MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome II

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015637	TGTT	2	8	1506	1513	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015637	TGTT	2	8	2650	2657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015637	ATCA	2	8	3047	3054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015637	TGTA	2	8	7960	7967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015637	TGTT	2	8	9272	9279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015637	TTTG	2	8	10801	10808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015637	CTTG	2	8	10987	10994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015637	ATCT	2	8	13171	13178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015637	TAGT	2	8	13261	13268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015637	ATCA	2	8	13458	13465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015637	AGTT	2	8	13533	13540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015637	AAAG	2	8	15639	15646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015637	AAAT	2	8	15964	15971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015637	GATT	2	8	17093	17100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015637	GACG	2	8	17893	17900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015637	TAAA	2	8	21293	21300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015637	GTTA	2	8	22149	22156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015637	TTAT	2	8	28819	28826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015637	CATT	2	8	28932	28939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015637	TGAG	2	8	28965	28972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015637	CGAC	2	8	29394	29401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015637	TTCA	2	8	30605	30612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015637	TTAA	2	8	30980	30987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015637	CAAA	2	8	38830	38837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015637	TCCT	2	8	39635	39642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015637	TAGA	2	8	39664	39671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015637	TAAA	2	8	41730	41737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015637	ATTC	2	8	54145	54152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015637	TCAG	2	8	54186	54193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015637	ATAA	2	8	56851	56858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015637	AAAT	2	8	62783	62790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015637	AAAT	2	8	62963	62970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015637	CGTT	2	8	64051	64058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015637	TTTG	2	8	64087	64094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015637	ATTT	2	8	66801	66808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015637	ACTA	2	8	73468	73475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015637	AACA	2	8	74788	74795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015637	TTTC	2	8	76890	76897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015637	TAAG	2	8	76948	76955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015637	GCGT	2	8	78119	78126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015637	TTTA	2	8	84586	84593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015637	TTGA	2	8	84625	84632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015637	CTGG	2	8	89451	89458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015637	AATG	2	8	90591	90598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015637	TCAC	2	8	95797	95804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015637	GCTG	2	8	102878	102885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015637	TGCC	2	8	109533	109540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015637	GCTC	2	8	123824	123831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015637	CTTT	2	8	126539	126546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015637	ACTC	2	8	131263	131270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015637	AATG	2	8	131276	131283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015637	TTCT	3	12	131925	131936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015637	ATAA	2	8	139250	139257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015637	CTGC	2	8	139405	139412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015637	GAAG	2	8	140409	140416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015637	AATT	2	8	140441	140448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015637	TAAT	2	8	140476	140483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015637	GGCA	2	8	161614	161621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015637	TTTG	2	8	162124	162131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015637	CATG	2	8	163267	163274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015637	CAAC	2	8	168944	168951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015637	TTAA	2	8	174057	174064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015637	GTCA	6	24	179911	179934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015637	GAAA	2	8	187803	187810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015637	GGCA	2	8	187927	187934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015637	TAAT	2	8	187943	187950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015637	GGGA	2	8	188151	188158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015637	TAAT	2	8	188226	188233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015637	GCTC	2	8	188287	188294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015637	CCCA	2	8	188357	188364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015637	AATT	2	8	189286	189293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015637	AGTC	2	8	193243	193250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015637	GCAA	2	8	200250	200257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015637	ATCA	2	8	200331	200338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015637	TTAT	2	8	200909	200916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015637	CATT	2	8	206027	206034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015637	TATT	2	8	207603	207610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015637	TCAT	2	8	207611	207618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015637	AATC	2	8	208722	208729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015637	TCGC	2	8	216940	216947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015637	ATTA	2	8	216990	216997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015637	TCAC	2	8	217018	217025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015637	TGGT	2	8	217169	217176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015637	AATG	2	8	218260	218267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015637	TTCA	2	8	222807	222814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015637	CTAT	2	8	222895	222902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015637	ATCA	2	8	222982	222989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015637	ATAA	2	8	223852	223859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015637	ATAA	2	8	226106	226113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015637	ATAA	2	8	226182	226189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015637	CATA	2	8	228144	228151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015637	TCAT	2	8	233781	233788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015637	AATA	2	8	241817	241824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015637	AAAT	2	8	247863	247870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015637	AATA	2	8	251746	251753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015637	TTAG	2	8	251784	251791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015637	TTGT	2	8	261802	261809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015637	TAAA	2	8	262654	262661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015637	ATGA	2	8	278677	278684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015637	ATTT	2	8	278851	278858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015637	GATA	2	8	279677	279684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015637	CTTG	2	8	280228	280235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015637	GGAA	2	8	284035	284042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015637	AACA	2	8	284498	284505	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015637	TGAC	2	8	284719	284726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015637	CCTT	2	8	286223	286230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015637	TGAC	2	8	294790	294797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015637	ATTC	2	8	294801	294808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015637	TAAA	2	8	298094	298101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015637	TAAA	2	8	302758	302765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015637	GCTG	2	8	306618	306625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015637	TTGT	2	8	306823	306830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015637	TTGC	2	8	306863	306870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015637	TAAT	2	8	306963	306970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015637	ATTA	2	8	306993	307000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015637	TCCG	2	8	308496	308503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015637	TATT	2	8	311167	311174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015637	TTAA	2	8	311232	311239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015637	GCTC	2	8	311302	311309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015637	TACA	2	8	312186	312193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015637	AACT	2	8	312346	312353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015637	CTCA	2	8	312545	312552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015637	CTAG	2	8	312777	312784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015637	TAAA	2	8	315216	315223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015637	CAAT	2	8	323197	323204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015637	GCTT	2	8	330141	330148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015637	ATTT	2	8	332102	332109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015637	TTAT	2	8	338054	338061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015637	AAAC	2	8	338077	338084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015637	TAAT	2	8	338399	338406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015637	AAAT	2	8	342452	342459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015637	TCGA	2	8	343918	343925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015637	TAAC	2	8	343972	343979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015637	CCTT	2	8	344988	344995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015637	CAGC	2	8	345189	345196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015637	ATTA	2	8	349253	349260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015637	CATC	2	8	349304	349311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015637	ATGG	2	8	349537	349544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015637	ATAA	2	8	350877	350884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015637	TTAT	2	8	351701	351708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015637	CACT	2	8	351871	351878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015637	TGTC	2	8	353764	353771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015637	TAAA	2	8	353811	353818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015637	TGAT	2	8	354257	354264	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015637	ATCG	2	8	354306	354313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015637	AGAA	2	8	354873	354880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015637	ATGC	2	8	357457	357464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015637	ATGC	2	8	357476	357483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015637	AATA	2	8	357597	357604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015637	TAAT	2	8	359060	359067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015637	ATTA	2	8	359082	359089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015637	TTAT	2	8	362596	362603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.