MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 6781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016445	CGG	2	6	244122	244127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016445	ATG	2	6	244198	244203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016445	TGAAAT	2	12	244231	244242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016445	TAC	2	6	244296	244301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016445	ACC	2	6	244393	244398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_016445	TGG	2	6	244453	244458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016445	TCC	2	6	244479	244484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_016445	GGA	2	6	244496	244501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016445	GGT	2	6	244616	244621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016445	CGG	2	6	244703	244708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016445	TCA	2	6	244731	244736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016445	CGT	2	6	244811	244816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016445	GCT	2	6	244865	244870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016445	GTT	2	6	245033	245038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016445	GT	3	6	245064	245069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016445	ACA	2	6	245125	245130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016445	TG	4	8	245174	245181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016445	TTG	2	6	245205	245210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016445	GAAAC	2	10	245307	245316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_016445	TTG	2	6	245376	245381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016445	A	7	7	245412	245418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016445	AGCGG	2	10	245442	245451	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
523	NC_016445	TCCGC	2	10	245510	245519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
524	NC_016445	TTA	2	6	245523	245528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016445	T	9	9	245551	245559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016445	CT	3	6	245602	245607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_016445	CTT	2	6	245615	245620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016445	T	6	6	245650	245655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016445	GCTG	2	8	245677	245684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
530	NC_016445	ATG	2	6	245687	245692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016445	A	6	6	245695	245700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016445	ACC	2	6	248503	248508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016445	CAC	2	6	248571	248576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_016445	GGT	2	6	248591	248596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016445	A	7	7	249598	249604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016445	GTT	2	6	249620	249625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016445	CTTTG	2	10	249627	249636	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
538	NC_016445	AT	3	6	249651	249656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016445	TTTG	2	8	249684	249691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016445	TGA	2	6	252752	252757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016445	TCA	2	6	256439	256444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016445	GTT	2	6	256509	256514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016445	GCG	2	6	262025	262030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016445	AGC	2	6	262052	262057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016445	GTAG	2	8	262073	262080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016445	TC	3	6	262867	262872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_016445	GCG	2	6	262901	262906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016445	GAT	2	6	262920	262925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016445	CGTT	2	8	262969	262976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_016445	GCC	2	6	263024	263029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_016445	AGC	2	6	263869	263874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016445	AGG	2	6	263957	263962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016445	CTG	2	6	263975	263980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016445	GAA	2	6	264040	264045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016445	TGA	2	6	264078	264083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016445	CTT	2	6	264089	264094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016445	TAT	2	6	264121	264126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016445	ACC	2	6	264132	264137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016445	GAG	2	6	264841	264846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016445	A	6	6	264872	264877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016445	AATT	2	8	264880	264887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016445	A	6	6	264903	264908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016445	AGT	2	6	264930	264935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016445	ATG	2	6	264947	264952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016445	TGA	2	6	264969	264974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016445	T	6	6	265982	265987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016445	TGG	2	6	266014	266019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016445	TTG	2	6	266296	266301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016445	GTT	2	6	266329	266334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016445	AAT	2	6	266414	266419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016445	AAGG	2	8	266466	266473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016445	CCA	2	6	269568	269573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_016445	GGC	2	6	269589	269594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016445	GCC	2	6	269601	269606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_016445	T	6	6	269607	269612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016445	GCCGA	2	10	269678	269687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_016445	GAAT	2	8	269688	269695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016445	TA	3	6	270391	270396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016445	GC	3	6	270400	270405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_016445	CGA	2	6	270418	270423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016445	AAGA	2	8	270440	270447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016445	TTG	2	6	271633	271638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016445	CTG	2	6	271665	271670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016445	ACA	2	6	272954	272959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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586	NC_016445	A	6	6	276173	276178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_016445	TGAT	2	8	276226	276233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016445	A	8	8	276265	276272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016445	GCGG	2	8	277157	277164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
592	NC_016445	A	6	6	277184	277189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016445	T	6	6	277201	277206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016445	GTT	2	6	277216	277221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016445	TTTG	2	8	277277	277284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016445	AAAT	2	8	278076	278083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016445	AAC	2	6	281296	281301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016445	GAG	2	6	283772	283777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016445	TCAA	2	8	283778	283785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_016445	GCTT	2	8	283792	283799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_016445	CTT	2	6	283835	283840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016445	A	6	6	283844	283849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016445	T	7	7	283868	283874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016445	TAA	2	6	285295	285300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016445	GTTC	2	8	285343	285350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016445	GT	3	6	285365	285370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016445	CCT	2	6	285390	285395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_016445	ATTA	2	8	285903	285910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016445	TTG	3	9	285995	286003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016445	TCT	2	6	286047	286052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016445	CAA	2	6	287243	287248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016445	TCAAA	2	10	287266	287275	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_016445	CAA	2	6	287327	287332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016445	GCA	2	6	291018	291023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016445	CTGG	2	8	292861	292868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_016445	GA	3	6	292913	292918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016445	CAT	2	6	292926	292931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016445	ATG	2	6	292933	292938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016445	GTT	2	6	293021	293026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016445	T	6	6	294538	294543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016445	GA	4	8	294554	294561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016445	GTTTT	2	10	295484	295493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016445	GGTG	2	8	295547	295554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016445	TA	3	6	295557	295562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016445	AGA	2	6	295606	295611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016445	TTAA	2	8	295651	295658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016445	ATA	2	6	297349	297354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016445	A	6	6	297379	297384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016445	A	6	6	297387	297392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016445	TCCG	2	8	297425	297432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_016445	GTT	2	6	297484	297489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016445	TGT	2	6	297498	297503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016445	TGA	2	6	299003	299008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016445	GAA	2	6	299041	299046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016445	TAA	2	6	300645	300650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016445	T	6	6	300703	300708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016445	TGT	2	6	300725	300730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_016445	GA	3	6	300877	300882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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