MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 4213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016944	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016944	CTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016944	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016944	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016944	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016944	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016944	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016944	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016944	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016944	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016944	AGT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016944	ACT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016944	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016944	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016944	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016944	GCT	2	6	13567	13572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016944	GTT	2	6	13672	13677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016944	TTA	2	6	13734	13739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016944	GAG	2	6	14660	14665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016944	CCG	2	6	16607	16612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016944	GGC	2	6	16703	16708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016944	TTG	2	6	16842	16847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016944	TGC	2	6	16860	16865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016944	TTC	2	6	19884	19889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016944	AAT	2	6	19973	19978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016944	GGT	2	6	20068	20073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016944	ATA	2	6	20253	20258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016944	ACC	2	6	21257	21262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016944	GAT	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016944	TGG	2	6	21578	21583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016944	ATT	2	6	21590	21595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016944	AAT	2	6	21597	21602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016944	AGT	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016944	CCT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016944	CAA	2	6	29551	29556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016944	TTC	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016944	CGT	2	6	29794	29799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016944	CAC	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016944	AAC	2	6	35896	35901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016944	TTC	2	6	35916	35921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016944	TAA	2	6	35937	35942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016944	CGC	2	6	35956	35961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016944	GCC	2	6	36092	36097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016944	GTT	2	6	36113	36118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016944	CAG	2	6	36128	36133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016944	ATT	2	6	36135	36140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016944	CAG	2	6	36144	36149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016944	GCG	2	6	36638	36643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016944	GTT	2	6	36681	36686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016944	AAT	2	6	36824	36829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016944	AGG	2	6	36968	36973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016944	TCA	2	6	48254	48259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016944	GCG	2	6	49991	49996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016944	TGA	2	6	50044	50049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016944	GAA	2	6	50050	50055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016944	TAG	2	6	53341	53346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016944	TGA	2	6	53664	53669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016944	GGC	2	6	53853	53858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016944	GCA	2	6	53884	53889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016944	GCG	2	6	53917	53922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016944	CGA	2	6	54092	54097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016944	GAT	2	6	54117	54122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016944	GCA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016944	GAA	2	6	54225	54230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016944	GGT	2	6	54268	54273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016944	AGA	2	6	54308	54313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016944	CAG	2	6	54334	54339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016944	GGT	2	6	54399	54404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016944	GGC	2	6	54545	54550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016944	GAA	2	6	54788	54793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016944	TGC	2	6	54864	54869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016944	GTC	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016944	TGG	2	6	54954	54959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016944	GGA	2	6	54990	54995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016944	GAC	2	6	55003	55008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016944	TCA	2	6	55015	55020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016944	CGT	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016944	AAG	2	6	55246	55251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016944	GGA	2	6	55270	55275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016944	CCT	2	6	55351	55356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016944	TGA	2	6	55373	55378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016944	CCA	2	6	55491	55496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016944	TCA	2	6	55536	55541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016944	ACA	2	6	55580	55585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016944	TTG	2	6	55591	55596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016944	CAA	2	6	55634	55639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016944	GTT	2	6	55745	55750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016944	GAG	2	6	55993	55998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016944	GTA	2	6	56020	56025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016944	GCG	2	6	56026	56031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016944	TCC	2	6	56188	56193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016944	GTG	2	6	56319	56324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016944	GGA	2	6	56496	56501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016944	TAC	2	6	56619	56624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016944	AAC	2	6	56750	56755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016944	AGC	2	6	56839	56844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016944	CAT	2	6	56845	56850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016944	CCT	2	6	57055	57060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016944	ACG	2	6	57287	57292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016944	CTA	2	6	57298	57303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016944	GGT	2	6	57387	57392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016944	TTA	2	6	57544	57549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016944	CGG	2	6	57668	57673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016944	ATG	2	6	57744	57749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016944	TAC	2	6	57842	57847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016944	ACC	2	6	57939	57944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016944	TGG	2	6	57999	58004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016944	TCC	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016944	GGA	2	6	58042	58047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016944	GGT	2	6	58162	58167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016944	CGG	2	6	58249	58254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016944	TCA	2	6	58277	58282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016944	CGT	2	6	58357	58362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016944	GCT	2	6	58411	58416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016944	GTT	2	6	58579	58584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016944	ACA	2	6	58671	58676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016944	TTG	2	6	58751	58756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016944	AGC	2	6	59070	59075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016944	CAG	2	6	59136	59141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016944	TAT	2	6	59277	59282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016944	GAG	2	6	59309	59314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016944	AGA	2	6	59876	59881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016944	TTA	2	6	59902	59907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016944	TTA	2	6	59969	59974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016944	AGC	2	6	66256	66261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016944	ACG	2	6	66282	66287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016944	ACC	2	6	71486	71491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_016944	CAC	2	6	74706	74711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016944	AAT	2	6	74759	74764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016944	TGA	2	6	75245	75250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016944	CAG	2	6	76181	76186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016944	TGA	2	6	76731	76736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016944	GGA	2	6	77393	77398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016944	GCC	2	6	77804	77809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016944	CAA	2	6	80016	80021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016944	CGC	2	6	81630	81635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016944	GCT	2	6	82448	82453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016944	AAG	2	6	86293	86298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016944	TGA	2	6	86359	86364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016944	TGT	2	6	86365	86370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_016944	AAT	2	6	276716	276721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_016944	CTT	2	6	276748	276753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_016944	ATT	2	6	276944	276949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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