	180895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021821	ACAT	2	8	184303	184310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021821	AAGT	2	8	186294	186301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021821	TTCC	2	8	188999	189006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021821	AATT	2	8	189086	189093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021821	CCAA	2	8	194101	194108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021821	ATTA	2	8	194235	194242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021821	CAAA	2	8	194385	194392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021821	TCTG	2	8	194996	195003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021821	TTTC	2	8	197203	197210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021821	AACA	2	8	197275	197282	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021821	CTTT	2	8	202908	202915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021821	TCAT	2	8	202919	202926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021821	TTGC	2	8	204885	204892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021821	ACTT	2	8	204912	204919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021821	GTAA	2	8	205932	205939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021821	GTTC	2	8	205960	205967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021821	ATTG	2	8	216073	216080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021821	TAGT	2	8	223729	223736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021821	GAAA	2	8	223760	223767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021821	ATCA	2	8	232357	232364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021821	CAAA	2	8	234067	234074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021821	TCGA	2	8	238394	238401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021821	CAAG	2	8	238565	238572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021821	AAAC	2	8	250658	250665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021821	GTTT	2	8	250681	250688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021821	TTGA	2	8	251577	251584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021821	AAAT	2	8	256178	256185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021821	CTCA	2	8	261796	261803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021821	CAAC	2	8	263916	263923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021821	TATT	2	8	265190	265197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021821	TTCA	2	8	265373	265380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021821	TTTA	2	8	265455	265462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021821	CATT	2	8	265725	265732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021821	ATCA	2	8	267277	267284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021821	TTTC	2	8	269097	269104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021821	CATT	2	8	269118	269125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021821	AGAA	2	8	270011	270018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021821	TAAA	2	8	270093	270100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021821	TAAA	2	8	270219	270226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021821	ATGA	2	8	270309	270316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021821	ACAA	2	8	271474	271481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021821	CCAA	2	8	274271	274278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021821	AACC	2	8	278278	278285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021821	AATC	2	8	281597	281604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021821	GATA	2	8	283283	283290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021821	AGAA	2	8	284749	284756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021821	AATC	2	8	288018	288025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021821	AAGG	2	8	289526	289533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021821	AAAC	2	8	292518	292525	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021821	TCAT	2	8	295072	295079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021821	ATAA	2	8	300582	300589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021821	GTAA	2	8	303428	303435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021821	GATT	2	8	303794	303801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021821	TCAT	2	8	304951	304958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021821	TTTA	2	8	306631	306638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021821	CCTC	2	8	306676	306683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_021821	AAAT	2	8	315881	315888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021821	TTTA	2	8	316739	316746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021821	AATT	2	8	316756	316763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021821	AATA	2	8	316901	316908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021821	CAAA	2	8	317219	317226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021821	TTAG	2	8	325985	325992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021821	ATAA	2	8	325995	326002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021821	TAAA	2	8	328596	328603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021821	AAAG	2	8	332267	332274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021821	GTTT	2	8	332300	332307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021821	AATA	2	8	332606	332613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021821	ATAA	2	8	332614	332621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021821	TATT	2	8	343342	343349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021821	TTCA	2	8	361136	361143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_021821	AAGA	2	8	367035	367042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021821	CATT	2	8	372819	372826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_021821	AAGA	2	8	383902	383909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_021821	ATTG	2	8	406566	406573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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