MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome II

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015637	TATTT	2	10	12	21	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015637	TGCGT	2	10	6973	6982	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015637	GCTAA	2	10	25106	25115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015637	CTAGA	2	10	30594	30603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015637	TGAGA	2	10	46426	46435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015637	GATAA	2	10	84673	84682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015637	CTTTC	2	10	85855	85864	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015637	TGAAT	2	10	93727	93736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015637	ATGGC	2	10	94883	94892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015637	AGAAA	2	10	107610	107619	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015637	CTTAC	2	10	115423	115432	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015637	TTCCG	2	10	180682	180691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015637	CACCC	2	10	188124	188133	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_015637	TTGTT	2	10	200138	200147	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015637	GTCAT	2	10	226204	226213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015637	TATCC	2	10	226483	226492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015637	TAGCT	2	10	232828	232837	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015637	GGAAA	2	10	232877	232886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015637	ACATT	2	10	233760	233769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015637	TTTAA	2	10	235556	235565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015637	AAGCC	2	10	241702	241711	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015637	TTTTA	2	10	241771	241780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015637	CTTTT	2	10	249351	249360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015637	CTCTT	2	10	254692	254701	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015637	AGAGA	10	50	256258	256307	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015637	TAAAT	2	10	262673	262682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015637	TTTCG	2	10	265041	265050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015637	CATTT	2	10	278725	278734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015637	TGACG	2	10	302663	302672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015637	CTAGG	2	10	302767	302776	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015637	GCACC	2	10	306802	306811	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015637	AATAA	2	10	312257	312266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015637	AATAG	2	10	312639	312648	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015637	GAAAG	2	10	318071	318080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015637	AAATG	2	10	340462	340471	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015637	ATTCA	2	10	345058	345067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015637	CCAAA	2	10	345240	345249	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015637	CTCAA	2	10	354053	354062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015637	AACAA	2	10	388858	388867	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015637	CTAAA	2	10	390500	390509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015637	GAATT	2	10	410183	410192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015637	GGGTG	2	10	415211	415220	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015637	GTGAT	2	10	418170	418179	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015637	TATCC	2	10	432221	432230	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015637	GAAAT	2	10	444861	444870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015637	TTTCA	2	10	444874	444883	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015637	AACCT	2	10	454546	454555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015637	CCTAA	2	10	474436	474445	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015637	ATCAC	2	10	479527	479536	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015637	AAAGT	2	10	483072	483081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015637	TGAAA	2	10	483140	483149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015637	AGCTA	2	10	483262	483271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015637	ATAAC	2	10	483323	483332	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015637	AAAGG	2	10	487976	487985	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015637	CCGTT	2	10	515701	515710	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015637	TATCC	2	10	530185	530194	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015637	CAGGG	2	10	534461	534470	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015637	AGGAT	2	10	538762	538771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015637	CCAAG	2	10	542547	542556	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015637	GTTTT	2	10	551682	551691	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015637	AGGAT	2	10	555722	555731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015637	TTTTC	2	10	557706	557715	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015637	ACCTC	2	10	563794	563803	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_015637	TTTAT	2	10	569567	569576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015637	GCATT	2	10	571482	571491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015637	GCACT	2	10	631562	631571	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015637	AGCTG	2	10	637148	637157	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015637	GTTTT	2	10	639320	639329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015637	AAAAT	2	10	641963	641972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015637	TGCTT	2	10	645402	645411	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015637	ATTTT	2	10	657004	657013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015637	ACAAG	2	10	657095	657104	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015637	AGAGA	2	10	673710	673719	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015637	CCATA	2	10	675977	675986	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015637	CAAAA	2	10	682497	682506	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015637	TGAAA	2	10	686899	686908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015637	TTTAT	2	10	710369	710378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015637	GTCAT	3	15	718950	718964	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015637	TTTTA	2	10	723222	723231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015637	TCCAT	2	10	725639	725648	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015637	ACTAA	2	10	741771	741780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015637	TAACG	2	10	752770	752779	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015637	AGAGA	2	10	777844	777853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015637	AATCG	2	10	791719	791728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015637	TAAAA	2	10	797542	797551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015637	GCTTT	2	10	803935	803944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015637	CTTTT	2	10	804134	804143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015637	ACTGA	2	10	811458	811467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015637	GATAC	2	10	832184	832193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015637	CAAGA	2	10	838342	838351	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015637	AGAGT	2	10	839466	839475	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015637	TTCAA	2	10	842584	842593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015637	TTTAA	2	10	851756	851765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015637	CCTTA	2	10	873733	873742	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015637	CATTA	2	10	886483	886492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015637	TGCGA	2	10	886493	886502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015637	TAAAA	2	10	896008	896017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015637	TTGTG	2	10	899289	899298	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015637	GTAAT	2	10	906636	906645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015637	AGCTA	2	10	907081	907090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015637	TTGAG	2	10	909403	909412	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015637	CCAAA	2	10	932882	932891	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015637	GTTTA	2	10	933721	933730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015637	CAGTA	2	10	941121	941130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015637	TTTGG	2	10	941625	941634	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015637	ACTGA	2	10	945118	945127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015637	GTAAA	2	10	945249	945258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015637	GTTTT	2	10	953106	953115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015637	TTTAC	2	10	955256	955265	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015637	TCAGT	2	10	955387	955396	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015637	CTTAA	2	10	955519	955528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015637	TGCAT	2	10	960690	960699	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015637	CACAT	2	10	969129	969138	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015637	GCGTT	2	10	973424	973433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015637	TTTGG	2	10	975354	975363	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015637	ATTTG	2	10	984817	984826	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015637	AGCAT	2	10	987031	987040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.