MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 2876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016446	CA	3	6	472737	472742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_016446	TTAA	2	8	472794	472801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016446	GTT	2	6	472827	472832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016446	TGAA	2	8	472835	472842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016446	T	6	6	472889	472894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016446	AAC	2	6	472909	472914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016446	CCTA	2	8	474113	474120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_016446	TCAA	2	8	474151	474158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_016446	AAT	2	6	474176	474181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016446	AAG	2	6	477541	477546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016446	AATG	2	8	477618	477625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016446	AAC	2	6	477653	477658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016446	GGC	2	6	477674	477679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016446	GA	3	6	477684	477689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016446	ATAG	2	8	477702	477709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016446	GAAC	2	8	477726	477733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_016446	A	6	6	477784	477789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016446	CTT	2	6	478435	478440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016446	TGC	2	6	478453	478458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016446	GCA	2	6	478559	478564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016446	TAT	2	6	478579	478584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016446	TCC	3	9	479496	479504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_016446	ATTA	2	8	479553	479560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016446	TATT	2	8	479578	479585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016446	TCG	2	6	479613	479618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_016446	GCG	2	6	479659	479664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_016446	CCTA	2	8	481589	481596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_016446	TGC	2	6	482271	482276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_016446	AGA	2	6	483720	483725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016446	GA	3	6	483731	483736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016446	AG	3	6	483787	483792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016446	A	6	6	484310	484315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016446	CTAAGC	2	12	484326	484337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016446	GCA	2	6	484361	484366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016446	CTA	2	6	484373	484378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016446	CTG	2	6	484411	484416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016446	TTA	2	6	484536	484541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016446	CTG	2	6	484654	484659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016446	TTA	2	6	484712	484717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016446	AAAT	2	8	484749	484756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016446	ACAAA	2	10	484770	484779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_016446	AAG	2	6	484855	484860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016446	AG	3	6	484952	484957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016446	GAAT	2	8	485098	485105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016446	AAC	2	6	485110	485115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016446	AAC	2	6	485623	485628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016446	A	6	6	485870	485875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016446	TCA	2	6	485964	485969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016446	ACT	2	6	485975	485980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016446	AT	3	6	485989	485994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016446	ATT	2	6	486001	486006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016446	TGC	3	9	486200	486208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016446	GT	3	6	486258	486263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016446	AAT	2	6	486269	486274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016446	AAC	2	6	487869	487874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016446	TGC	2	6	487884	487889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_016446	GGA	2	6	488078	488083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016446	AATGA	2	10	488352	488361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016446	GAGC	2	8	489001	489008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_016446	TTGA	2	8	489070	489077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016446	GGTA	2	8	490419	490426	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016446	AAG	2	6	490432	490437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016446	AGGAA	2	10	491472	491481	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016446	GAA	2	6	491504	491509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016446	A	6	6	491508	491513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016446	AGA	2	6	491523	491528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016446	TGA	2	6	491535	491540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016446	AAT	2	6	501375	501380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016446	TAA	2	6	501384	501389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016446	AAG	2	6	501444	501449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016446	ACT	2	6	501531	501536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1573	NC_016446	GA	3	6	501623	501628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016446	AGGC	2	8	501634	501641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_016446	CTT	2	6	502447	502452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016446	TA	3	6	502459	502464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016446	TTG	2	6	502544	502549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016446	TTA	2	6	502576	502581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016446	GGC	2	6	509628	509633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_016446	AAT	2	6	509781	509786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016446	AAG	2	6	509787	509792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016446	CTC	2	6	511937	511942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_016446	ATC	2	6	511957	511962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016446	ACTG	2	8	511974	511981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1587	NC_016446	AAT	2	6	512075	512080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016446	A	6	6	512271	512276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016446	CAATAA	2	12	512288	512299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1591	NC_016446	TGC	2	6	512352	512357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_016446	T	6	6	516110	516115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016446	A	6	6	516125	516130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016446	TAA	2	6	516207	516212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016446	ATAA	2	8	516221	516228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016446	TTA	2	6	516243	516248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016446	AAC	2	6	516275	516280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_016446	TGC	2	6	516456	516461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_016446	GGT	2	6	516466	516471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016446	TTG	2	6	516485	516490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016446	AAC	2	6	517840	517845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_016446	AGGT	2	8	517873	517880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016446	ACGT	2	8	520017	520024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_016446	ATG	2	6	520075	520080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016446	A	7	7	520094	520100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016446	T	6	6	520805	520810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016446	TGT	2	6	520820	520825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016446	GC	3	6	520838	520843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_016446	CA	3	6	520851	520856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_016446	CA	3	6	520862	520867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_016446	CAT	2	6	520889	520894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016446	TAA	2	6	520905	520910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016446	TTC	2	6	520955	520960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_016446	ATGA	2	8	521352	521359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016446	CAA	2	6	521363	521368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016446	AGT	2	6	521493	521498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016446	A	6	6	521507	521512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016446	AT	3	6	521519	521524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016446	TACT	2	8	521565	521572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_016446	TTAA	2	8	521722	521729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016446	CT	3	6	522734	522739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_016446	ACG	2	6	522741	522746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_016446	AAG	2	6	522748	522753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016446	CAGT	2	8	522883	522890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_016446	GGAT	2	8	522892	522899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016446	T	6	6	522929	522934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016446	TCG	2	6	524366	524371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016446	ACC	2	6	524374	524379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_016446	T	6	6	524394	524399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016446	GA	3	6	526076	526081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016446	CAAT	2	8	527547	527554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_016446	CA	3	6	527560	527565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1913	NC_016446	A	6	6	613826	613831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_016446	ATT	2	6	614790	614795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_016446	ATC	2	6	614909	614914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1920	NC_016446	TCA	2	6	616569	616574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1922	NC_016446	CTGT	2	8	617885	617892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1923	NC_016446	ATCA	2	8	617894	617901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1934	NC_016446	TTC	2	6	620202	620207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1937	NC_016446	TTG	2	6	622293	622298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_016446	GCC	2	6	627126	627131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1948	NC_016446	TGC	2	6	627177	627182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1954	NC_016446	ATT	2	6	631463	631468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_016446	A	6	6	631482	631487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_016446	AAC	2	6	631513	631518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1957	NC_016446	A	6	6	631533	631538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_016446	CAA	2	6	631540	631545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_016446	GAGC	2	8	633348	633355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2000	NC_016446	ATG	2	6	658425	658430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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