MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014931	GA	3	6	3010796	3010801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014931	ACCTG	2	10	3010831	3010840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_014931	TGAA	2	8	3011619	3011626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014931	TCG	2	6	3011931	3011936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014931	GCT	2	6	3011975	3011980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_014931	CGG	2	6	3011986	3011991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014931	CGG	2	6	3012022	3012027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014931	GGC	2	6	3012038	3012043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014931	GGC	2	6	3012059	3012064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014931	TGC	2	6	3012079	3012084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_014931	GCG	2	6	3012604	3012609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014931	CGG	2	6	3012642	3012647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014931	CAGC	2	8	3014720	3014727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_014931	CGG	2	6	3014740	3014745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014931	GGGC	2	8	3014756	3014763	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_014931	ACGC	2	8	3014771	3014778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_014931	TC	4	8	3018015	3018022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_014931	TGT	2	6	3018031	3018036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014931	GA	3	6	3018897	3018902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014931	TCC	2	6	3021230	3021235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_014931	AGGC	2	8	3021252	3021259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_014931	CAGA	2	8	3025452	3025459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_014931	TGC	2	6	3025477	3025482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014931	GC	3	6	3025498	3025503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_014931	AAGG	2	8	3025608	3025615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014931	CGA	2	6	3025634	3025639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014931	GCC	2	6	3025684	3025689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_014931	GCCGC	2	10	3025712	3025721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6029	NC_014931	GC	3	6	3025720	3025725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_014931	CGC	2	6	3025745	3025750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_014931	CGA	2	6	3025755	3025760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_014931	GAC	2	6	3025773	3025778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014931	CTT	2	6	3029737	3029742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014931	GGCG	2	8	3029753	3029760	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_014931	TGT	2	6	3029939	3029944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014931	GC	3	6	3029973	3029978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_014931	GCC	2	6	3029992	3029997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_014931	CGG	2	6	3030002	3030007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014931	GCTT	2	8	3030043	3030050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_014931	CGA	2	6	3030111	3030116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014931	GCC	2	6	3030124	3030129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_014931	GAA	2	6	3030139	3030144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014931	CGG	2	6	3030171	3030176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_014931	GAA	2	6	3030181	3030186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014931	TC	3	6	3030198	3030203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_014931	GGCG	2	8	3030214	3030221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_014931	GCT	4	12	3030223	3030234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014931	GAT	2	6	3030250	3030255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014931	GCG	2	6	3030310	3030315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014931	GCA	2	6	3030330	3030335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_014931	GTG	2	6	3030383	3030388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014931	CAG	2	6	3030397	3030402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014931	CGA	2	6	3030411	3030416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014931	CGA	2	6	3030429	3030434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014931	TGA	2	6	3030450	3030455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014931	GCGG	2	8	3030457	3030464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_014931	A	7	7	3035688	3035694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014931	GC	3	6	3038135	3038140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_014931	T	6	6	3038158	3038163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014931	CG	3	6	3039427	3039432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_014931	CTG	2	6	3039439	3039444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014931	AAAAG	2	10	3039446	3039455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014931	T	6	6	3039469	3039474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014931	TCA	2	6	3039512	3039517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_014931	CCA	2	6	3039945	3039950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_014931	GCG	2	6	3040804	3040809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014931	TAGCG	2	10	3041237	3041246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_014931	GAC	2	6	3041279	3041284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014931	A	6	6	3041789	3041794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014931	CTT	2	6	3041820	3041825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_014931	CAAT	2	8	3041856	3041863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_014931	CTGA	2	8	3042943	3042950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_014931	CTC	2	6	3043382	3043387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_014931	T	6	6	3043388	3043393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014931	GC	3	6	3043405	3043410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_014931	GCC	2	6	3043479	3043484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_014931	TTC	2	6	3043518	3043523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014931	GAAT	2	8	3046746	3046753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014931	GGC	2	6	3046779	3046784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_014931	CGC	2	6	3049453	3049458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_014931	AGA	3	9	3053180	3053188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014931	CGGG	2	8	3054446	3054453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_014931	T	7	7	3054467	3054473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014931	GTG	2	6	3055240	3055245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014931	CCT	2	6	3062923	3062928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_014931	ACA	2	6	3062934	3062939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014931	GC	3	6	3063880	3063885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_014931	GCG	2	6	3065334	3065339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_014931	CAA	2	6	3065361	3065366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_014931	A	6	6	3065365	3065370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014931	ACC	2	6	3065407	3065412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_014931	ACAA	2	8	3065845	3065852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_014931	GTT	2	6	3065862	3065867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014931	GGGC	2	8	3066732	3066739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_014931	A	6	6	3067746	3067751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_014931	CTT	2	6	3069646	3069651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014931	GGTG	2	8	3069663	3069670	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_014931	CGGC	2	8	3069695	3069702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_014931	A	6	6	3073650	3073655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_014931	GTT	2	6	3073675	3073680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014931	C	6	6	3073744	3073749	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6102	NC_014931	CACC	2	8	3073867	3073874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6103	NC_014931	ACA	2	6	3073876	3073881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_014931	GATC	2	8	3073897	3073904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_014931	CCTA	2	8	3074017	3074024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_014931	GCG	2	6	3074081	3074086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_014931	ACA	2	6	3074108	3074113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014931	GAA	3	9	3076904	3076912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014931	CG	3	6	3076964	3076969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_014931	TCGGA	2	10	3077678	3077687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6111	NC_014931	GCG	2	6	3077692	3077697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014931	CGC	2	6	3077708	3077713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6114	NC_014931	GGCGG	2	10	3083313	3083322	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6115	NC_014931	GCT	2	6	3086851	3086856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_014931	GTGTG	2	10	3086860	3086869	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014931	CG	4	8	3086870	3086877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_014931	TGA	2	6	3087881	3087886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014931	GGA	2	6	3087890	3087895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_014931	A	6	6	3087900	3087905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014931	CTT	2	6	3090921	3090926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014931	GCG	2	6	3090961	3090966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014931	TGA	2	6	3092273	3092278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_014931	TTA	2	6	3106704	3106709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014931	AAT	2	6	3106782	3106787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_014931	TGC	2	6	3106789	3106794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_014931	AGC	2	6	3106868	3106873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014931	G	6	6	3106902	3106907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_014931	AGAA	2	8	3106941	3106948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014931	GCG	2	6	3106954	3106959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_014931	A	6	6	3108057	3108062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6262	NC_014931	GCCAGC	2	12	3203553	3203564	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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6265	NC_014931	TGTC	2	8	3205166	3205173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6300	NC_014931	GGTTC	2	10	3221149	3221158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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