MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014931	TCGC	2	8	1656419	1656426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_014931	AGCCCA	2	12	1656436	1656447	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_014931	CAC	2	6	1656449	1656454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_014931	CGA	2	6	1656506	1656511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_014931	CTG	2	6	1656575	1656580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014931	CGG	2	6	1656617	1656622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_014931	TCG	2	6	1656655	1656660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_014931	CGAC	2	8	1656680	1656687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_014931	CGT	2	6	1656689	1656694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_014931	GCC	2	6	1656725	1656730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_014931	AGA	2	6	1656748	1656753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014931	CT	3	6	1656756	1656761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_014931	ACC	2	6	1656817	1656822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_014931	GAC	2	6	1656831	1656836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_014931	ATC	2	6	1656871	1656876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_014931	AGC	2	6	1656879	1656884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_014931	CGC	2	6	1656989	1656994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_014931	CAC	2	6	1657010	1657015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_014931	AGGCC	2	10	1657018	1657027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3020	NC_014931	CA	3	6	1657039	1657044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_014931	GGCGC	2	10	1657209	1657218	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3022	NC_014931	ACG	3	9	1657293	1657301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014931	AGC	2	6	1657332	1657337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_014931	CGG	2	6	1657429	1657434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014931	CGGC	2	8	1657438	1657445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_014931	ATCACC	2	12	1657518	1657529	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_014931	AGG	2	6	1657534	1657539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014931	G	6	6	1657554	1657559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014931	AGC	2	6	1657560	1657565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_014931	GT	3	6	1657609	1657614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014931	GAT	2	6	1657670	1657675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014931	AGG	2	6	1657705	1657710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014931	TCA	2	6	1657718	1657723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014931	CGA	2	6	1657727	1657732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014931	GAA	2	6	1657733	1657738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014931	AGA	2	6	1657813	1657818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014931	GCC	2	6	1657824	1657829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_014931	CGA	2	6	1659501	1659506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_014931	GCC	2	6	1659567	1659572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_014931	GCA	2	6	1659580	1659585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_014931	CGCAG	2	10	1659607	1659616	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_014931	GTG	2	6	1659744	1659749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014931	AAG	2	6	1659754	1659759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014931	AC	3	6	1659833	1659838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_014931	CTG	2	6	1659843	1659848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_014931	CGCCT	2	10	1659888	1659897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3047	NC_014931	CGAG	2	8	1659959	1659966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_014931	CAA	2	6	1659983	1659988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_014931	TAC	2	6	1660098	1660103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014931	TTC	2	6	1660164	1660169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_014931	TGCGCG	2	12	1660197	1660208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014931	ACG	2	6	1660263	1660268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014931	CAG	2	6	1660276	1660281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014931	GCA	2	6	1660368	1660373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_014931	GCAG	2	8	1660418	1660425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_014931	TCGC	2	8	1660493	1660500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_014931	GC	3	6	1660499	1660504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_014931	CG	3	6	1660561	1660566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_014931	CG	3	6	1660570	1660575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_014931	GAA	2	6	1660649	1660654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014931	TGA	2	6	1661017	1661022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014931	GAA	2	6	1661055	1661060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014931	CAG	2	6	1661068	1661073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_014931	TGT	2	6	1661189	1661194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014931	CTG	2	6	1661319	1661324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014931	CTGGC	2	10	1661340	1661349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3067	NC_014931	T	6	6	1661506	1661511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014931	GTTC	2	8	1661583	1661590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_014931	CACC	2	8	1661717	1661724	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3070	NC_014931	C	6	6	1661736	1661741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3071	NC_014931	GAGC	2	8	1667637	1667644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_014931	GCA	2	6	1667701	1667706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_014931	GCG	2	6	1667737	1667742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_014931	TCG	2	6	1667773	1667778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014931	GGC	2	6	1669268	1669273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_014931	TGC	3	9	1669278	1669286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014931	AGG	2	6	1670712	1670717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014931	GCAAC	2	10	1674433	1674442	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3079	NC_014931	AGC	2	6	1676050	1676055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_014931	CAG	2	6	1676067	1676072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014931	AGCC	2	8	1676077	1676084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_014931	GCCT	2	8	1676666	1676673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_014931	TTG	2	6	1678884	1678889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014931	AGT	2	6	1678945	1678950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014931	GCT	2	6	1678995	1679000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_014931	GGC	2	6	1679015	1679020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_014931	CCA	4	12	1679026	1679037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_014931	GCGCT	2	10	1679582	1679591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3089	NC_014931	TGT	2	6	1682440	1682445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_014931	CGC	2	6	1682467	1682472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_014931	TGC	2	6	1682479	1682484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_014931	GTC	2	6	1683454	1683459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_014931	ATG	2	6	1688243	1688248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014931	CAT	2	6	1688283	1688288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_014931	TTG	2	6	1689195	1689200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014931	GCTT	2	8	1689206	1689213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_014931	GAC	2	6	1692561	1692566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_014931	AAG	2	6	1692652	1692657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014931	G	6	6	1692739	1692744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014931	CG	3	6	1692745	1692750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_014931	CAG	2	6	1692818	1692823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_014931	CAACA	2	10	1692827	1692836	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_014931	CCG	2	6	1692853	1692858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_014931	CGGC	2	8	1698795	1698802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_014931	GC	3	6	1698801	1698806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_014931	CG	4	8	1699413	1699420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_014931	CCG	2	6	1699421	1699426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_014931	AGC	2	6	1699429	1699434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014931	T	6	6	1699479	1699484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014931	TCAC	2	8	1699514	1699521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_014931	CCAAGG	2	12	1699734	1699745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_014931	CTT	2	6	1699796	1699801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_014931	CTG	2	6	1699814	1699819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014931	TGCGA	2	10	1701885	1701894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3115	NC_014931	CGGC	2	8	1703998	1704005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_014931	CT	3	6	1705322	1705327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_014931	TGAA	2	8	1706506	1706513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_014931	CG	3	6	1707181	1707186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_014931	TGT	2	6	1708343	1708348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014931	CT	3	6	1708357	1708362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_014931	GAAA	2	8	1708371	1708378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014931	GCC	2	6	1709874	1709879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_014931	T	7	7	1709917	1709923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014931	ACG	2	6	1709933	1709938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014931	A	7	7	1709956	1709962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014931	TTTG	2	8	1709987	1709994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014931	GCG	2	6	1710049	1710054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_014931	CAG	2	6	1710106	1710111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_014931	GTT	2	6	1710141	1710146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014931	TA	3	6	1710181	1710186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014931	TGT	2	6	1710194	1710199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014931	ACT	2	6	1710273	1710278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_014931	TTG	2	6	1710293	1710298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014931	AGA	2	6	1710316	1710321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014931	T	6	6	1710329	1710334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_014931	CGCT	2	8	1710341	1710348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3138	NC_014931	TCAA	2	8	1722066	1722073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_014931	CTG	2	6	1722123	1722128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_014931	ATC	2	6	1728476	1728481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3142	NC_014931	AAAC	3	12	1729080	1729091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3143	NC_014931	AAAAG	2	10	1729092	1729101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_014931	GTC	2	6	1729156	1729161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3152	NC_014931	TCG	2	6	1737963	1737968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3155	NC_014931	A	6	6	1742344	1742349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_014931	T	6	6	1742366	1742371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3161	NC_014931	TTG	2	6	1747487	1747492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_014931	TCT	2	6	1747526	1747531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3163	NC_014931	AAC	2	6	1747543	1747548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3166	NC_014931	CGGT	2	8	1747666	1747673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3221	NC_014931	ATGC	2	8	1774265	1774272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3241	NC_014931	CTT	2	6	1788735	1788740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_014931	GCGT	2	8	1790927	1790934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3245	NC_014931	TCAA	2	8	1791045	1791052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3246	NC_014931	A	6	6	1791465	1791470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_014931	T	6	6	1791485	1791490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_014931	TGC	2	6	1791497	1791502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_014931	CGG	2	6	1791520	1791525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_014931	GAT	2	6	1791901	1791906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_014931	GCA	2	6	1791907	1791912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_014931	GGCC	2	8	1791932	1791939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3253	NC_014931	GCC	2	6	1793549	1793554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_014931	CTC	2	6	1793606	1793611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_014931	TCA	2	6	1795020	1795025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_014931	AC	3	6	1795492	1795497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_014931	GC	4	8	1796905	1796912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_014931	TGGC	2	8	1800383	1800390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_014931	GAT	2	6	1800405	1800410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_014931	GCC	2	6	1800411	1800416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3261	NC_014931	GCC	2	6	1800428	1800433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_014931	GATCA	2	10	1800468	1800477	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3263	NC_014931	GCT	2	6	1801605	1801610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3349	NC_014931	GAAAA	2	10	1854942	1854951	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3390	NC_014931	GCG	2	6	1892973	1892978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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