MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus MO6-24/O chromosome II

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014966	TTTTA	2	10	6	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014966	AATTG	2	10	9804	9813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014966	GAAAA	2	10	39241	39250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014966	TTAAC	2	10	43777	43786	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014966	CTTGT	2	10	44339	44348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014966	ATTTT	2	10	67144	67153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014966	TCAAT	2	10	67222	67231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014966	GAAAG	2	10	67246	67255	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014966	GAAGG	2	10	74917	74926	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014966	GTTTG	2	10	74994	75003	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014966	AAGCA	2	10	93316	93325	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014966	CCAAA	2	10	106223	106232	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014966	AAGGA	2	10	125949	125958	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014966	CACAA	2	10	127956	127965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014966	TGTTA	2	10	138630	138639	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014966	AGGGC	2	10	179020	179029	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014966	CGATA	2	10	188937	188946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014966	GTTAA	2	10	198318	198327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014966	AAATT	2	10	213459	213468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014966	AAATT	2	10	226385	226394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014966	TATTC	2	10	226503	226512	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014966	TTTAT	2	10	226513	226522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014966	CTTTT	2	10	234765	234774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014966	CAAAA	2	10	239924	239933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014966	AGTTC	2	10	241342	241351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014966	TGTCC	2	10	249165	249174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014966	TGCTT	2	10	256139	256148	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014966	GCTAT	2	10	258516	258525	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014966	GGATG	2	10	264219	264228	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014966	GAAAA	2	10	267463	267472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014966	TTTGT	2	10	276679	276688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014966	TGTGA	2	10	278610	278619	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014966	AAAAG	2	10	279472	279481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014966	CGCCC	2	10	285355	285364	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35	NC_014966	GAAAA	2	10	287585	287594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014966	TAGCT	2	10	288469	288478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014966	TGTTT	2	10	292409	292418	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014966	TTAGA	2	10	294090	294099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014966	AGTCG	2	10	295643	295652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014966	ATTCC	2	10	297593	297602	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014966	AATCA	2	10	310900	310909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014966	TTGGC	2	10	326031	326040	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014966	TTTTC	2	10	345582	345591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014966	TGAAT	2	10	359779	359788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014966	ATTTA	2	10	359854	359863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014966	AAAGG	2	10	377419	377428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014966	AAATG	2	10	396577	396586	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014966	TGTGT	2	10	407178	407187	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014966	AAAAG	2	10	427823	427832	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014966	CTTTT	2	10	427853	427862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014966	GAAGG	2	10	443163	443172	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014966	TTCCA	2	10	443267	443276	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014966	TTCCA	2	10	446534	446543	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014966	TTATT	2	10	446653	446662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014966	TTTGG	2	10	459166	459175	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014966	TGAGA	2	10	459374	459383	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014966	CTTAG	2	10	459805	459814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014966	TTTTG	2	10	474559	474568	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014966	TTTTG	2	10	495570	495579	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014966	GGACC	2	10	504896	504905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014966	GAAAA	2	10	516048	516057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014966	TAGAG	2	10	517360	517369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014966	CAAGG	2	10	531869	531878	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014966	TCTAG	2	10	537066	537075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014966	TATCG	2	10	545028	545037	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014966	TTCCA	2	10	550835	550844	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014966	TTTAA	2	10	553200	553209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014966	AATAA	2	10	583324	583333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014966	GCCTT	2	10	592445	592454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014966	CGCTT	2	10	592977	592986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014966	TTCAT	2	10	597019	597028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014966	GTTAA	2	10	608683	608692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014966	GCATA	2	10	617345	617354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014966	GCGTT	2	10	627388	627397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014966	TCAGT	2	10	627400	627409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014966	ATTGA	2	10	628388	628397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014966	AAGAT	2	10	628548	628557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014966	ATTTT	2	10	641539	641548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014966	AAAAT	2	10	645778	645787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014966	AATTA	2	10	654822	654831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014966	TTCTG	2	10	654836	654845	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014966	TGGCG	2	10	669579	669588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014966	AACCA	2	10	672351	672360	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014966	CCTCA	2	10	699402	699411	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014966	GTTAC	2	10	705187	705196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014966	TTCTC	2	10	705701	705710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014966	GAATT	2	10	737072	737081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014966	TGTCT	2	10	737413	737422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014966	ACTCA	2	10	752110	752119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014966	GAATG	2	10	754354	754363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014966	TTTGA	2	10	754750	754759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014966	GAACC	2	10	765247	765256	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014966	TGCCG	2	10	768595	768604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014966	TTTGT	2	10	769647	769656	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014966	GTCAT	2	10	789616	789625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014966	GAGTT	2	10	790153	790162	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014966	TTGTG	2	10	797967	797976	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014966	TGGAG	2	10	803773	803782	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014966	TTGTA	2	10	806415	806424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014966	TGCTT	2	10	829910	829919	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014966	CTTAA	2	10	830028	830037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014966	ATTTG	2	10	834807	834816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014966	TAAAT	2	10	844456	844465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014966	AAAAG	2	10	852539	852548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014966	CTTAC	2	10	854538	854547	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014966	ATGGT	2	10	854642	854651	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014966	TAAGC	2	10	869014	869023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014966	TTGAG	2	10	882152	882161	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014966	TTAAT	2	10	882189	882198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014966	TGATT	2	10	887191	887200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014966	TCACA	2	10	892012	892021	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014966	CACTT	2	10	902321	902330	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014966	CAAAT	2	10	902444	902453	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014966	AATTT	2	10	909270	909279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014966	TGTTT	2	10	921775	921784	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014966	AGCGA	2	10	925963	925972	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014966	TCGCT	2	10	929365	929374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014966	ATTCA	2	10	929435	929444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014966	ACTCA	2	10	929455	929464	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014966	AAGAA	2	10	929752	929761	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014966	TATCA	2	10	941850	941859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014966	TACTT	2	10	942952	942961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014966	CTTCA	2	10	970007	970016	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014966	TTAAA	2	10	1037002	1037011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014966	TAAAT	2	10	1037120	1037129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014966	TTTTA	2	10	1037218	1037227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014966	AGAGA	2	10	1089180	1089189	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014966	GCTTT	3	15	1095021	1095035	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014966	GCTAT	2	10	1095862	1095871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014966	ATGTG	2	10	1106565	1106574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014966	GTTCA	2	10	1110009	1110018	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014966	TAATT	2	10	1132841	1132850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014966	AACAG	2	10	1154859	1154868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014966	AAATA	2	10	1155191	1155200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014966	CAAAG	2	10	1156651	1156660	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014966	CTATT	2	10	1156797	1156806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014966	GAAAA	2	10	1156819	1156828	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014966	TTAGC	2	10	1166403	1166412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014966	AAAAG	2	10	1166569	1166578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014966	CCAAC	2	10	1169894	1169903	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_014966	AAACA	2	10	1169962	1169971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014966	AAATC	2	10	1201224	1201233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014966	AAAAG	2	10	1208707	1208716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014966	ATTTA	2	10	1219466	1219475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014966	GCTTT	2	10	1221746	1221755	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014966	CTCTC	2	10	1235571	1235580	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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161	NC_014966	TTCTT	2	10	1370731	1370740	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_014966	TTTTG	2	10	1531481	1531490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014966	CTTTC	2	10	1624506	1624515	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_014966	TCCCA	2	10	1657849	1657858	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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212	NC_014966	ACTTA	2	10	1793672	1793681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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214	NC_014966	TTAGA	2	10	1813146	1813155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.