MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 6781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016445	CTAT	2	8	1424767	1424774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_016445	ATC	2	6	1424837	1424842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_016445	CGC	2	6	1425567	1425572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_016445	AT	3	6	1425606	1425611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016445	AGG	2	6	1425634	1425639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016445	CT	3	6	1426092	1426097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_016445	CAT	2	6	1426166	1426171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016445	TCA	2	6	1428534	1428539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016445	GCC	2	6	1428592	1428597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_016445	GT	3	6	1430389	1430394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016445	CAT	2	6	1430423	1430428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016445	AAC	2	6	1430497	1430502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016445	GTTA	2	8	1432280	1432287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016445	GAAC	2	8	1432324	1432331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_016445	AAG	2	6	1432355	1432360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016445	AT	3	6	1432366	1432371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016445	TG	3	6	1432396	1432401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016445	AGTG	2	8	1432414	1432421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016445	ATT	2	6	1432423	1432428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016445	TCA	2	6	1432469	1432474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_016445	CTC	2	6	1434363	1434368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_016445	TGT	2	6	1436311	1436316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016445	CGC	2	6	1436482	1436487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_016445	TTA	2	6	1438459	1438464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3028	NC_016445	ATA	2	6	1438592	1438597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3031	NC_016445	A	7	7	1438749	1438755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016445	ATAAAA	2	12	1438774	1438785	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3035	NC_016445	AT	3	6	1442573	1442578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016445	TAAA	2	8	1442697	1442704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016445	A	6	6	1442702	1442707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016445	A	7	7	1442710	1442716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016445	GAAAG	2	10	1442859	1442868	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016445	GAAG	2	8	1442872	1442879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016445	ATT	2	6	1445107	1445112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016445	T	6	6	1445111	1445116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016445	ATT	2	6	1445137	1445142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016445	CTTT	2	8	1445151	1445158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_016445	AG	3	6	1445232	1445237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_016445	ACAG	2	8	1445943	1445950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_016445	CAG	2	6	1447067	1447072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_016445	ATGA	2	8	1447122	1447129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016445	CCTTC	2	10	1449877	1449886	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3059	NC_016445	A	7	7	1455898	1455904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016445	A	8	8	1455922	1455929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016445	TGT	2	6	1455932	1455937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3063	NC_016445	TAA	2	6	1456086	1456091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3065	NC_016445	GCAA	2	8	1456120	1456127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3067	NC_016445	A	6	6	1456199	1456204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_016445	AGGAA	2	10	1456220	1456229	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016445	A	6	6	1456253	1456258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3075	NC_016445	AG	3	6	1458638	1458643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016445	TTG	2	6	1458667	1458672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_016445	A	9	9	1465311	1465319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016445	A	7	7	1465325	1465331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016445	ATTT	2	8	1465360	1465367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016445	T	7	7	1465373	1465379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_016445	TA	3	6	1465514	1465519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016445	T	6	6	1465520	1465525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016445	AAAT	2	8	1465534	1465541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_016445	TTG	2	6	1471575	1471580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_016445	AAG	2	6	1474090	1474095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3106	NC_016445	T	7	7	1474921	1474927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3110	NC_016445	ATT	2	6	1475917	1475922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016445	CA	3	6	1475959	1475964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3115	NC_016445	TAA	2	6	1476255	1476260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016445	A	6	6	1476274	1476279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_016445	GATCAA	2	12	1476357	1476368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3122	NC_016445	TTAC	2	8	1476519	1476526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_016445	T	6	6	1478144	1478149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016445	T	6	6	1478327	1478332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016445	AGGT	2	8	1478343	1478350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016445	ATTT	2	8	1480695	1480702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016445	TTC	2	6	1480726	1480731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016445	CTA	2	6	1480733	1480738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_016445	CACTG	2	10	1483723	1483732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_016445	ACA	2	6	1483757	1483762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016445	ATTG	2	8	1483830	1483837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016445	AG	3	6	1483848	1483853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016445	GAA	2	6	1483887	1483892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_016445	T	7	7	1484815	1484821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_016445	TTCA	2	8	1540303	1540310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3257	NC_016445	TTG	2	6	1540666	1540671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_016445	CTAA	2	8	1543175	1543182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_016445	A	8	8	1543202	1543209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_016445	CCT	2	6	1543224	1543229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_016445	T	6	6	1543235	1543240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_016445	TCAA	2	8	1544581	1544588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3264	NC_016445	AAAT	2	8	1545254	1545261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3266	NC_016445	GAT	2	6	1545300	1545305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_016445	ACG	2	6	1546697	1546702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3268	NC_016445	TTGTG	2	10	1546716	1546725	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_016445	A	7	7	1550333	1550339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_016445	TTGG	2	8	1553501	1553508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3274	NC_016445	CATA	2	8	1553706	1553713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3282	NC_016445	CTCA	2	8	1555725	1555732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3301	NC_016445	ATCTC	2	10	1564887	1564896	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3302	NC_016445	CATG	2	8	1565951	1565958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3392	NC_016445	TCT	2	6	1612097	1612102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3395	NC_016445	CTAC	2	8	1615099	1615106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3397	NC_016445	ATTA	2	8	1615168	1615175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3398	NC_016445	CAG	2	6	1616177	1616182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3399	NC_016445	CAA	2	6	1616235	1616240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3400	NC_016445	CTT	2	6	1618258	1618263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3401	NC_016445	TTG	2	6	1618362	1618367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_016445	AAG	2	6	1620363	1620368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_016445	CGC	2	6	1620403	1620408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3404	NC_016445	AGA	2	6	1621463	1621468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_016445	ATT	2	6	1621530	1621535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3406	NC_016445	TAAA	2	8	1621905	1621912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3412	NC_016445	T	8	8	1623555	1623562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3413	NC_016445	TAC	2	6	1623622	1623627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3420	NC_016445	AGTG	2	8	1626018	1626025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3424	NC_016445	TTGA	2	8	1627281	1627288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_016445	TTGC	2	8	1629156	1629163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3431	NC_016445	T	6	6	1629200	1629205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_016445	TGA	2	6	1629232	1629237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_016445	GA	3	6	1629243	1629248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_016445	TAAATG	2	12	1630676	1630687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3441	NC_016445	AACAG	2	10	1632147	1632156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3442	NC_016445	ATA	2	6	1632168	1632173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3460	NC_016445	AACT	2	8	1636235	1636242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3476	NC_016445	CGCT	2	8	1639897	1639904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3498	NC_016445	TTG	2	6	1652429	1652434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_016445	T	6	6	1652436	1652441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_016445	AAT	2	6	1652455	1652460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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