MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 3272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016945	ACGG	2	8	203722	203729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_016945	AAT	2	6	203735	203740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016945	CCAA	2	8	203741	203748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_016945	T	6	6	204376	204381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016945	TTG	2	6	204399	204404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016945	T	6	6	204510	204515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016945	T	6	6	204529	204534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016945	TAAA	2	8	204548	204555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016945	AATG	2	8	204570	204577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016945	AGGT	2	8	204599	204606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016945	TTAA	2	8	205001	205008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016945	ACA	2	6	205202	205207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016945	CAC	2	6	205513	205518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_016945	GGT	2	6	205580	205585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016945	CAA	2	6	209633	209638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016945	A	6	6	211958	211963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016945	TCC	2	6	212566	212571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_016945	AGT	2	6	212685	212690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016945	GTG	2	6	212752	212757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016945	ATT	2	6	212759	212764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016945	A	8	8	213010	213017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016945	GA	3	6	213034	213039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016945	A	8	8	213039	213046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016945	T	7	7	213092	213098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016945	TAC	2	6	213133	213138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016945	TCT	2	6	214304	214309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016945	GCTT	2	8	214318	214325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_016945	TGC	2	6	214364	214369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016945	GTA	2	6	214533	214538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016945	TAA	2	6	215796	215801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016945	TAG	2	6	218909	218914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016945	GATA	2	8	218924	218931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016945	A	6	6	218948	218953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016945	ATT	2	6	218963	218968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016945	AG	3	6	218975	218980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016945	TAA	2	6	219050	219055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016945	GA	3	6	219162	219167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016945	TTA	2	6	219247	219252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016945	TGA	2	6	219260	219265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016945	TTA	2	6	219288	219293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016945	TTA	2	6	219320	219325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016945	A	7	7	219348	219354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016945	A	6	6	219410	219415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016945	GGT	2	6	219501	219506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016945	GAT	2	6	219549	219554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016945	CAA	2	6	219580	219585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016945	A	6	6	219584	219589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016945	ATA	2	6	219643	219648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016945	TATT	2	8	219665	219672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016945	TGG	2	6	219689	219694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016945	TTG	2	6	219709	219714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016945	TATAAA	2	12	219733	219744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016945	CTT	2	6	219752	219757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016945	ACG	2	6	219796	219801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016945	CTTA	2	8	220257	220264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_016945	TCT	2	6	220282	220287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016945	CAC	2	6	220328	220333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016945	GGT	2	6	220344	220349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016945	CTTT	2	8	220384	220391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_016945	AAG	2	6	220540	220545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016945	ACT	2	6	220709	220714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016945	CTT	2	6	220725	220730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016945	TAG	2	6	222176	222181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016945	GA	4	8	222214	222221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016945	GTC	2	6	222234	222239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_016945	T	6	6	223779	223784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016945	TTG	2	6	223794	223799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016945	CAAGC	2	10	223827	223836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
569	NC_016945	GGCTT	2	10	223841	223850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
570	NC_016945	TTCCT	2	10	224705	224714	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
571	NC_016945	GCAA	2	8	224715	224722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_016945	TCAT	2	8	225381	225388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_016945	TGC	2	6	225391	225396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016945	GC	3	6	225433	225438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_016945	ATG	2	6	225475	225480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016945	CA	4	8	225488	225495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016945	AAG	2	6	225564	225569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016945	CCTT	2	8	229198	229205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_016945	GGA	2	6	229381	229386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016945	GT	3	6	230395	230400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016945	CAG	2	6	232060	232065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016945	A	6	6	232069	232074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016945	CTT	2	6	232095	232100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016945	ACA	2	6	232125	232130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016945	TGA	2	6	232176	232181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016945	TCA	2	6	232218	232223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016945	GC	3	6	232258	232263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_016945	AC	3	6	232315	232320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_016945	GAC	2	6	232346	232351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016945	TTA	2	6	233661	233666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016945	ATT	2	6	233746	233751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016945	ATT	2	6	233786	233791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016945	T	6	6	233790	233795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016945	TCATC	2	10	235230	235239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
595	NC_016945	T	6	6	235241	235246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016945	GGAT	2	8	235308	235315	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016945	CTT	2	6	236607	236612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016945	TGA	2	6	236733	236738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016945	TCT	3	9	236750	236758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_016945	AACTT	2	10	236897	236906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
601	NC_016945	T	7	7	236905	236911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016945	ATT	2	6	236914	236919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016945	AATT	2	8	236946	236953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016945	AAATT	2	10	236970	236979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016945	ATA	2	6	236991	236996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016945	ATT	2	6	237027	237032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016945	AGTA	2	8	237131	237138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016945	TGG	2	6	237141	237146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016945	AT	3	6	237153	237158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016945	GGC	2	6	237185	237190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016945	AG	3	6	237192	237197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016945	TG	3	6	237223	237228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016945	GAAC	2	8	237237	237244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_016945	AAG	2	6	237272	237277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016945	ACTCA	2	10	237416	237425	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_016945	AGA	2	6	237433	237438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016945	TTA	2	6	237443	237448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016945	AT	3	6	237472	237477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016945	T	6	6	237484	237489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016945	AGT	2	6	237491	237496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016945	TTTG	2	8	237512	237519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016945	TC	3	6	237524	237529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_016945	TAA	2	6	237533	237538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016945	TTTA	2	8	239873	239880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016945	AAT	2	6	239912	239917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016945	TAC	2	6	239925	239930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016945	CAG	2	6	240058	240063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016945	T	6	6	240068	240073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016945	AAGC	2	8	241755	241762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_016945	TGA	2	6	241778	241783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016945	T	6	6	241826	241831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016945	T	6	6	241845	241850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016945	TTA	2	6	241902	241907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016945	CTTCT	2	10	241958	241967	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
635	NC_016945	TTAA	2	8	241971	241978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016945	A	6	6	243916	243921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016945	GAAGGA	2	12	243950	243961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016945	TGGC	2	8	247117	247124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_016945	ATT	2	6	247146	247151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016945	ATC	2	6	247197	247202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_016945	TAA	2	6	247218	247223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016945	GTTA	2	8	247291	247298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_016945	A	6	6	291979	291984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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