MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 6781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016445	GTCA	2	8	2149096	2149103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_016445	GGA	2	6	2149119	2149124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016445	C	6	6	2149129	2149134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4504	NC_016445	TCGC	2	8	2149276	2149283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_016445	CTA	2	6	2149286	2149291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_016445	TCT	2	6	2149310	2149315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_016445	GTT	3	9	2149551	2149559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_016445	AAC	2	6	2149562	2149567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_016445	TGT	2	6	2149671	2149676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016445	ACAA	2	8	2149711	2149718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_016445	TTG	2	6	2149726	2149731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016445	TGA	2	6	2149771	2149776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016445	TGG	2	6	2149816	2149821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016445	CCT	2	6	2149846	2149851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_016445	AGGC	2	8	2149859	2149866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_016445	GTG	2	6	2149899	2149904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016445	ACC	2	6	2149922	2149927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_016445	ACC	2	6	2149957	2149962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_016445	AATC	2	8	2150000	2150007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_016445	TG	3	6	2150008	2150013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016445	TCA	2	6	2150019	2150024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_016445	ATC	2	6	2150030	2150035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_016445	AGG	2	6	2150041	2150046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016445	TCC	2	6	2150122	2150127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_016445	CTT	2	6	2150146	2150151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_016445	GT	3	6	2150182	2150187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016445	ACG	2	6	2150283	2150288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_016445	GT	3	6	2150351	2150356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016445	ATG	2	6	2150376	2150381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016445	CGT	2	6	2150388	2150393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016445	TCC	2	6	2150402	2150407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_016445	CCA	2	6	2150438	2150443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_016445	GAC	2	6	2150516	2150521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_016445	GCA	2	6	2150528	2150533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016445	TTC	2	6	2150604	2150609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_016445	GCC	2	6	2150847	2150852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_016445	C	6	6	2150911	2150916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4538	NC_016445	ACC	2	6	2150993	2150998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_016445	GCT	2	6	2151057	2151062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_016445	CTT	2	6	2151082	2151087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_016445	ACC	2	6	2151124	2151129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_016445	TCC	2	6	2151131	2151136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_016445	CTT	2	6	2151166	2151171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_016445	CTG	2	6	2151225	2151230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_016445	ATC	2	6	2151275	2151280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_016445	TCG	2	6	2151300	2151305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_016445	CCG	2	6	2151474	2151479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_016445	TGC	2	6	2151508	2151513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_016445	GCC	2	6	2151539	2151544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_016445	T	6	6	2151698	2151703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016445	ATC	2	6	2151708	2151713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_016445	CA	3	6	2151724	2151729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_016445	GATT	2	8	2151730	2151737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016445	GCT	2	6	2151919	2151924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_016445	T	7	7	2151924	2151930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016445	TTTA	2	8	2151996	2152003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016445	TC	3	6	2152012	2152017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_016445	AGA	2	6	2153368	2153373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_016445	TAA	3	9	2153377	2153385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016445	GTT	2	6	2153411	2153416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_016445	AATATG	2	12	2153437	2153448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016445	CTT	2	6	2153481	2153486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_016445	GGAC	2	8	2153504	2153511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_016445	CGT	2	6	2153549	2153554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_016445	CAC	2	6	2153567	2153572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_016445	AAG	2	6	2153617	2153622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016445	AAAAT	2	10	2153649	2153658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016445	ATT	2	6	2153668	2153673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016445	CAC	2	6	2153675	2153680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_016445	CT	3	6	2153703	2153708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_016445	TTTTGA	2	12	2154290	2154301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016445	T	6	6	2154327	2154332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016445	T	7	7	2156548	2156554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016445	T	6	6	2156590	2156595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016445	AAT	2	6	2156597	2156602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016445	GTG	2	6	2158285	2158290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016445	CT	3	6	2158782	2158787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_016445	A	6	6	2161743	2161748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016445	GCA	2	6	2161750	2161755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_016445	GAT	2	6	2161780	2161785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016445	A	6	6	2163567	2163572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016445	TA	3	6	2163581	2163586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016445	TCA	2	6	2166566	2166571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_016445	ACTTC	2	10	2166596	2166605	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4585	NC_016445	TAT	2	6	2166617	2166622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016445	CCG	2	6	2166698	2166703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_016445	T	8	8	2166712	2166719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016445	GAT	2	6	2166774	2166779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016445	TCC	2	6	2168397	2168402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_016445	TTTA	2	8	2168414	2168421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016445	GTA	2	6	2169643	2169648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016445	G	6	6	2169711	2169716	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016445	T	6	6	2169718	2169723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_016445	TACC	2	8	2171205	2171212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_016445	CTTT	2	8	2171705	2171712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_016445	GAA	2	6	2172488	2172493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_016445	ATGA	2	8	2172526	2172533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016445	TTA	2	6	2177679	2177684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016445	AGAGT	2	10	2182018	2182027	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016445	TAACAA	2	12	2182039	2182050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4601	NC_016445	CTC	2	6	2185453	2185458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_016445	AGA	2	6	2185506	2185511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016445	TTA	2	6	2185542	2185547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016445	ATT	2	6	2185581	2185586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016445	TTCA	2	8	2187024	2187031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_016445	TTCA	2	8	2188390	2188397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_016445	TTA	2	6	2188415	2188420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016445	A	6	6	2189109	2189114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016445	GCTC	2	8	2192494	2192501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_016445	GAGG	2	8	2192525	2192532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016445	ATT	2	6	2192546	2192551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016445	GGTTCA	2	12	2192594	2192605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4613	NC_016445	C	6	6	2192677	2192682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4614	NC_016445	CAA	2	6	2195012	2195017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_016445	CGC	2	6	2196077	2196082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_016445	GCG	2	6	2196088	2196093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_016445	AAT	3	9	2196184	2196192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016445	A	6	6	2196785	2196790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016445	CAGCT	2	10	2196793	2196802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4620	NC_016445	T	6	6	2196806	2196811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016445	TC	4	8	2197176	2197183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_016445	CAT	2	6	2202709	2202714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_016445	TGC	2	6	2202787	2202792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_016445	CCA	2	6	2202816	2202821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_016445	TG	3	6	2203517	2203522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_016445	TTTG	2	8	2203530	2203537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_016445	CATC	2	8	2204177	2204184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_016445	GA	3	6	2204229	2204234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016445	TCA	2	6	2204250	2204255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_016445	ATC	2	6	2204258	2204263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_016445	TTATA	2	10	2204285	2204294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_016445	T	7	7	2204657	2204663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_016445	TTA	2	6	2204667	2204672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_016445	CA	3	6	2205475	2205480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4635	NC_016445	GAG	2	6	2205482	2205487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_016445	TGAC	2	8	2207478	2207485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4637	NC_016445	AG	3	6	2208044	2208049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_016445	CCCT	2	8	2208061	2208068	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4639	NC_016445	AAC	2	6	2208212	2208217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4640	NC_016445	TAT	2	6	2208228	2208233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4641	NC_016445	AG	3	6	2208267	2208272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4642	NC_016445	GCT	2	6	2208281	2208286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4643	NC_016445	GCG	2	6	2208289	2208294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4644	NC_016445	CAG	2	6	2208311	2208316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4645	NC_016445	GCA	2	6	2208326	2208331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4647	NC_016445	CGG	2	6	2212365	2212370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4649	NC_016445	AGT	2	6	2212409	2212414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_016445	AAG	2	6	2212419	2212424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4652	NC_016445	TTA	2	6	2213354	2213359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_016445	T	6	6	2213380	2213385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4654	NC_016445	CAG	2	6	2213436	2213441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4656	NC_016445	GCA	2	6	2213467	2213472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4657	NC_016445	TCACA	2	10	2213517	2213526	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4664	NC_016445	TAT	2	6	2217692	2217697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_016445	CTTG	2	8	2217742	2217749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4666	NC_016445	CTGC	2	8	2217781	2217788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4667	NC_016445	TTGCAG	2	12	2217828	2217839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4671	NC_016445	A	6	6	2221224	2221229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4672	NC_016445	CTAA	2	8	2221668	2221675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4673	NC_016445	CT	3	6	2222681	2222686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4674	NC_016445	TCA	2	6	2224131	2224136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4676	NC_016445	TAC	2	6	2224180	2224185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4678	NC_016445	ATCT	2	8	2224391	2224398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4680	NC_016445	A	7	7	2229853	2229859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4681	NC_016445	TCGGG	2	10	2229871	2229880	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4684	NC_016445	A	6	6	2229935	2229940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4692	NC_016445	GATT	2	8	2235012	2235019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4705	NC_016445	ACC	2	6	2241442	2241447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4709	NC_016445	T	6	6	2242869	2242874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4710	NC_016445	TTA	2	6	2242919	2242924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4731	NC_016445	ATT	2	6	2258099	2258104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4734	NC_016445	CAGT	2	8	2258253	2258260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4735	NC_016445	GCA	2	6	2258916	2258921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4743	NC_016445	GCG	2	6	2263438	2263443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4746	NC_016445	CA	3	6	2264326	2264331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4747	NC_016445	A	6	6	2264363	2264368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_016445	TGAAAT	2	12	2265461	2265472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_016445	ACAAA	2	10	2265476	2265485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4750	NC_016445	GCC	2	6	2266985	2266990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4751	NC_016445	CCA	2	6	2267049	2267054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4752	NC_016445	TC	3	6	2269494	2269499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4753	NC_016445	GAA	2	6	2270606	2270611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_016445	CAG	2	6	2271143	2271148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4755	NC_016445	AATA	2	8	2275797	2275804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_016445	GAT	2	6	2275809	2275814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_016445	ATC	2	6	2278407	2278412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_016445	T	6	6	2278419	2278424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_016445	ATTCG	2	10	2278427	2278436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4760	NC_016445	CAA	2	6	2279419	2279424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4761	NC_016445	AAATT	2	10	2279447	2279456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_016445	GTT	2	6	2281920	2281925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4891	NC_016445	CAGA	2	8	2329097	2329104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4892	NC_016445	TA	3	6	2329113	2329118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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