MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome I

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015633	AACCC	2	10	366	375	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015633	CCTAA	2	10	11902	11911	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015633	GAACA	2	10	11916	11925	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015633	GGTTT	2	10	30231	30240	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015633	GAGAT	2	10	37429	37438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015633	CATTT	2	10	50378	50387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015633	TGAAG	2	10	56023	56032	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015633	TGAGC	2	10	56208	56217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015633	TTAAT	2	10	60503	60512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015633	ATTCG	2	10	60587	60596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015633	CTCGC	2	10	62092	62101	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_015633	GCGGA	2	10	69350	69359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015633	TCGGT	2	10	71820	71829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015633	CGCTA	2	10	90487	90496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015633	CTAAC	2	10	97155	97164	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015633	CGATT	2	10	104328	104337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015633	TCAGT	2	10	104897	104906	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015633	CTTTA	2	10	111061	111070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015633	AAAGA	2	10	112708	112717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015633	TCGGT	2	10	152478	152487	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015633	CATGC	2	10	153541	153550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015633	GATTG	2	10	184787	184796	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015633	CGATG	2	10	184928	184937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015633	AATTT	2	10	186646	186655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015633	TAATC	2	10	190020	190029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015633	AGCTA	2	10	203255	203264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015633	AAAAG	2	10	205473	205482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015633	CCCCG	2	10	206570	206579	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_015633	GCTAA	2	10	206605	206614	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015633	CACAA	2	10	211997	212006	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015633	TAGAT	2	10	212860	212869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015633	AATAA	2	10	213005	213014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015633	TCTAT	2	10	241127	241136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015633	GCTTC	2	10	246386	246395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015633	TCCGC	2	10	254202	254211	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015633	GAAAC	2	10	267002	267011	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015633	TCACT	2	10	295294	295303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015633	TTATG	2	10	298968	298977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015633	ATCAC	2	10	305116	305125	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015633	CTTTT	2	10	315531	315540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015633	GAAAA	2	10	315560	315569	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015633	AGTTT	2	10	335337	335346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015633	TAGTT	2	10	346963	346972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015633	TTTGT	2	10	350638	350647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015633	CTTAA	2	10	354619	354628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015633	ACCTA	2	10	359127	359136	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015633	TGGTT	2	10	387287	387296	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015633	ATTGT	2	10	403025	403034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015633	GTCAT	2	10	405211	405220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015633	GCGTA	2	10	406786	406795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015633	GCCAC	2	10	412675	412684	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_015633	GAGAG	2	10	426370	426379	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015633	ATCTA	2	10	427488	427497	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015633	ATATA	3	15	448210	448224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015633	GGATA	2	10	448319	448328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015633	ATTTG	2	10	452472	452481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015633	TTAAA	2	10	456366	456375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015633	ATTTT	2	10	463319	463328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015633	GTGCT	2	10	463377	463386	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015633	TTTAT	2	10	467885	467894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015633	GCTTT	2	10	484967	484976	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015633	GAGGG	2	10	485730	485739	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015633	GAAGG	2	10	490175	490184	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015633	TTTGA	2	10	490699	490708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015633	GGTCG	2	10	493834	493843	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015633	CTCTT	2	10	494920	494929	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015633	TTAAT	2	10	511262	511271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015633	AAATG	2	10	511356	511365	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015633	TTGAT	2	10	516947	516956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015633	CAGAA	2	10	518574	518583	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015633	AAACA	2	10	518584	518593	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015633	ATCGT	2	10	523090	523099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015633	AATTT	2	10	524844	524853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015633	TAAAA	2	10	535249	535258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015633	AAAAG	2	10	554946	554955	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015633	TAAAA	2	10	571148	571157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015633	AGCGC	2	10	577241	577250	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015633	CGAAG	2	10	578469	578478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015633	TTGTA	2	10	598650	598659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015633	CTTTT	2	10	599513	599522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015633	TTTTG	2	10	602429	602438	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015633	TTGTT	2	10	603361	603370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015633	TTAAG	2	10	622961	622970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015633	TTAGT	2	10	629780	629789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015633	CCCGA	2	10	635048	635057	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015633	GCAAG	2	10	656531	656540	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015633	TTACT	2	10	660816	660825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015633	GTTTA	2	10	660872	660881	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015633	TATAA	2	10	664565	664574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015633	GAGTG	2	10	683382	683391	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015633	CTTTA	2	10	691296	691305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015633	TTTGT	2	10	706796	706805	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015633	TTGGC	2	10	708277	708286	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015633	AGAGA	2	10	718081	718090	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015633	CTCAT	2	10	732371	732380	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015633	ATAAA	2	10	732418	732427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015633	CGAGC	2	10	748233	748242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015633	TGCAT	2	10	756326	756335	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015633	CATCT	2	10	765955	765964	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015633	GAGTA	2	10	766113	766122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015633	GAATC	2	10	766167	766176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015633	TGCAC	2	10	766809	766818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015633	TTTGA	2	10	773510	773519	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015633	GTTTT	2	10	776720	776729	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015633	AACGA	2	10	785212	785221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015633	TCGCG	2	10	791195	791204	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015633	GGAGG	2	10	813899	813908	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015633	TCCAG	2	10	826513	826522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015633	TTAAT	2	10	842461	842470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015633	TAATA	2	10	852829	852838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015633	TGTGT	11	55	866008	866062	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015633	TTTAT	2	10	871682	871691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015633	TTGTT	2	10	871765	871774	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015633	CTAGC	2	10	874641	874650	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015633	TGCAT	2	10	875177	875186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015633	GAAAT	2	10	878535	878544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015633	AAGCT	2	10	893015	893024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015633	CCACG	2	10	907428	907437	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_015633	GTTGC	2	10	907555	907564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015633	TGCGG	2	10	908080	908089	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015633	TTATT	2	10	909685	909694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015633	TTAAG	2	10	912355	912364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015633	CATAC	2	10	939923	939932	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015633	GAGGT	2	10	949676	949685	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015633	GAAAT	2	10	953703	953712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015633	TAATT	2	10	957097	957106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015633	TAAAA	2	10	957132	957141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015633	TAATT	2	10	957171	957180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015633	TGATC	2	10	957651	957660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015633	TAAAA	2	10	968576	968585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015633	CAAAA	2	10	977385	977394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015633	TTCTT	2	10	1007221	1007230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015633	GTTTT	2	10	1013340	1013349	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015633	ACCTT	2	10	1019270	1019279	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015633	TCACG	2	10	1022238	1022247	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015633	TTTGT	2	10	1036822	1036831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015633	TGATT	2	10	1036900	1036909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015633	AATTG	2	10	1040256	1040265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015633	TTAAA	2	10	1043192	1043201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015633	GTGAG	2	10	1078377	1078386	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015633	ATAGA	2	10	1082903	1082912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015633	AAAAC	2	10	1082989	1082998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015633	CGGGA	2	10	1109578	1109587	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015633	TCTGT	2	10	1122632	1122641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015633	CAAGC	2	10	1134611	1134620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015633	TGTAT	2	10	1135102	1135111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015633	AGATG	2	10	1138948	1138957	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015633	AAAAG	2	10	1142726	1142735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015633	GGTGT	2	10	1161837	1161846	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015633	TTATT	2	10	1360208	1360217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015633	TGAAT	2	10	1660626	1660635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_015633	TGAAA	2	10	1697751	1697760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_015633	ATGAA	2	10	1714202	1714211	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015633	AACGA	2	10	1716105	1716114	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_015633	TTCAA	2	10	2353686	2353695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_015633	AGTTT	2	10	2370993	2371002	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_015633	TGTTA	2	10	2389995	2390004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_015633	TGATT	2	10	2453868	2453877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_015633	CGCTT	2	10	2560629	2560638	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_015633	AAGTA	2	10	2568906	2568915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015633	AACTA	2	10	2591303	2591312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_015633	AGCAA	2	10	2591317	2591326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015633	GCAAA	2	10	2611644	2611653	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_015633	AATTA	2	10	2615736	2615745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015633	TCAAA	2	10	2626134	2626143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_015633	CAACA	2	10	2643333	2643342	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
292	NC_015633	ACCAT	2	10	2647565	2647574	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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294	NC_015633	AATAG	2	10	2680784	2680793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015633	TCAAT	2	10	2693308	2693317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_015633	GGGTG	2	10	2705363	2705372	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015633	TAAAT	2	10	2731572	2731581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015633	ATCAA	2	10	2748489	2748498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_015633	TTGGT	2	10	2750223	2750232	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_015633	TTCTA	2	10	2814184	2814193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
314	NC_015633	TTTAC	2	10	2814596	2814605	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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319	NC_015633	GGACC	2	10	2822186	2822195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_015633	CGGTC	2	10	2827310	2827319	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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331	NC_015633	TAATA	2	10	2863326	2863335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015633	ACAAA	2	10	2865134	2865143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_015633	AAGTG	2	10	2873663	2873672	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_015633	ATAAA	2	10	2954838	2954847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_015633	GTAAA	2	10	2973066	2973075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
347	NC_015633	AACTG	2	10	2976996	2977005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
348	NC_015633	ATTTT	2	10	2979017	2979026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_015633	TCGGT	2	10	2988931	2988940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
351	NC_015633	CATGC	2	10	2989994	2990003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
352	NC_015633	ATCGA	2	10	2997127	2997136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
353	NC_015633	TCAAG	2	10	2998173	2998182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
354	NC_015633	CACAG	2	10	3011037	3011046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
355	NC_015633	GCGGA	2	10	3062658	3062667	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.