MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	CCG	2	6	46	51	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015409	GTT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015409	GGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015409	CCG	2	6	116	121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015409	CCG	2	6	172	177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015409	GTT	2	6	197	202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015409	GGT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015409	CCG	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015409	GGT	2	6	431	436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015409	GTC	2	6	449	454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015409	GGT	2	6	464	469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015409	GCG	2	6	474	479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015409	GGT	2	6	485	490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015409	GGT	2	6	497	502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015409	GTC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015409	GGC	2	6	517	522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015409	TGT	2	6	610	615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015409	CCG	2	6	646	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015409	GCA	2	6	727	732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015409	TCG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015409	CGG	2	6	802	807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015409	CGG	2	6	838	843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015409	AGC	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015409	GGC	2	6	953	958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015409	CCG	2	6	981	986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015409	GCG	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015409	TCA	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015409	CCA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015409	AGC	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015409	CGT	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015409	AGC	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015409	CCA	2	6	1313	1318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015409	GTC	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015409	GCC	2	6	1347	1352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015409	CCG	2	6	1383	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015409	ACC	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015409	GCC	2	6	1431	1436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015409	CGC	3	9	1541	1549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015409	CAC	2	6	1553	1558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015409	TGC	2	6	1566	1571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015409	TGC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015409	CCG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015409	CGG	2	6	1670	1675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015409	ACC	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015409	CAT	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015409	CCA	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015409	ACG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015409	GAT	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015409	CAC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015409	GCG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015409	CGA	2	6	2310	2315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015409	CGG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015409	CGG	3	9	2352	2360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015409	CCG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015409	GCG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015409	GAC	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015409	CAG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015409	GTC	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015409	ACC	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015409	AGC	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015409	CGC	2	6	2651	2656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015409	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015409	GGA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015409	CGC	2	6	3032	3037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015409	GGC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015409	TCC	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015409	GGT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015409	TGC	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015409	GAC	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015409	CGC	3	9	3747	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015409	ACC	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015409	CCT	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015409	GTC	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015409	GTA	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015409	TCG	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015409	CAC	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015409	ATG	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015409	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015409	GCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015409	GTG	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015409	CGG	2	6	4666	4671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015409	TCG	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015409	GTG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015409	TCC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015409	GCC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015409	GCG	2	6	4838	4843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015409	CGC	2	6	4861	4866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015409	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015409	TCG	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015409	TCG	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015409	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015409	TGT	2	6	5682	5687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015409	TGT	2	6	5698	5703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015409	ACT	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015409	CGT	2	6	5791	5796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015409	TCG	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015409	CGG	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015409	CGA	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015409	GCT	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015409	CGA	2	6	7045	7050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015409	AAG	2	6	7071	7076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015409	CGG	2	6	7192	7197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015409	ATT	3	9	10054	10062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015409	TCC	2	6	12345	12350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015409	GGC	2	6	12625	12630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015409	GCC	2	6	12643	12648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015409	GGA	2	6	12661	12666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015409	CTC	2	6	13687	13692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015409	GTC	2	6	16325	16330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015409	CGG	3	9	16332	16340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015409	GGT	2	6	18326	18331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015409	CCT	2	6	20111	20116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015409	ACG	2	6	20494	20499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015409	CGG	2	6	20555	20560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015409	CCT	2	6	20581	20586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015409	TTC	2	6	20628	20633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015409	CGG	2	6	20677	20682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015409	CGT	2	6	24642	24647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015409	GCA	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015409	CCT	2	6	24720	24725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015409	CGG	2	6	24747	24752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015409	CCG	2	6	24762	24767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015409	AGG	2	6	24973	24978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015409	GTG	2	6	26635	26640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015409	GTA	2	6	26666	26671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015409	TGG	2	6	26794	26799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015409	GTC	2	6	26803	26808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015409	GCT	2	6	26897	26902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015409	AGC	2	6	26905	26910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015409	GCC	2	6	27596	27601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015409	ACC	2	6	27608	27613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015409	CGG	2	6	28584	28589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015409	AGG	2	6	28596	28601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015409	CCG	2	6	28716	28721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015409	GCT	2	6	28722	28727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015409	AGC	2	6	28752	28757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015409	CGC	2	6	28775	28780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015409	AGG	2	6	28935	28940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015409	CGT	2	6	28948	28953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015409	TCG	2	6	28956	28961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015409	CAG	2	6	28977	28982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015409	GTA	2	6	29022	29027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015409	TGT	2	6	29033	29038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015409	GGC	2	6	29088	29093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.