MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 3729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017269	T	6	6	326208	326213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017269	GGT	2	6	327202	327207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017269	GTT	2	6	327212	327217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017269	GGCG	2	8	327256	327263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_017269	ACGA	2	8	327366	327373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_017269	GAC	2	6	327389	327394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017269	TGA	2	6	327414	327419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017269	GTT	2	6	327442	327447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017269	A	6	6	327543	327548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017269	ATTC	2	8	327587	327594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_017269	T	6	6	327620	327625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017269	TAAGT	2	10	327691	327700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017269	TAT	2	6	327727	327732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017269	TAA	2	6	327820	327825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017269	A	6	6	327844	327849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017269	GGT	2	6	327939	327944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017269	GTT	2	6	327949	327954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017269	TAG	2	6	327966	327971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017269	GCT	2	6	328035	328040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017269	GGT	2	6	328915	328920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017269	GTT	2	6	328925	328930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017269	GGCG	2	8	328969	328976	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_017269	TC	3	6	328983	328988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017269	A	6	6	329361	329366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017269	GGT	2	6	329452	329457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017269	GTT	2	6	329462	329467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017269	GGCG	2	8	329506	329513	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_017269	A	6	6	329529	329534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017269	GAT	2	6	329597	329602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017269	TC	4	8	329641	329648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_017269	TAC	2	6	329735	329740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017269	GA	3	6	329971	329976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017269	CTT	2	6	329979	329984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017269	TGT	2	6	330291	330296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017269	GT	3	6	330295	330300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017269	CG	3	6	330363	330368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_017269	GGT	2	6	330393	330398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_017269	GGCG	2	8	330446	330453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1541	NC_017269	GTT	2	6	331053	331058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1543	NC_017269	GGCG	2	8	331096	331103	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_017269	AGT	2	6	331130	331135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017269	GGT	2	6	331651	331656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017269	GTT	2	6	331661	331666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017269	GGCG	2	8	331705	331712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_017269	TGCA	2	8	331726	331733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_017269	GTT	2	6	331812	331817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1551	NC_017269	GC	3	6	332099	332104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_017269	AT	3	6	332410	332415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017269	CAT	2	6	332444	332449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017269	AG	3	6	332479	332484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017269	TGAG	2	8	332538	332545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_017269	TA	3	6	336132	336137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017269	GA	3	6	336176	336181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017269	TAG	2	6	336357	336362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1564	NC_017269	TTG	2	6	336570	336575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017269	TTC	2	6	336671	336676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_017269	TGA	2	6	336851	336856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_017269	TTTTGG	2	12	337043	337054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017269	ATCGC	2	10	337105	337114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1573	NC_017269	CGG	2	6	337138	337143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_017269	TA	3	6	337543	337548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_017269	A	6	6	337761	337766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_017269	AACGT	2	10	338011	338020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1589	NC_017269	AAG	3	9	338254	338262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_017269	GTT	2	6	340942	340947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017269	A	6	6	340955	340960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017269	TCAT	2	8	345034	345041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_017269	A	7	7	345087	345093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017269	TGC	2	6	345123	345128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017269	CTAGG	2	10	345240	345249	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_017269	TCC	2	6	346315	346320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_017269	TGA	3	9	350584	350592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017269	TAGTGA	2	12	350610	350621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017269	TAA	2	6	350631	350636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017269	AG	3	6	350637	350642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017269	TGGA	2	8	350677	350684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017269	ATT	2	6	352710	352715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017269	G	6	6	352716	352721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017269	TA	3	6	352734	352739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017269	TCCA	2	8	352783	352790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_017269	TCC	2	6	352812	352817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_017269	T	6	6	352891	352896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017269	T	6	6	352911	352916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017269	ATCAA	2	10	352928	352937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_017269	AT	3	6	352940	352945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017269	TCA	2	6	353023	353028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1620	NC_017269	GA	3	6	353054	353059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017269	TC	3	6	353112	353117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_017269	GTTTT	2	10	353140	353149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017269	TGGT	2	8	353159	353166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017269	TGGC	2	8	353171	353178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_017269	GCT	2	6	353278	353283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017269	AT	3	6	354489	354494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017269	A	6	6	354504	354509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017269	AT	3	6	354531	354536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017269	ATT	2	6	354570	354575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017269	TTA	2	6	354577	354582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017269	AAT	2	6	354592	354597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017269	TAA	2	6	354598	354603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017269	GGA	2	6	354619	354624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017269	GAA	2	6	354654	354659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017269	AAT	2	6	354675	354680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017269	TAT	2	6	355746	355751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_017269	ATG	2	6	454128	454133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_017269	CG	3	6	454144	454149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1964	NC_017269	CGGA	2	8	454616	454623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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