MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 6781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016445	GCG	2	6	425007	425012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016445	GC	3	6	426911	426916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_016445	GTT	2	6	427828	427833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016445	T	6	6	428094	428099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016445	CTTA	2	8	428104	428111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_016445	T	6	6	428185	428190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016445	A	6	6	428213	428218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016445	GAG	2	6	428395	428400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016445	CGTT	2	8	430185	430192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016445	TCTA	2	8	430209	430216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_016445	ACTC	2	8	430228	430235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_016445	GCC	2	6	430240	430245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_016445	AGT	2	6	430260	430265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016445	TA	3	6	430271	430276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016445	A	6	6	430294	430299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016445	T	6	6	430320	430325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016445	CAG	2	6	431957	431962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016445	T	7	7	431970	431976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016445	CT	3	6	432138	432143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_016445	GCC	2	6	432145	432150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_016445	TA	3	6	432176	432181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016445	CAA	2	6	432369	432374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_016445	GCC	2	6	432413	432418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_016445	A	7	7	432485	432491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016445	TGT	2	6	433848	433853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016445	CGA	2	6	434726	434731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016445	TCC	2	6	436126	436131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_016445	ATG	2	6	436162	436167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016445	G	7	7	436213	436219	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016445	AT	3	6	436231	436236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016445	ACA	2	6	437909	437914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_016445	TATT	2	8	437945	437952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016445	ATA	2	6	437962	437967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016445	GCA	2	6	438010	438015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016445	CCAGTG	2	12	441184	441195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016445	GGC	2	6	441206	441211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016445	GAT	2	6	441228	441233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016445	TAA	2	6	442626	442631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016445	A	6	6	442630	442635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016445	A	6	6	443520	443525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016445	TTTTG	2	10	443529	443538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016445	AAT	2	6	445268	445273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016445	AGA	2	6	445375	445380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016445	TTA	2	6	445386	445391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016445	A	7	7	445402	445408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016445	TGA	2	6	445418	445423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016445	A	7	7	445423	445429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016445	AAT	2	6	445440	445445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016445	TTCT	2	8	447058	447065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_016445	CTC	2	6	447088	447093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_016445	CT	3	6	447128	447133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_016445	TAC	2	6	447137	447142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016445	ATAA	2	8	447156	447163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016445	TGC	2	6	447263	447268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016445	ATA	2	6	447273	447278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016445	GAG	2	6	448739	448744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016445	T	7	7	448781	448787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016445	AGT	2	6	448799	448804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016445	TCG	2	6	450519	450524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016445	T	6	6	450529	450534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016445	GGGT	2	8	450571	450578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016445	ATT	2	6	450591	450596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016445	A	6	6	450637	450642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016445	TGG	2	6	450672	450677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016445	T	7	7	450860	450866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016445	ATG	2	6	450882	450887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016445	AAT	2	6	450908	450913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016445	GCT	2	6	450925	450930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_016445	T	6	6	451019	451024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016445	CTG	2	6	455253	455258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016445	ATGG	2	8	455261	455268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016445	TTG	2	6	455272	455277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016445	ATCC	2	8	455288	455295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_016445	T	6	6	455297	455302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016445	TATCCT	2	12	455310	455321	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016445	TGA	2	6	455347	455352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016445	ACC	2	6	455367	455372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_016445	TTA	2	6	455424	455429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016445	TAT	2	6	455447	455452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016445	TAATAC	2	12	455473	455484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1081	NC_016445	AATA	2	8	455485	455492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016445	ACT	2	6	455495	455500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016445	TAAT	2	8	455522	455529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016445	GACA	2	8	455547	455554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_016445	GT	3	6	455667	455672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016445	ATT	2	6	455706	455711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016445	GT	3	6	456153	456158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016445	AAG	2	6	456236	456241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016445	ACG	2	6	456276	456281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016445	ATA	2	6	456289	456294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016445	ACAT	2	8	456300	456307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_016445	ACA	3	9	456335	456343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_016445	AAT	2	6	456347	456352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016445	T	6	6	456427	456432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016445	TCA	2	6	457571	457576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_016445	A	6	6	467925	467930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016445	T	7	7	467979	467985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016445	ATT	2	6	467989	467994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016445	TAA	2	6	468043	468048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016445	GTAT	2	8	468946	468953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016445	A	6	6	468954	468959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016445	ATG	2	6	469002	469007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016445	TGA	2	6	469008	469013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016445	G	8	8	469023	469030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016445	GAT	2	6	469060	469065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016445	TTC	3	9	469069	469077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_016445	TCAC	2	8	469081	469088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_016445	TC	5	10	469091	469100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_016445	TA	3	6	469125	469130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016445	ATTGA	2	10	470331	470340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016445	CTT	2	6	470368	470373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016445	AAAGAG	2	12	470377	470388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016445	GTT	2	6	470498	470503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016445	ATA	2	6	470540	470545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016445	T	7	7	473548	473554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016445	TCA	2	6	473609	473614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016445	GA	3	6	475029	475034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016445	GCCAT	2	10	475053	475062	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_016445	CT	3	6	475625	475630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_016445	A	6	6	475702	475707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016445	CAAT	2	8	475710	475717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_016445	ATT	2	6	475781	475786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016445	AAT	2	6	475831	475836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016445	T	6	6	475840	475845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016445	AAT	2	6	475858	475863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016445	TTATTT	2	12	475894	475905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016445	TTTA	2	8	475923	475930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016445	CAT	2	6	475954	475959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016445	TGG	2	6	475985	475990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016445	TAA	2	6	475992	475997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016445	GTTT	2	8	476027	476034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016445	TATT	2	8	476037	476044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016445	T	7	7	476043	476049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016445	GTT	2	6	476084	476089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016445	TCA	2	6	476101	476106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_016445	T	6	6	476109	476114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016445	A	6	6	476173	476178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016445	ATT	2	6	476196	476201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_016445	TAAT	2	8	597119	597126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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