MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 3729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017269	GTG	2	6	137880	137885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017269	ATT	2	6	137949	137954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017269	A	6	6	137963	137968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017269	AG	3	6	138018	138023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017269	A	7	7	138042	138048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017269	AT	3	6	138051	138056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017269	CAT	2	6	138059	138064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017269	ATTA	2	8	138065	138072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017269	GTA	2	6	138097	138102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017269	TTCC	2	8	138103	138110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017269	TA	3	6	138180	138185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017269	TAA	2	6	138205	138210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017269	T	6	6	138219	138224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017269	AG	3	6	138245	138250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017269	T	6	6	138261	138266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017269	AG	3	6	138287	138292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017269	ATA	2	6	138310	138315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017269	AATTT	2	10	138414	138423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017269	GTT	2	6	138435	138440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017269	ATT	2	6	138441	138446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017269	AAG	2	6	138485	138490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017269	TGG	2	6	138511	138516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017269	GTG	2	6	138522	138527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017269	TA	3	6	138590	138595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017269	ATA	2	6	138606	138611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017269	AATG	2	8	138644	138651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017269	TTA	2	6	138660	138665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017269	TTAA	2	8	138673	138680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017269	GTT	2	6	138720	138725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017269	TCA	2	6	139034	139039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017269	TGC	2	6	139053	139058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017269	TCA	2	6	139129	139134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017269	CAT	2	6	139151	139156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017269	TAT	2	6	139215	139220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017269	T	6	6	139245	139250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017269	GGA	2	6	139742	139747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017269	CAG	2	6	142271	142276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017269	CTC	2	6	143207	143212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_017269	GAG	2	6	143217	143222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017269	GAA	2	6	143269	143274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017269	TCA	2	6	143310	143315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017269	GA	3	6	145321	145326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017269	CT	3	6	146800	146805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017269	CGC	2	6	146880	146885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017269	A	6	6	146891	146896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017269	T	6	6	148748	148753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017269	TTC	2	6	148755	148760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017269	GA	4	8	148801	148808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017269	GCG	2	6	148837	148842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017269	TGA	2	6	148876	148881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017269	CTA	2	6	150284	150289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017269	ATTT	2	8	150347	150354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017269	TTA	2	6	150393	150398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017269	TGAT	2	8	150402	150409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017269	ATT	2	6	150421	150426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_017269	ATT	2	6	150493	150498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017269	TGA	2	6	150515	150520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017269	AAG	2	6	150602	150607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017269	AG	3	6	150606	150611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017269	GA	3	6	151087	151092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017269	CAAG	2	8	151294	151301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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564	NC_017269	AAG	2	6	151455	151460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017269	GC	3	6	152639	152644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017269	GGC	2	6	154900	154905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_017269	TTA	2	6	156355	156360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017269	CG	3	6	156421	156426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_017269	CGG	2	6	156432	156437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017269	T	6	6	156438	156443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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574	NC_017269	AGT	2	6	157744	157749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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576	NC_017269	TA	3	6	161217	161222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017269	T	7	7	161285	161291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017269	AAG	2	6	161311	161316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_017269	TAA	3	9	161388	161396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017269	CACG	2	8	161487	161494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017269	T	6	6	165311	165316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017269	GA	3	6	165362	165367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_017269	GCA	2	6	167475	167480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_017269	TGG	2	6	173196	173201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017269	TTG	2	6	175858	175863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017269	TGT	2	6	175868	175873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017269	A	7	7	175889	175895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017269	GATT	2	8	177416	177423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017269	ATA	2	6	177445	177450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017269	ATATTT	2	12	177499	177510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017269	TAGA	2	8	177556	177563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017269	AGA	2	6	177833	177838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017269	GTT	2	6	177876	177881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017269	CGA	2	6	178110	178115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017269	TGC	2	6	178355	178360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017269	TGT	2	6	178365	178370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017269	AG	3	6	179005	179010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017269	GGA	2	6	179041	179046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017269	A	6	6	179087	179092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017269	AAC	2	6	179149	179154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017269	GCTG	2	8	179166	179173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_017269	A	7	7	179198	179204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017269	GCG	2	6	179207	179212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017269	ATTG	2	8	179238	179245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017269	CAG	2	6	181442	181447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017269	AAAT	2	8	181474	181481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017269	A	6	6	181493	181498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017269	GTT	2	6	181533	181538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017269	AT	4	8	181661	181668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017269	GATT	2	8	181901	181908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017269	GTG	2	6	181920	181925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017269	A	7	7	181965	181971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017269	A	6	6	181981	181986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017269	CATT	2	8	181995	182002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017269	T	6	6	182001	182006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017269	TGT	2	6	182124	182129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017269	TCC	2	6	182874	182879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017269	ATTG	2	8	182881	182888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017269	GAC	2	6	182900	182905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017269	CCA	2	6	182934	182939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_017269	CCT	2	6	183010	183015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017269	CGG	2	6	183035	183040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017269	GCTGC	2	10	183056	183065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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