MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	CGCC	2	8	29	36	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_015409	CGCC	2	8	155	162	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015409	GCTT	2	8	261	268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015409	GAGG	2	8	286	293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015409	GCCG	2	8	625	632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015409	CCGC	2	8	634	641	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015409	GCCA	2	8	1191	1198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015409	GGTG	2	8	1339	1346	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015409	CCAG	2	8	1441	1448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015409	CACC	2	8	1657	1664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015409	TGCC	2	8	2502	2509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015409	CCGC	2	8	2602	2609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015409	GTCG	2	8	2630	2637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015409	GGCT	2	8	4081	4088	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015409	CATC	2	8	4245	4252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015409	GACC	2	8	4507	4514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015409	TTCT	2	8	6993	7000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015409	TTGA	2	8	10116	10123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015409	GGTG	2	8	12329	12336	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015409	GGCG	2	8	13716	13723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015409	CCGC	2	8	13750	13757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_015409	CTGG	2	8	20459	20466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015409	CGGT	2	8	20538	20545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015409	CGCC	2	8	24888	24895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015409	CCGG	2	8	28407	28414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015409	CCAG	2	8	28471	28478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015409	GGTA	2	8	28548	28555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015409	CGGG	2	8	28890	28897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015409	CGGG	2	8	28921	28928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015409	GACC	2	8	29118	29125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015409	ATCG	2	8	29209	29216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015409	GGGT	2	8	32044	32051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015409	CGGC	2	8	32173	32180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015409	ACCC	2	8	32190	32197	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015409	CGAC	2	8	32285	32292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015409	GGGT	2	8	32417	32424	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015409	GACC	2	8	40630	40637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015409	ACCT	2	8	44056	44063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015409	GGCG	2	8	44095	44102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015409	CGAT	2	8	44424	44431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015409	CGAC	2	8	44834	44841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015409	CTAC	2	8	46644	46651	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015409	CGGC	2	8	48409	48416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015409	GATC	2	8	54906	54913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015409	CGGT	2	8	56635	56642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015409	CCGT	2	8	56735	56742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015409	CGAT	2	8	57686	57693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015409	CGCC	2	8	57947	57954	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.