MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014931	GCC	2	6	238972	238977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_014931	GCA	2	6	238978	238983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014931	GCA	2	6	238987	238992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014931	CGC	2	6	238995	239000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_014931	AGC	2	6	239007	239012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014931	CTG	2	6	239015	239020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014931	CAA	2	6	239040	239045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014931	ACC	2	6	240401	240406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_014931	TTC	2	6	240414	240419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014931	TTC	2	6	240430	240435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014931	T	8	8	240503	240510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014931	CCG	2	6	241506	241511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_014931	CTC	2	6	241550	241555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_014931	CAC	2	6	241623	241628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_014931	TG	3	6	241639	241644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014931	AGG	3	9	241679	241687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014931	GCGG	2	8	242655	242662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
518	NC_014931	CCG	2	6	242669	242674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_014931	GCG	2	6	242692	242697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014931	A	6	6	242699	242704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014931	GCC	2	6	242718	242723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_014931	CGC	2	6	242779	242784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_014931	AAC	3	9	244289	244297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014931	GAC	2	6	245407	245412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014931	CAG	2	6	246680	246685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014931	CG	3	6	246705	246710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_014931	GCG	2	6	246721	246726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014931	CAT	2	6	246727	246732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014931	GGC	2	6	246733	246738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_014931	GC	3	6	248635	248640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_014931	GCTG	2	8	249982	249989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
532	NC_014931	CTG	2	6	250001	250006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014931	ACG	2	6	250062	250067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_014931	GT	3	6	252981	252986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014931	TCTTT	2	10	253001	253010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
536	NC_014931	CGG	2	6	253023	253028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014931	GCG	2	6	254000	254005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014931	GCCG	2	8	254035	254042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_014931	AC	3	6	254068	254073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_014931	CGC	2	6	254136	254141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_014931	GCG	2	6	254193	254198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014931	TC	4	8	257009	257016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_014931	GTG	3	9	257020	257028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014931	TCTT	2	8	258465	258472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_014931	G	6	6	263324	263329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014931	TG	5	10	264349	264358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014931	A	7	7	264364	264370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014931	TCA	3	9	266215	266223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014931	AATG	2	8	266241	266248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014931	TTTC	2	8	266253	266260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_014931	TCA	2	6	266272	266277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014931	CATT	2	8	267698	267705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_014931	A	7	7	267710	267716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014931	GC	3	6	267723	267728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_014931	GC	3	6	267734	267739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_014931	GCC	2	6	268252	268257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_014931	GGT	2	6	268309	268314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014931	GCG	2	6	268394	268399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014931	TCC	2	6	269776	269781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_014931	GC	3	6	269851	269856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_014931	CCG	2	6	269871	269876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_014931	CTGTT	2	10	269877	269886	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
563	NC_014931	TCC	2	6	271259	271264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_014931	GAA	2	6	271275	271280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014931	CATC	2	8	271294	271301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_014931	CTG	2	6	272524	272529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014931	GCT	2	6	272600	272605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_014931	TTC	2	6	272615	272620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014931	CTG	2	6	273732	273737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014931	GCT	2	6	273774	273779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014931	CGC	2	6	273797	273802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014931	GCA	2	6	273813	273818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014931	GGCC	2	8	273832	273839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_014931	CGGC	2	8	273863	273870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_014931	GCC	2	6	273896	273901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014931	GCC	2	6	273968	273973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_014931	CCTGA	2	10	275221	275230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
578	NC_014931	GTC	2	6	280035	280040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014931	GAT	2	6	283828	283833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014931	GAC	2	6	283869	283874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014931	AATG	2	8	283892	283899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014931	CAG	2	6	283913	283918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014931	GCC	2	6	285361	285366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_014931	CGGC	2	8	285375	285382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_014931	CTCCCT	2	12	286310	286321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_014931	CGG	2	6	286376	286381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014931	CCTCAC	2	12	286384	286395	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_014931	TC	3	6	286429	286434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_014931	TTGC	2	8	286475	286482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_014931	ACGG	2	8	291296	291303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_014931	T	6	6	291308	291313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014931	CTCC	2	8	293581	293588	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
593	NC_014931	TGGGG	2	10	293605	293614	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014931	ACG	2	6	293617	293622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014931	CTCA	2	8	293626	293633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_014931	GGAAGG	2	12	293680	293691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014931	GGGA	2	8	299422	299429	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014931	GTGTC	2	10	300407	300416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
599	NC_014931	GATC	2	8	304958	304965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_014931	A	6	6	308265	308270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014931	TAT	2	6	308328	308333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014931	CGA	2	6	308420	308425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014931	CAT	2	6	309519	309524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014931	CGGC	2	8	309525	309532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_014931	CAC	2	6	309572	309577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_014931	GC	4	8	311120	311127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_014931	GGGTGA	2	12	313149	313160	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014931	CG	3	6	313175	313180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_014931	AAC	2	6	313235	313240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_014931	TGGG	2	8	314535	314542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014931	TGG	2	6	314557	314562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014931	GCG	2	6	314607	314612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014931	GGTG	2	8	314635	314642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014931	GT	3	6	314647	314652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014931	TGCG	2	8	314661	314668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_014931	CG	3	6	316995	317000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_014931	TGTCTT	2	12	318947	318958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_014931	GCG	2	6	318998	319003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014931	CTGC	2	8	319019	319026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_014931	CCCCA	2	10	319027	319036	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
621	NC_014931	GGGA	2	8	319052	319059	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014931	TG	3	6	320051	320056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014931	CTT	2	6	320153	320158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014931	GAAC	2	8	320162	320169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_014931	GCA	2	6	321842	321847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_014931	AGG	2	6	322373	322378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014931	CCA	2	6	322430	322435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_014931	CAG	2	6	322445	322450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_014931	CGC	2	6	322484	322489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_014931	CACC	2	8	322502	322509	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
631	NC_014931	GC	3	6	322519	322524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_014931	GGGC	2	8	322526	322533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014931	GC	3	6	322790	322795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_014931	TCA	2	6	323492	323497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_014931	GGA	2	6	326497	326502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014931	CG	3	6	326539	326544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_014931	T	6	6	326612	326617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014931	GCG	2	6	327563	327568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014931	AAGAA	2	10	329794	329803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_014931	A	6	6	399490	399495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_014931	CCG	3	9	400283	400291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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