MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 chromosome

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015151	TCTCT	2	10	8299	8308	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015151	ATTAT	2	10	19041	19050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015151	TTGAT	2	10	23921	23930	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015151	ACCCC	2	10	46048	46057	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_015151	CCTCC	2	10	47247	47256	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_015151	TGAAT	2	10	51129	51138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015151	GCTAG	2	10	56606	56615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015151	ATTTT	2	10	74397	74406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015151	ACTGA	2	10	85603	85612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015151	GCATG	2	10	86718	86727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015151	ATCCT	2	10	115619	115628	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015151	ATTTA	2	10	119688	119697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015151	GGCAT	2	10	124980	124989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015151	TATTT	2	10	143569	143578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015151	AAAAG	2	10	145524	145533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015151	CAATT	2	10	146796	146805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015151	GTAAT	2	10	159499	159508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015151	AAATT	2	10	159555	159564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015151	TAGGT	2	10	160470	160479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015151	TTCGT	2	10	167353	167362	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015151	ACTCA	2	10	167804	167813	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015151	TTTTA	2	10	176493	176502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015151	TAGAA	2	10	201957	201966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015151	GTTAG	2	10	205041	205050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015151	CCATT	2	10	218120	218129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015151	TAAAA	2	10	218141	218150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015151	TAGAA	2	10	218201	218210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015151	AGGGA	2	10	218429	218438	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015151	TTTAA	2	10	222346	222355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015151	GTTAA	2	10	238844	238853	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015151	ACCCT	2	10	240434	240443	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015151	CTAAA	2	10	240471	240480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015151	TCTGA	2	10	241887	241896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015151	AAAAT	2	10	271801	271810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015151	TTTAT	2	10	271832	271841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015151	AAAAT	2	10	271861	271870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015151	GTTTT	2	10	273342	273351	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015151	CTTAT	2	10	287830	287839	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015151	TCCTC	2	10	296121	296130	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015151	GAATT	2	10	296354	296363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015151	ATTTT	2	10	305268	305277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015151	TAAAA	2	10	310063	310072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015151	TGAAA	2	10	317937	317946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015151	TTAAT	2	10	325832	325841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015151	AGCTT	2	10	332373	332382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015151	TCAAT	2	10	349342	349351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015151	ACCGT	2	10	362953	362962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015151	AAAAT	2	10	370450	370459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015151	TATGC	2	10	370514	370523	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015151	TGACT	2	10	378540	378549	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015151	ATTTT	2	10	384438	384447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015151	GGCTC	2	10	389165	389174	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015151	CTTTT	2	10	395469	395478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015151	TTAAT	2	10	412177	412186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015151	ACATA	2	10	433369	433378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015151	TTGAG	2	10	457010	457019	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015151	TAAAA	2	10	462373	462382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015151	ATACA	2	10	464943	464952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015151	ATTAT	2	10	483032	483041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015151	ACTTA	2	10	487070	487079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015151	ATTAA	2	10	488433	488442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015151	AATTC	2	10	488449	488458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015151	GAAAA	2	10	510410	510419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015151	TTGAT	2	10	541778	541787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015151	TGAAT	2	10	578586	578595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015151	AATTA	2	10	578624	578633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015151	AACTC	2	10	578745	578754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015151	TAATA	2	10	610095	610104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015151	TTAAT	2	10	619911	619920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015151	CATAG	2	10	659937	659946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015151	TCAAT	2	10	680022	680031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015151	GTAAA	2	10	685970	685979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015151	CAAAA	2	10	695326	695335	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015151	AAAGA	2	10	695560	695569	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015151	CTTGT	2	10	699858	699867	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015151	TTCCT	2	10	710857	710866	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015151	ATAGA	2	10	711650	711659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015151	AGAAA	2	10	715978	715987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015151	TTTAT	2	10	725227	725236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015151	GGAGA	2	10	726136	726145	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015151	GGGGT	2	10	737210	737219	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015151	TAAGT	2	10	761106	761115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015151	GACCC	2	10	761257	761266	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_015151	AGGTA	2	10	782528	782537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015151	GTCAT	2	10	803448	803457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015151	TTCTA	2	10	808986	808995	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015151	AGAAA	2	10	809610	809619	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015151	CAAAA	2	10	815536	815545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015151	ATTTA	2	10	827591	827600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015151	TCCAG	2	10	831601	831610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015151	CTTTG	2	10	833886	833895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015151	ATGCA	2	10	840210	840219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015151	AATGA	2	10	842344	842353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015151	AATTA	2	10	861954	861963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015151	CAAAG	2	10	892030	892039	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015151	TAACT	2	10	904017	904026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015151	TAAAT	2	10	906944	906953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015151	TATTT	2	10	906971	906980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015151	ATAGA	2	10	907019	907028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015151	TTATT	2	10	917427	917436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015151	ATATC	2	10	917437	917446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015151	TTAAA	2	10	918508	918517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015151	CTTGG	2	10	961100	961109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015151	GGCGG	2	10	962319	962328	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015151	TTGAT	2	10	973432	973441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015151	ACATG	2	10	975928	975937	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015151	ATTTT	2	10	980395	980404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015151	ATTCT	2	10	985691	985700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015151	ATTAC	2	10	998545	998554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015151	ATTAA	2	10	1004894	1004903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015151	ATTGG	2	10	1004950	1004959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015151	GCCTA	2	10	1045937	1045946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015151	AGATA	2	10	1052125	1052134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015151	TCTAT	2	10	1094825	1094834	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015151	ATTCA	2	10	1104569	1104578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015151	GGGTA	2	10	1112428	1112437	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015151	GAAAA	2	10	1122090	1122099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015151	ACAGC	2	10	1122713	1122722	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015151	TATGA	2	10	1125809	1125818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015151	TTTTA	2	10	1137385	1137394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015151	TAAAA	2	10	1143638	1143647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015151	AAGTA	2	10	1157518	1157527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015151	ATTAA	2	10	1159402	1159411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015151	GAATA	2	10	1161682	1161691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015151	AATTG	2	10	1161757	1161766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015151	TAATA	2	10	1168369	1168378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015151	AAAAT	2	10	1182110	1182119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015151	AATTA	2	10	1197157	1197166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015151	GCACT	2	10	1197180	1197189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015151	ATTTA	2	10	1197192	1197201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015151	ATTGA	2	10	1210485	1210494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015151	TGGTG	2	10	1225157	1225166	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015151	CTTTT	2	10	1232857	1232866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015151	TTGAG	2	10	1235423	1235432	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015151	GAATA	2	10	1235452	1235461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015151	TTTTA	2	10	1282449	1282458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015151	TTGGA	2	10	1319144	1319153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015151	TGGTC	2	10	1339708	1339717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015151	TTAAT	2	10	1349969	1349978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015151	AATTA	2	10	1352190	1352199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015151	AATTG	2	10	1353899	1353908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015151	AAATT	2	10	1366091	1366100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015151	AGTCT	2	10	1369921	1369930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015151	ATAAA	2	10	1379286	1379295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015151	TACTG	2	10	1382707	1382716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015151	AAATA	2	10	1391626	1391635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015151	ATTAG	2	10	1396535	1396544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015151	CTAGG	2	10	1412196	1412205	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_015151	AAATA	2	10	1414685	1414694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015151	CACAC	2	10	1414722	1414731	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
151	NC_015151	AAACC	2	10	1427533	1427542	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_015151	AGTGT	2	10	1430569	1430578	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015151	AAGTA	2	10	1445031	1445040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015151	GGCAC	2	10	1450350	1450359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015151	CCCAA	2	10	1452043	1452052	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
156	NC_015151	CACAA	2	10	1452813	1452822	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_015151	ACATC	2	10	1467542	1467551	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_015151	CATGA	2	10	1483568	1483577	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_015151	CAACA	2	10	1483858	1483867	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015151	CCCCA	2	10	1483992	1484001	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
161	NC_015151	CCGGG	2	10	1484846	1484855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015151	CACGG	2	10	1485432	1485441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_015151	TTTGG	2	10	1486718	1486727	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015151	CCAAC	2	10	1487011	1487020	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
166	NC_015151	TGGTT	2	10	1488644	1488653	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015151	CTTCC	2	10	1508227	1508236	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
168	NC_015151	TCCTC	2	10	1508479	1508488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
169	NC_015151	CATCA	2	10	1508531	1508540	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_015151	CGAGC	2	10	1508821	1508830	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_015151	CCTAA	2	10	1509312	1509321	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_015151	AATTA	2	10	1516344	1516353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015151	TTAAC	2	10	1516451	1516460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_015151	ATTCA	2	10	1519181	1519190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_015151	TTAAT	2	10	1524187	1524196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015151	TACAC	2	10	1535439	1535448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_015151	TGCCC	2	10	1543488	1543497	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
180	NC_015151	GCAAT	2	10	1562039	1562048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_015151	TAGAC	2	10	1573897	1573906	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_015151	CTTTA	2	10	1573920	1573929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015151	TTTAC	2	10	1576027	1576036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_015151	TTGTT	2	10	1597398	1597407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015151	GCGTG	2	10	1604227	1604236	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_015151	GTGTT	2	10	1618330	1618339	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015151	GTTTT	3	15	1618445	1618459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_015151	ATTTA	2	10	1623767	1623776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015151	ATTTA	2	10	1629105	1629114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015151	TTAAT	2	10	1635307	1635316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015151	TTAAT	2	10	1649106	1649115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015151	ATATA	2	10	1671234	1671243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015151	TATTT	2	10	1675910	1675919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015151	ATATT	2	10	1685584	1685593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015151	ATTTT	2	10	1693210	1693219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_015151	GCCCA	2	10	1696220	1696229	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
201	NC_015151	ACATA	2	10	1699525	1699534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_015151	ATATA	2	10	1700319	1700328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_015151	AAAAT	2	10	1700633	1700642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_015151	GATGC	2	10	1701857	1701866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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231	NC_015151	CAGGT	2	10	1976212	1976221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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258	NC_015151	TTAAT	2	10	2218538	2218547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_015151	TACTG	2	10	2220713	2220722	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_015151	AAAAT	2	10	2287191	2287200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015151	GATTT	2	10	2295841	2295850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015151	TTAAC	2	10	2296723	2296732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_015151	AAAAC	2	10	2298827	2298836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.