MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 3272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016945	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016945	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016945	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016945	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016945	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016945	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016945	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016945	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016945	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016945	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016945	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016945	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016945	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016945	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016945	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016945	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016945	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016945	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016945	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016945	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016945	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016945	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016945	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016945	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016945	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016945	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016945	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016945	T	7	7	3279	3285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016945	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016945	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016945	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016945	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016945	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016945	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016945	CGGTAT	2	12	8331	8342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016945	CTTG	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016945	TAA	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016945	AGTG	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016945	AG	3	6	8514	8519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016945	TC	3	6	11701	11706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016945	T	6	6	11851	11856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016945	TCT	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016945	TAC	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016945	AAC	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016945	ATT	2	6	11986	11991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016945	GGT	2	6	12073	12078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016945	TCAC	2	8	12132	12139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016945	CTC	3	9	12169	12177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016945	TGA	2	6	12183	12188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016945	GGA	2	6	12197	12202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016945	T	6	6	14759	14764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016945	GA	3	6	14801	14806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016945	AAG	2	6	17025	17030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016945	TCC	2	6	17050	17055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016945	GTTAG	2	10	17177	17186	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016945	TA	3	6	19403	19408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016945	A	7	7	19458	19464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016945	GCG	2	6	19470	19475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016945	T	7	7	19477	19483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016945	GTG	2	6	19523	19528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016945	CAAG	2	8	19599	19606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016945	T	6	6	19628	19633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016945	TCAT	2	8	19738	19745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016945	GGC	2	6	20333	20338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016945	GGAA	2	8	20411	20418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016945	ACT	2	6	27387	27392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016945	GCG	2	6	27411	27416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016945	GCC	2	6	27960	27965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016945	GTT	2	6	27981	27986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016945	CTT	2	6	29153	29158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016945	A	6	6	29167	29172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016945	TTC	2	6	30205	30210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016945	CAA	2	6	30337	30342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016945	ATA	2	6	30477	30482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016945	A	6	6	31892	31897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016945	CAG	2	6	31950	31955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016945	TGC	2	6	32764	32769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016945	AATC	2	8	32792	32799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016945	TTTGT	2	10	32811	32820	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016945	CTC	2	6	32864	32869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016945	T	8	8	32915	32922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016945	CAAA	2	8	32925	32932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016945	A	6	6	32930	32935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016945	TC	3	6	32937	32942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016945	AG	4	8	33019	33026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016945	TTC	2	6	35879	35884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016945	CCA	2	6	35923	35928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016945	TCT	2	6	37532	37537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016945	TGAT	2	8	37543	37550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016945	GTG	2	6	39910	39915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016945	A	6	6	39921	39926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016945	ACATG	2	10	39941	39950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016945	TCG	2	6	39975	39980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016945	AGT	2	6	40088	40093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016945	TTA	2	6	40099	40104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016945	AAG	2	6	42181	42186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016945	CTT	2	6	42196	42201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016945	CTA	2	6	43094	43099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016945	ATT	2	6	43129	43134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016945	TA	3	6	43137	43142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016945	TAA	2	6	43148	43153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016945	T	7	7	43186	43192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016945	A	6	6	45316	45321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016945	ATT	2	6	45327	45332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016945	AAGT	2	8	45437	45444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016945	TTG	2	6	45448	45453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016945	GTC	2	6	45491	45496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016945	CAA	2	6	45512	45517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016945	TGT	2	6	45606	45611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016945	CT	3	6	47146	47151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016945	CAC	2	6	47258	47263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016945	GGT	2	6	47274	47279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016945	CAA	2	6	48299	48304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016945	TTCATA	2	12	48310	48321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016945	TTG	2	6	48329	48334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016945	CAA	2	6	48356	48361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016945	ATG	2	6	48362	48367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016945	TGAG	2	8	48371	48378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016945	GTT	2	6	48485	48490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016945	CAT	2	6	48509	48514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016945	AT	3	6	48513	48518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016945	T	7	7	48548	48554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016945	T	6	6	48590	48595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016945	TTA	2	6	48664	48669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016945	TGT	2	6	48688	48693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016945	GA	3	6	48736	48741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016945	AAT	2	6	48750	48755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016945	GAT	2	6	50037	50042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016945	ACG	2	6	50852	50857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016945	ATTCA	2	10	50906	50915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016945	ATCT	2	8	50936	50943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016945	AAC	2	6	51269	51274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016945	GGC	2	6	51290	51295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016945	AGTG	2	8	51297	51304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016945	TTG	2	6	51445	51450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016945	CAA	2	6	54752	54757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016945	A	6	6	54756	54761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016945	CGTT	2	8	54832	54839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016945	C	6	6	54840	54845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_016945	GT	3	6	54853	54858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016945	GCC	2	6	54886	54891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016945	ATA	2	6	56514	56519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016945	ATA	2	6	56540	56545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016945	TGC	2	6	56571	56576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016945	GTC	2	6	59637	59642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016945	A	6	6	59715	59720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016945	ATA	2	6	59745	59750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_016945	TGGT	2	8	62237	62244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016945	AATT	2	8	66919	66926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_016945	A	6	6	110685	110690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_016945	CAG	2	6	110852	110857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_016945	TTG	2	6	114437	114442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_016945	ATG	3	9	114521	114529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_016945	A	6	6	196325	196330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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