MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 1

Total Repeats: 10079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016613	CCT	2	6	3448317	3448322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_016613	TAC	3	9	3448337	3448345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_016613	TAT	2	6	3448457	3448462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_016613	ATGC	2	8	3448468	3448475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_016613	TTTTC	2	10	3448802	3448811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10006	NC_016613	CT	3	6	3448832	3448837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_016613	ACC	2	6	3449154	3449159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_016613	T	6	6	3449195	3449200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_016613	ATA	2	6	3449218	3449223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016613	TGT	2	6	3449272	3449277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_016613	CAT	2	6	3449381	3449386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_016613	AAG	2	6	3449418	3449423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016613	TTTA	2	8	3450900	3450907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016613	AT	3	6	3451921	3451926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016613	TAA	2	6	3453476	3453481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_016613	AT	3	6	3453589	3453594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016613	TTGG	2	8	3453602	3453609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016613	CATT	2	8	3453665	3453672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_016613	ATTG	2	8	3456222	3456229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016613	TA	3	6	3456265	3456270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016613	A	6	6	3456297	3456302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_016613	TG	3	6	3456334	3456339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016613	ACA	2	6	3456378	3456383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_016613	GACA	2	8	3456404	3456411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_016613	ATT	2	6	3456464	3456469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_016613	CG	3	6	3456475	3456480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_016613	A	6	6	3456514	3456519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_016613	T	7	7	3456544	3456550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_016613	GAA	2	6	3456596	3456601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_016613	AGG	2	6	3456660	3456665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_016613	CAA	2	6	3458626	3458631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_016613	AATGGA	2	12	3458639	3458650	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_016613	CAA	2	6	3458668	3458673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_016613	ACT	2	6	3458678	3458683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_016613	CGA	2	6	3458693	3458698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_016613	CAC	2	6	3458714	3458719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_016613	TG	3	6	3458744	3458749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_016613	AAG	2	6	3458766	3458771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016613	A	6	6	3462181	3462186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_016613	T	6	6	3463142	3463147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_016613	T	6	6	3463177	3463182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_016613	AAT	2	6	3463257	3463262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_016613	ACA	2	6	3466204	3466209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_016613	TTAT	2	8	3467641	3467648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016613	CGG	2	6	3467654	3467659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_016613	CTAA	2	8	3467708	3467715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_016613	AAT	2	6	3467717	3467722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_016613	GCC	2	6	3467741	3467746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_016613	CCT	2	6	3468201	3468206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_016613	TGG	2	6	3470538	3470543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016613	GTT	2	6	3473483	3473488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_016613	A	6	6	3473505	3473510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016613	A	7	7	3473514	3473520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016613	CT	3	6	3474769	3474774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_016613	ATT	2	6	3474885	3474890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016613	T	6	6	3477263	3477268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016613	CTT	2	6	3477281	3477286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_016613	TAGAA	2	10	3477299	3477308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016613	AGC	2	6	3477311	3477316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_016613	GCTTC	2	10	3477361	3477370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10061	NC_016613	TTGT	2	8	3477410	3477417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016613	GT	3	6	3477441	3477446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016613	CAG	2	6	3477526	3477531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_016613	GAC	2	6	3477598	3477603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_016613	GCA	2	6	3477604	3477609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016613	CAC	2	6	3477616	3477621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_016613	TTG	2	6	3477654	3477659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016613	T	6	6	3477736	3477741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_016613	CAT	2	6	3477763	3477768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_016613	AACCA	2	10	3477770	3477779	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10071	NC_016613	CG	3	6	3477845	3477850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_016613	TGG	2	6	3477886	3477891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_016613	TCA	2	6	3477897	3477902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_016613	CTT	2	6	3477946	3477951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_016613	CTT	2	6	3478006	3478011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_016613	TTTCG	2	10	3478064	3478073	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10077	NC_016613	TG	3	6	3478138	3478143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_016613	GAAC	2	8	3478164	3478171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_016613	GTTG	2	8	3478229	3478236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.