MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014931	TCG	2	6	6094941	6094946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_014931	CCA	2	6	6094957	6094962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_014931	GCG	2	6	6094986	6094991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_014931	TTC	2	6	6095133	6095138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_014931	ACC	2	6	6095552	6095557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_014931	A	8	8	6096496	6096503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_014931	T	6	6	6096522	6096527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_014931	TGAA	2	8	6097254	6097261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_014931	GAA	3	9	6097259	6097267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_014931	AGA	2	6	6097270	6097275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_014931	TGT	2	6	6097283	6097288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_014931	ATG	2	6	6097911	6097916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_014931	AGG	2	6	6097959	6097964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_014931	GT	3	6	6099864	6099869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_014931	CGGCAC	2	12	6099895	6099906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_014931	CAA	2	6	6103023	6103028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_014931	GCTT	2	8	6103055	6103062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11518	NC_014931	GGC	2	6	6103065	6103070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_014931	GCGCT	2	10	6103074	6103083	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11520	NC_014931	GTGCG	2	10	6103908	6103917	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11521	NC_014931	GGGC	2	8	6103918	6103925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11522	NC_014931	GCC	2	6	6103937	6103942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_014931	GAG	2	6	6103943	6103948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_014931	AGCGA	2	10	6103985	6103994	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11525	NC_014931	CGGC	2	8	6104043	6104050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_014931	CCGCA	2	10	6104069	6104078	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11527	NC_014931	CCTGC	2	10	6107774	6107783	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11528	NC_014931	GGC	2	6	6107788	6107793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_014931	GCG	2	6	6107814	6107819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_014931	GCAT	2	8	6107835	6107842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11531	NC_014931	GGCG	2	8	6108845	6108852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11532	NC_014931	GTCGAA	2	12	6110330	6110341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11533	NC_014931	AG	3	6	6110343	6110348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_014931	CCG	2	6	6110361	6110366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_014931	CGG	2	6	6110408	6110413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_014931	GCT	2	6	6110423	6110428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_014931	CGG	3	9	6110451	6110459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_014931	CCCG	2	8	6110469	6110476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11539	NC_014931	C	7	7	6110477	6110483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11540	NC_014931	AAC	2	6	6111379	6111384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_014931	CTT	2	6	6112252	6112257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_014931	CG	3	6	6112262	6112267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_014931	CGC	2	6	6112330	6112335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11544	NC_014931	CCG	3	9	6112391	6112399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_014931	CGG	2	6	6112432	6112437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_014931	GCG	2	6	6112517	6112522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_014931	CCGCG	2	10	6112536	6112545	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11548	NC_014931	GCAG	2	8	6112586	6112593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_014931	GAT	2	6	6112618	6112623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_014931	GGT	2	6	6112669	6112674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_014931	GC	3	6	6112692	6112697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_014931	GCGAC	2	10	6112842	6112851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11553	NC_014931	CG	4	8	6112933	6112940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11554	NC_014931	CGG	2	6	6112942	6112947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_014931	AAG	2	6	6113012	6113017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_014931	GC	3	6	6113022	6113027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_014931	ACG	2	6	6113028	6113033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_014931	GCG	2	6	6113083	6113088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_014931	CG	3	6	6113087	6113092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_014931	GCG	3	9	6113196	6113204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_014931	CG	3	6	6113230	6113235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11562	NC_014931	CGG	2	6	6113257	6113262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_014931	GCA	2	6	6113278	6113283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_014931	GCG	3	9	6113320	6113328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_014931	GCT	2	6	6113360	6113365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_014931	TGG	2	6	6113391	6113396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_014931	GC	3	6	6113427	6113432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_014931	CGC	2	6	6113492	6113497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11569	NC_014931	GGC	2	6	6113507	6113512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_014931	TTC	3	9	6113589	6113597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_014931	AC	3	6	6114426	6114431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_014931	TCCA	2	8	6114483	6114490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11573	NC_014931	CTTTTG	2	12	6115023	6115034	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11574	NC_014931	CAA	2	6	6115091	6115096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_014931	TCG	2	6	6115097	6115102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_014931	TCT	2	6	6116148	6116153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_014931	CTTC	2	8	6116635	6116642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_014931	GCC	2	6	6116667	6116672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11579	NC_014931	CCGG	2	8	6116694	6116701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_014931	TGG	2	6	6116703	6116708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_014931	CG	4	8	6116750	6116757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11582	NC_014931	GGGCCT	2	12	6116767	6116778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_014931	T	6	6	6116808	6116813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_014931	GA	4	8	6116836	6116843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_014931	GCG	2	6	6118037	6118042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_014931	GCG	2	6	6120684	6120689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_014931	GA	4	8	6120692	6120699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_014931	TCGC	2	8	6122786	6122793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_014931	CTT	2	6	6122872	6122877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_014931	GTCC	2	8	6125160	6125167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_014931	GCC	2	6	6125197	6125202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_014931	CAT	2	6	6126795	6126800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_014931	TTCG	2	8	6128584	6128591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11594	NC_014931	GGC	4	12	6128604	6128615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_014931	GC	3	6	6128627	6128632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_014931	TC	3	6	6128652	6128657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_014931	TTC	2	6	6131488	6131493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_014931	TC	3	6	6131492	6131497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11599	NC_014931	ATGA	2	8	6131507	6131514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_014931	CTG	2	6	6131535	6131540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_014931	CGC	2	6	6134052	6134057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11602	NC_014931	CA	3	6	6135951	6135956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_014931	T	6	6	6136449	6136454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_014931	GA	3	6	6136480	6136485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_014931	T	6	6	6136490	6136495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_014931	CTCC	2	8	6136506	6136513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11607	NC_014931	ATC	2	6	6136514	6136519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_014931	CAA	2	6	6136975	6136980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_014931	T	6	6	6137007	6137012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_014931	TCA	2	6	6137068	6137073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_014931	GGC	2	6	6138243	6138248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_014931	ATCGA	2	10	6140199	6140208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11613	NC_014931	ATC	2	6	6140236	6140241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_014931	CAA	2	6	6140249	6140254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_014931	GCG	2	6	6140256	6140261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_014931	GCA	2	6	6145553	6145558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_014931	GCG	2	6	6145559	6145564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_014931	GCTT	2	8	6151788	6151795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11619	NC_014931	CGGCG	2	10	6151805	6151814	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11620	NC_014931	GC	3	6	6156835	6156840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_014931	CGG	2	6	6156866	6156871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_014931	CGCGG	2	10	6158244	6158253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11623	NC_014931	CAG	2	6	6158839	6158844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_014931	CGC	2	6	6158845	6158850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_014931	ACG	2	6	6158855	6158860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_014931	GCT	2	6	6158861	6158866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_014931	GTG	2	6	6158876	6158881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_014931	GA	3	6	6160932	6160937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11630	NC_014931	A	6	6	6160955	6160960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12000	NC_014931	CG	3	6	6366902	6366907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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