MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019955	TCA	2	6	1247179	1247184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_019955	CAA	2	6	1247188	1247193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_019955	CCCGG	2	10	1247265	1247274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4004	NC_019955	GCA	2	6	1247582	1247587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_019955	GCT	2	6	1247613	1247618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_019955	CAA	2	6	1247815	1247820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_019955	A	6	6	1247884	1247889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019955	GATT	2	8	1247931	1247938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019955	CTTT	2	8	1249723	1249730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_019955	TTGTTA	2	12	1249737	1249748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019955	ATCT	2	8	1249787	1249794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_019955	TTAT	2	8	1249796	1249803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019955	TAA	2	6	1249825	1249830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019955	TAAA	2	8	1249849	1249856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019955	ATTT	2	8	1249874	1249881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019955	T	6	6	1249898	1249903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_019955	GTT	2	6	1249927	1249932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_019955	TTA	2	6	1249979	1249984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019955	AG	3	6	1250052	1250057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019955	AGA	2	6	1250812	1250817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_019955	AGC	2	6	1250818	1250823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_019955	TA	3	6	1250888	1250893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_019955	AT	3	6	1251309	1251314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019955	GGT	2	6	1251329	1251334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019955	T	6	6	1251355	1251360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_019955	CT	3	6	1251726	1251731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_019955	CAA	2	6	1251759	1251764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_019955	TTG	2	6	1251772	1251777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019955	AGCG	2	8	1251810	1251817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_019955	CAT	2	6	1251879	1251884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_019955	TCA	2	6	1251910	1251915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_019955	TTA	2	6	1254012	1254017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019955	ATC	2	6	1254506	1254511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019955	TCG	2	6	1257152	1257157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_019955	ATGC	2	8	1257262	1257269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_019955	AATC	2	8	1257346	1257353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_019955	GC	3	6	1257376	1257381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_019955	T	7	7	1259508	1259514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_019955	CCTC	2	8	1261516	1261523	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4040	NC_019955	AAGT	2	8	1264844	1264851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019955	ATTG	2	8	1264889	1264896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019955	ATT	2	6	1265000	1265005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019955	TG	3	6	1265026	1265031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019955	ATT	2	6	1265047	1265052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019955	ATT	2	6	1265067	1265072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019955	TGTT	2	8	1265081	1265088	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019955	CTGT	2	8	1265227	1265234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_019955	TAC	2	6	1265255	1265260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_019955	AGTC	2	8	1265263	1265270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_019955	GCT	2	6	1265900	1265905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_019955	TGG	2	6	1265971	1265976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019955	TGG	2	6	1265995	1266000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019955	GGC	2	6	1266001	1266006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_019955	GGAT	2	8	1266075	1266082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019955	GAG	2	6	1266092	1266097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019955	T	6	6	1266176	1266181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_019955	ACTG	2	8	1266229	1266236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_019955	GCT	2	6	1266284	1266289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019955	CA	3	6	1266295	1266300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_019955	GAT	2	6	1266400	1266405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_019955	ATTG	2	8	1266428	1266435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019955	TCA	2	6	1266451	1266456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_019955	TGG	2	6	1267959	1267964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019955	TAA	2	6	1269437	1269442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019955	T	6	6	1269491	1269496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019955	TGC	2	6	1269518	1269523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_019955	CAA	2	6	1269543	1269548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_019955	TGT	2	6	1269553	1269558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019955	CTA	2	6	1269619	1269624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_019955	T	6	6	1273945	1273950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019955	A	6	6	1273977	1273982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_019955	GTGAG	2	10	1273996	1274005	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019955	CAT	2	6	1274007	1274012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_019955	TAA	2	6	1274025	1274030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019955	TAA	2	6	1274041	1274046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019955	GATA	2	8	1274050	1274057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019955	AGG	2	6	1274060	1274065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019955	TTG	2	6	1274093	1274098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019955	ATT	2	6	1274161	1274166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019955	ATA	2	6	1274222	1274227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019955	TTTTTG	2	12	1275444	1275455	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019955	A	7	7	1275488	1275494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019955	TAA	2	6	1275537	1275542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019955	A	6	6	1275544	1275549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019955	GCA	2	6	1275550	1275555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_019955	GTT	2	6	1275611	1275616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_019955	T	8	8	1275654	1275661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019955	A	6	6	1275663	1275668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019955	ATTC	2	8	1275695	1275702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_019955	GTT	2	6	1275800	1275805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019955	AAT	2	6	1276482	1276487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019955	CCT	2	6	1278841	1278846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_019955	T	6	6	1278855	1278860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019955	GA	3	6	1278882	1278887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019955	CGAA	2	8	1278945	1278952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_019955	T	6	6	1278971	1278976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019955	T	6	6	1280233	1280238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019955	TGA	2	6	1280244	1280249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019955	TG	3	6	1281961	1281966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_019955	GT	3	6	1281977	1281982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_019955	A	7	7	1281986	1281992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019955	T	7	7	1282041	1282047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019955	ATA	2	6	1282091	1282096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019955	A	6	6	1282096	1282101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019955	ATG	2	6	1282107	1282112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_019955	A	6	6	1282121	1282126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019955	T	9	9	1282427	1282435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019955	CT	3	6	1282466	1282471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_019955	TTG	2	6	1282473	1282478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019955	AGC	2	6	1282512	1282517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_019955	T	7	7	1282704	1282710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_019955	GGA	2	6	1282751	1282756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019955	GAA	2	6	1284022	1284027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019955	AAC	2	6	1284942	1284947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_019955	AG	3	6	1284992	1284997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019955	CAAA	2	8	1285101	1285108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_019955	TGT	2	6	1285110	1285115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_019955	TTG	2	6	1285149	1285154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019955	ATG	2	6	1285171	1285176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019955	AGAA	2	8	1285194	1285201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019955	CTAAA	2	10	1286926	1286935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4122	NC_019955	ATT	2	6	1286958	1286963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_019955	TGAAA	2	10	1286978	1286987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019955	GTT	2	6	1287567	1287572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019955	ATG	2	6	1287602	1287607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019955	TGT	2	6	1287628	1287633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019955	TAA	2	6	1287667	1287672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019955	ACA	2	6	1288719	1288724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_019955	GTTA	2	8	1288759	1288766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019955	GTG	2	6	1289700	1289705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019955	GAA	2	6	1289738	1289743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_019955	A	7	7	1289827	1289833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_019955	ATG	2	6	1289872	1289877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_019955	ATC	2	6	1319532	1319537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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