MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 6781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016445	TG	3	6	1923039	1923044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016445	ATC	2	6	1924224	1924229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_016445	CAA	2	6	1925681	1925686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016445	ACTC	2	8	1927666	1927673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_016445	TCG	2	6	1927713	1927718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_016445	TCAC	2	8	1927720	1927727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_016445	CTT	2	6	1927885	1927890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_016445	TTA	2	6	1927917	1927922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016445	CAG	2	6	1928916	1928921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4012	NC_016445	A	6	6	1934837	1934842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016445	ATT	2	6	1934855	1934860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016445	GCC	2	6	1936649	1936654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_016445	TCTA	2	8	1942429	1942436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_016445	GGC	2	6	1942538	1942543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016445	GC	3	6	1942554	1942559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_016445	TGC	2	6	1946137	1946142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016445	TCA	2	6	1946148	1946153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4021	NC_016445	AT	3	6	1946215	1946220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016445	AAC	2	6	1946226	1946231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_016445	AAC	2	6	1946244	1946249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016445	GGC	2	6	1946265	1946270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4026	NC_016445	GAAC	2	8	1946317	1946324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4029	NC_016445	ATT	2	6	1947404	1947409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_016445	AAT	2	6	1952753	1952758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016445	ATA	2	6	1952786	1952791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_016445	CAGG	2	8	1965487	1965494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_016445	TTAC	2	8	1965517	1965524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4101	NC_016445	AG	3	6	1979948	1979953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016445	TCA	2	6	1979988	1979993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4105	NC_016445	ATT	2	6	1981851	1981856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_016445	A	7	7	1981900	1981906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016445	TGA	2	6	1983403	1983408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_016445	T	6	6	1983529	1983534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016445	TTA	2	6	1983622	1983627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016445	CAA	2	6	1983632	1983637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016445	CAAA	2	8	1983652	1983659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_016445	CA	3	6	1983681	1983686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4117	NC_016445	TTG	2	6	1983716	1983721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016445	GCA	2	6	1983751	1983756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016445	TGTT	2	8	1983803	1983810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016445	A	6	6	1983816	1983821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016445	CAAC	2	8	1983822	1983829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_016445	A	6	6	1983847	1983852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016445	A	7	7	1983870	1983876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016445	T	6	6	1983902	1983907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016445	AG	3	6	1984035	1984040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016445	ATG	2	6	1984051	1984056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016445	ACA	2	6	1984057	1984062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_016445	CAA	2	6	1984267	1984272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016445	TGT	2	6	1984293	1984298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016445	AT	3	6	1985001	1985006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016445	A	6	6	1985025	1985030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016445	AG	4	8	1985850	1985857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016445	GAT	2	6	1985925	1985930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4135	NC_016445	GCG	2	6	1985972	1985977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_016445	CTT	2	6	1986028	1986033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_016445	CTT	2	6	1986959	1986964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_016445	TTG	2	6	1986966	1986971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_016445	GTA	2	6	1987051	1987056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4144	NC_016445	ATT	2	6	1987090	1987095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4150	NC_016445	CAA	2	6	1987239	1987244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4154	NC_016445	T	6	6	1992532	1992537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_016445	CAG	2	6	1992553	1992558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4167	NC_016445	ATGT	2	8	1992973	1992980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_016445	TCTG	2	8	2034149	2034156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_016445	TAT	2	6	2034161	2034166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016445	TTCT	2	8	2034172	2034179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_016445	ATTT	2	8	2035117	2035124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_016445	CGGC	2	8	2035137	2035144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4256	NC_016445	ACCG	2	8	2035150	2035157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_016445	TC	3	6	2036420	2036425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_016445	A	6	6	2050830	2050835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_016445	CCA	2	6	2050837	2050842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_016445	ATG	2	6	2050855	2050860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016445	GTA	2	6	2050914	2050919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_016445	TCAC	2	8	2050941	2050948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_016445	CCT	2	6	2050969	2050974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4265	NC_016445	CGG	2	6	2051116	2051121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_016445	CT	3	6	2051126	2051131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4267	NC_016445	C	6	6	2051155	2051160	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4268	NC_016445	TCC	2	6	2051200	2051205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4272	NC_016445	AACCA	2	10	2051424	2051433	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4273	NC_016445	TCTA	2	8	2052917	2052924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4279	NC_016445	CAA	2	6	2058677	2058682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4280	NC_016445	GAA	2	6	2058781	2058786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4282	NC_016445	T	6	6	2058822	2058827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4296	NC_016445	GGGA	2	8	2065286	2065293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_016445	CCCT	2	8	2065319	2065326	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4298	NC_016445	AGGG	2	8	2065342	2065349	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_016445	GGC	2	6	2065992	2065997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4301	NC_016445	GAAC	2	8	2066040	2066047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4302	NC_016445	GCCA	2	8	2066149	2066156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4303	NC_016445	GGTTT	2	10	2066169	2066178	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4309	NC_016445	C	6	6	2067283	2067288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4310	NC_016445	GGA	2	6	2067337	2067342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4339	NC_016445	GAAC	2	8	2088095	2088102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4340	NC_016445	AAGG	2	8	2088129	2088136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4381	NC_016445	AAC	2	6	2120335	2120340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4382	NC_016445	CT	3	6	2122016	2122021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4383	NC_016445	TGCCC	2	10	2122148	2122157	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4384	NC_016445	CACCAA	2	12	2122329	2122340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_016445	AGA	2	6	2122347	2122352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_016445	ATC	2	6	2122396	2122401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4388	NC_016445	TTTG	2	8	2122715	2122722	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_016445	CAGA	2	8	2122744	2122751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4390	NC_016445	A	6	6	2122790	2122795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_016445	T	6	6	2122822	2122827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_016445	GTG	2	6	2122833	2122838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_016445	AAC	2	6	2122839	2122844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4394	NC_016445	TCAT	2	8	2123820	2123827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4395	NC_016445	TCA	2	6	2123872	2123877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_016445	AC	3	6	2123902	2123907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4397	NC_016445	CAAA	2	8	2123940	2123947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4398	NC_016445	TTAT	2	8	2123955	2123962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_016445	ATTAA	2	10	2123972	2123981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4433	NC_016445	A	6	6	2136241	2136246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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