MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 2876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016446	GGCG	2	8	92589	92596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
502	NC_016446	CAG	2	6	92618	92623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016446	TTGT	2	8	92679	92686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016446	T	6	6	92748	92753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016446	CT	3	6	92777	92782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_016446	TGTC	2	8	92877	92884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_016446	TG	3	6	92929	92934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016446	TTGAT	2	10	93077	93086	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016446	GGT	2	6	93173	93178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016446	GTT	2	6	93183	93188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016446	GGCG	2	8	93226	93233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
512	NC_016446	TTGT	2	8	93258	93265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016446	CGC	2	6	93320	93325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_016446	GTT	2	6	93384	93389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016446	TGTC	2	8	93513	93520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_016446	TG	3	6	93565	93570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016446	GTG	2	6	93807	93812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016446	GTT	2	6	93819	93824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016446	GGCG	2	8	93862	93869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
520	NC_016446	CTT	2	6	93874	93879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016446	CAG	2	6	94001	94006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016446	ATC	2	6	94024	94029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016446	TGT	2	6	94047	94052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016446	CAT	2	6	94092	94097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016446	GGT	2	6	94328	94333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016446	TTG	2	6	94339	94344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016446	GGCG	2	8	94382	94389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
528	NC_016446	TCCT	2	8	94408	94415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_016446	TGA	3	9	95166	95174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016446	CTT	2	6	95227	95232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016446	GTT	2	6	95391	95396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016446	TGC	2	6	95431	95436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016446	ATC	2	6	95437	95442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016446	CTTT	2	8	95455	95462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_016446	TGCT	2	8	95548	95555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_016446	CAAA	2	8	95581	95588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_016446	GGT	2	6	95685	95690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016446	GTT	2	6	95695	95700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016446	TAG	2	6	95712	95717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016446	GGCG	2	8	95739	95746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
541	NC_016446	GGA	2	6	95769	95774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016446	GGT	2	6	96844	96849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016446	GGCG	2	8	96898	96905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
544	NC_016446	GGT	2	6	97443	97448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016446	GTT	2	6	97472	97477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016446	GGCG	2	8	97497	97504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
547	NC_016446	TAT	2	6	98475	98480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016446	TAG	3	9	98518	98526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016446	GGT	2	6	99103	99108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016446	TGT	3	9	99112	99120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016446	GGCG	2	8	99157	99164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
552	NC_016446	GGCG	2	8	100532	100539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
553	NC_016446	TAAA	2	8	100607	100614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016446	TGA	2	6	100826	100831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016446	GGT	2	6	101659	101664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016446	GTT	2	6	101669	101674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016446	GGCG	2	8	101712	101719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
558	NC_016446	GT	3	6	101724	101729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016446	TTG	2	6	101754	101759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016446	TATG	2	8	101776	101783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016446	TAA	2	6	101839	101844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016446	AAG	2	6	102348	102353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016446	GGT	2	6	102393	102398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016446	GTT	2	6	102403	102408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016446	GTG	2	6	102422	102427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016446	GGCG	2	8	102446	102453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
567	NC_016446	CG	3	6	102923	102928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_016446	GGT	2	6	102953	102958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016446	GTT	2	6	102963	102968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_016446	GGT	2	6	103624	103629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016446	GTT	2	6	103634	103639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016446	GGCG	2	8	103678	103685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
574	NC_016446	TGT	2	6	104768	104773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016446	AAC	2	6	104797	104802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016446	AAT	2	6	104844	104849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016446	AAT	2	6	105337	105342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016446	AT	3	6	105344	105349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016446	ACTTC	2	10	105365	105374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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581	NC_016446	TAT	2	6	105428	105433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016446	TAG	2	6	105483	105488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016446	AACA	2	8	105527	105534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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585	NC_016446	TG	3	6	105613	105618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016446	GTA	2	6	106559	106564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016446	ATTA	2	8	106745	106752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016446	GTG	2	6	106860	106865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016446	GTT	2	6	106872	106877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_016446	GGT	2	6	107577	107582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016446	GTT	2	6	107587	107592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016446	GGCG	2	8	107630	107637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
594	NC_016446	CTT	2	6	107642	107647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016446	ATC	2	6	107658	107663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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597	NC_016446	CAA	2	6	107795	107800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016446	GGT	2	6	108110	108115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016446	GTT	2	6	108120	108125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_016446	GTT	2	6	108185	108190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016446	ATA	2	6	110066	110071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016446	GGT	2	6	111201	111206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016446	GTT	2	6	111211	111216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016446	GGCG	2	8	111254	111261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016446	TTGT	2	8	111344	111351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016446	CT	3	6	111442	111447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_016446	TTAC	2	8	111475	111482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_016446	TGT	2	6	111597	111602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016446	GGT	2	6	111839	111844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016446	GTT	2	6	111849	111854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016446	GGCG	2	8	111893	111900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
613	NC_016446	AATA	2	8	112095	112102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016446	TC	3	6	112170	112175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_016446	TGT	2	6	112196	112201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016446	TTA	2	6	112219	112224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016446	GGT	2	6	112286	112291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016446	GTT	2	6	112296	112301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016446	GTG	3	9	112315	112323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016446	GGCG	2	8	112340	112347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
621	NC_016446	CTT	2	6	112352	112357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016446	ATC	2	6	112368	112373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016446	CTT	2	6	112384	112389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016446	CAA	2	6	112505	112510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016446	GTT	2	6	112527	112532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016446	AGC	2	6	112567	112572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016446	CTTT	2	8	112591	112598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_016446	GT	3	6	112680	112685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016446	GGT	2	6	112822	112827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016446	GTT	2	6	112832	112837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016446	GTTTGG	2	12	112840	112851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016446	GGCG	2	8	112876	112883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016446	CG	3	6	113327	113332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_016446	GGT	2	6	113357	113362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016446	GTT	2	6	113367	113372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016446	GGCG	2	8	113411	113418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
637	NC_016446	CT	3	6	113423	113428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_016446	T	8	8	113474	113481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016446	GAA	2	6	113532	113537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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