MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	TCAG	2	8	776	783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016446	ATAG	2	8	1041	1048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016446	CTTG	2	8	1701	1708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016446	TGAA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016446	TACT	2	8	8680	8687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016446	ATGA	2	8	10005	10012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016446	CATG	2	8	11439	11446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016446	TGAC	2	8	15075	15082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016446	TGCT	2	8	15197	15204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016446	GCTC	2	8	16939	16946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016446	TCAA	2	8	17643	17650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016446	CTTA	2	8	19127	19134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016446	CAAT	2	8	24266	24273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016446	AAGG	2	8	26449	26456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016446	CCTT	2	8	26461	26468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016446	TATT	2	8	26622	26629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016446	GAAT	2	8	26633	26640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016446	CTAT	2	8	26797	26804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016446	CTAG	2	8	30996	31003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016446	ATTG	2	8	32748	32755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016446	GTTG	2	8	37201	37208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016446	ATTA	2	8	37326	37333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016446	GTAG	2	8	37451	37458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016446	ATTT	2	8	37581	37588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016446	GGCG	2	8	40346	40353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016446	CAAA	2	8	42410	42417	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016446	GGCG	2	8	42569	42576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016446	TCAG	2	8	42811	42818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016446	GGCG	2	8	43092	43099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016446	CTTT	2	8	43344	43351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016446	GGCG	2	8	43629	43636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016446	GGCG	2	8	44163	44170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016446	AGTT	2	8	44996	45003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016446	GGCG	2	8	47727	47734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016446	GGCG	2	8	48536	48543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016446	GGCG	2	8	49578	49585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016446	GGCG	2	8	50264	50271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016446	GGCG	2	8	50923	50930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016446	GGCG	2	8	51926	51933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016446	GCTT	2	8	52240	52247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016446	GGCG	2	8	52462	52469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016446	GGCG	2	8	53055	53062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016446	TGCA	2	8	53638	53645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016446	TTAC	2	8	54013	54020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016446	TCTG	2	8	54078	54085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016446	GGCG	2	8	54430	54437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016446	TTCA	2	8	54491	54498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016446	GGCG	2	8	54898	54905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016446	GGCG	2	8	56359	56366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016446	TTAC	2	8	56580	56587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016446	TCTG	2	8	56645	56652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016446	GGCG	2	8	56997	57004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016446	GGCG	2	8	57533	57540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016446	GTTT	2	8	59571	59578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016446	GGCG	2	8	61051	61058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016446	GGCG	2	8	62209	62216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016446	GGCG	2	8	62722	62729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016446	TTGT	2	8	62812	62819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016446	TGTC	2	8	63010	63017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016446	GTGA	2	8	63068	63075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016446	GGCG	2	8	63359	63366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016446	GGCG	2	8	64010	64017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016446	GGCG	2	8	66198	66205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016446	GGCG	2	8	68278	68285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016446	GGCG	2	8	69035	69042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016446	GGCG	2	8	69694	69701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016446	ACTA	2	8	69710	69717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016446	GGCG	2	8	70451	70458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016446	AACA	2	8	72267	72274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016446	GGCG	2	8	73591	73598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016446	GGCG	2	8	74126	74133	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016446	GGCG	2	8	74687	74694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016446	GGCG	2	8	75415	75422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016446	GGCG	2	8	76544	76551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016446	GGCG	2	8	77371	77378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016446	TGAT	2	8	77432	77439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016446	GGCG	2	8	77869	77876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016446	GAAA	2	8	81306	81313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016446	TTGC	2	8	81397	81404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016446	ACAG	2	8	81418	81425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016446	ATAA	2	8	81495	81502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016446	CTAA	2	8	83467	83474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016446	GGCG	2	8	83795	83802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016446	GTGA	2	8	85306	85313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016446	GGCG	2	8	85599	85606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016446	GGCG	2	8	86122	86129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016446	CTTT	2	8	86372	86379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016446	GGCG	2	8	86655	86662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016446	GGCG	2	8	87849	87856	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016446	CTTT	2	8	88100	88107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016446	TGCC	2	8	88373	88380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016446	GGCG	2	8	88386	88393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016446	GGCG	2	8	88947	88954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016446	GGCG	2	8	89443	89450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016446	AAAC	2	8	89737	89744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016446	CTTT	2	8	90138	90145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016446	GGCG	2	8	90392	90399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016446	GGCG	2	8	91201	91208	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016446	GGCG	2	8	92589	92596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016446	TTGT	2	8	92679	92686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016446	TGTC	2	8	92877	92884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016446	GGCG	2	8	93226	93233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016446	TTGT	2	8	93258	93265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016446	TGTC	2	8	93513	93520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016446	GGCG	2	8	93862	93869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016446	GGCG	2	8	94382	94389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016446	TCCT	2	8	94408	94415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016446	CTTT	2	8	95455	95462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016446	TGCT	2	8	95548	95555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016446	CAAA	2	8	95581	95588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016446	GGCG	2	8	95739	95746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016446	GGCG	2	8	96898	96905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016446	GGCG	2	8	97497	97504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016446	GGCG	2	8	99157	99164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016446	GGCG	2	8	100532	100539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016446	TAAA	2	8	100607	100614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016446	GGCG	2	8	101712	101719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016446	TATG	2	8	101776	101783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016446	GGCG	2	8	102446	102453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016446	GGCG	2	8	103007	103014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016446	GGCG	2	8	103678	103685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016446	AACA	2	8	105527	105534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016446	ATTA	2	8	106745	106752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016446	GGCG	2	8	106915	106922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016446	GGCG	2	8	107630	107637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016446	GGCG	2	8	108164	108171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016446	GGCG	2	8	111254	111261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016446	TTGT	2	8	111344	111351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016446	TTAC	2	8	111475	111482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016446	GGCG	2	8	111893	111900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016446	AATA	2	8	112095	112102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016446	GGCG	2	8	112340	112347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016446	CTTT	2	8	112591	112598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016446	GGCG	2	8	112876	112883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016446	GGCG	2	8	113411	113418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016446	AGAT	2	8	113676	113683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016446	GGCG	2	8	113879	113886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016446	TCAG	2	8	114121	114128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016446	GGCG	2	8	114403	114410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016446	GGCG	2	8	114912	114919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016446	GGCG	2	8	115422	115429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016446	GGCG	2	8	116232	116239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016446	GGCG	2	8	116818	116825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016446	ATAA	2	8	116854	116861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016446	GGCG	2	8	118605	118612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016446	GGCG	2	8	120446	120453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016446	GGCG	2	8	121187	121194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016446	GGCG	2	8	121761	121768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016446	TCTA	2	8	121775	121782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016446	CAAA	2	8	122136	122143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016446	GGCG	2	8	122295	122302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016446	GGCG	2	8	124113	124120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016446	GGCG	2	8	124542	124549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016446	GGCG	2	8	126843	126850	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_016446	GGCG	2	8	127982	127989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016446	TATT	2	8	128185	128192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016446	GGCG	2	8	128522	128529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
158	NC_016446	TAAG	2	8	128854	128861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016446	GGCG	2	8	129704	129711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
160	NC_016446	GGCG	2	8	131500	131507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_016446	GGCG	2	8	132477	132484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_016446	CTAG	2	8	155215	155222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_016446	TTAT	2	8	157552	157559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016446	GATT	2	8	161550	161557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016446	TGGA	2	8	161699	161706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016446	GCTT	2	8	177102	177109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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199	NC_016446	TTCA	2	8	217664	217671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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265	NC_016446	CTAA	2	8	438439	438446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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