MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vulcanisaeta distributa DSM 14429 chromosome

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014537	ATTAT	2	10	14911	14920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014537	CCTAA	2	10	17941	17950	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014537	AAATT	2	10	52195	52204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014537	TAACT	2	10	52558	52567	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014537	TATAT	2	10	81186	81195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014537	AACAC	2	10	92064	92073	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014537	CTTAC	2	10	92158	92167	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014537	TTACT	2	10	102469	102478	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014537	TTTCT	2	10	103472	103481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014537	AATTC	2	10	110946	110955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014537	ATGCA	2	10	111031	111040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014537	CAAAA	2	10	118499	118508	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014537	TGGTT	2	10	125485	125494	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014537	AGGCC	2	10	125707	125716	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014537	CCCCA	2	10	125869	125878	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_014537	AGGCA	2	10	135266	135275	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014537	TGAGG	2	10	135496	135505	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014537	GAATT	2	10	136228	136237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014537	TTGTT	2	10	160102	160111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014537	TTTTA	2	10	201935	201944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014537	CATAT	2	10	224723	224732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014537	GTAGG	2	10	237254	237263	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014537	GCTAA	2	10	243829	243838	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014537	CTGCC	2	10	244478	244487	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_014537	TTTTA	2	10	245229	245238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014537	AACAT	2	10	248578	248587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014537	AATTC	2	10	249368	249377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014537	ATTAA	2	10	261889	261898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014537	TAAAA	2	10	265048	265057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014537	TTGGT	2	10	267239	267248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014537	TAAGA	2	10	275395	275404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014537	ATTTT	2	10	275775	275784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014537	ATACG	2	10	276248	276257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014537	CTACA	2	10	287771	287780	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014537	TACCA	2	10	288493	288502	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014537	TATTT	2	10	302977	302986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014537	CAGTA	2	10	309417	309426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014537	TCTAT	2	10	323214	323223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014537	ATTAA	2	10	335701	335710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014537	GAAAA	2	10	341443	341452	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014537	ACTTA	2	10	354265	354274	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014537	AGGAT	2	10	374430	374439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014537	TTAAA	2	10	375235	375244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014537	TGTTA	2	10	384754	384763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014537	CAAAT	2	10	387092	387101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014537	TTAAA	2	10	411105	411114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014537	ACTTA	2	10	413980	413989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014537	TAATT	2	10	450038	450047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014537	GGGTA	2	10	468240	468249	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014537	GCCAC	2	10	470210	470219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014537	TGGTG	2	10	473711	473720	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014537	TAAAC	2	10	479727	479736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014537	CAATG	2	10	484143	484152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014537	TTAGG	2	10	497326	497335	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014537	TTTAC	2	10	504194	504203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014537	ATTAA	2	10	538599	538608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014537	TTAAA	2	10	543590	543599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014537	CCACC	2	10	548030	548039	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_014537	GGTGG	2	10	548124	548133	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014537	CGGGT	2	10	553004	553013	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014537	ATATG	2	10	566952	566961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014537	CCTCG	2	10	573654	573663	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014537	ACATT	2	10	582008	582017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014537	ATTAA	2	10	584716	584725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014537	TATAC	2	10	591402	591411	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014537	CATTT	2	10	597076	597085	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014537	AAACC	2	10	604145	604154	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014537	GCATT	2	10	620356	620365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014537	AGTAA	2	10	622138	622147	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014537	AATTC	2	10	627559	627568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014537	GAAAA	2	10	628207	628216	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014537	CCCCA	2	10	628426	628435	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_014537	CCGGG	2	10	629280	629289	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014537	CACGG	2	10	629866	629875	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014537	TTTGG	2	10	631153	631162	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014537	CGAGC	2	10	631386	631395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014537	TGGTT	2	10	633078	633087	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014537	TGAGA	2	10	644816	644825	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014537	TAATT	2	10	644925	644934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014537	CGTGG	2	10	645214	645223	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014537	GTTGA	2	10	654076	654085	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014537	AGATG	2	10	655072	655081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014537	CGAGC	2	10	655207	655216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014537	TGAGT	2	10	668269	668278	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014537	ATGAG	2	10	686190	686199	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014537	TCGGT	2	10	686555	686564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014537	ACACA	2	10	688293	688302	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014537	AATTT	2	10	697902	697911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014537	TAAAT	2	10	705962	705971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014537	TTTAC	2	10	719078	719087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014537	CTTAA	2	10	725929	725938	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014537	ATTAA	2	10	737497	737506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014537	GGGGT	2	10	740088	740097	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014537	TGCCC	2	10	740344	740353	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014537	TGAAA	2	10	741593	741602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014537	CGCAA	2	10	749913	749922	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014537	GATAA	2	10	753569	753578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014537	ACAAA	2	10	754677	754686	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014537	TTTAT	2	10	773888	773897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014537	TTAAT	2	10	786731	786740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014537	TTCTT	2	10	793209	793218	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014537	ATTTT	2	10	813404	813413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014537	TCCTT	2	10	829531	829540	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014537	CCGGG	2	10	834995	835004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014537	AGATT	2	10	838903	838912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014537	GTTGG	2	10	843864	843873	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014537	CATTA	2	10	847150	847159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014537	TATGT	2	10	865942	865951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014537	GTTTA	2	10	870192	870201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014537	AGGTG	2	10	882171	882180	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014537	AATTA	2	10	887272	887281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014537	ATTTA	2	10	900149	900158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014537	TTATT	2	10	906391	906400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014537	ATGCA	2	10	922604	922613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014537	ATTTT	2	10	949744	949753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014537	ATGGT	2	10	955423	955432	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014537	TTAAT	2	10	955437	955446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014537	AGAAT	2	10	957190	957199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014537	CATTA	2	10	961304	961313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014537	GAAAG	2	10	982283	982292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014537	TTTGT	2	10	995342	995351	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014537	CAGTT	2	10	1000078	1000087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014537	TAATG	2	10	1001134	1001143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014537	TAACA	2	10	1002305	1002314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014537	AGTTA	2	10	1012501	1012510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014537	TAATT	2	10	1031695	1031704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014537	AAAAT	2	10	1032249	1032258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014537	TTTTA	2	10	1044262	1044271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014537	ACCCA	2	10	1055494	1055503	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014537	TCAAT	2	10	1075099	1075108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014537	AAATA	2	10	1079835	1079844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014537	AGGTT	2	10	1083619	1083628	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014537	AATTC	2	10	1084857	1084866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014537	GTGAA	2	10	1087398	1087407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014537	AGCAA	2	10	1091246	1091255	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014537	AAACC	2	10	1102571	1102580	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014537	GAAAG	2	10	1102780	1102789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014537	AGTTA	2	10	1111470	1111479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014537	ATGTA	2	10	1113198	1113207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014537	TTATT	2	10	1120677	1120686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014537	TCATC	2	10	1125788	1125797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014537	AATGT	2	10	1125836	1125845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014537	TTTGT	2	10	1125910	1125919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014537	TTAAT	2	10	1129750	1129759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014537	TACTT	2	10	1131633	1131642	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014537	AATTA	2	10	1131681	1131690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014537	CCTTG	2	10	1162437	1162446	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014537	AATAA	2	10	1183995	1184004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014537	TTAAG	2	10	1193862	1193871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014537	ATTAT	2	10	1193928	1193937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014537	ACCTA	2	10	1201497	1201506	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_014537	TCGAG	2	10	1226100	1226109	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_014537	TAAAA	2	10	1287894	1287903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014537	TTAAG	2	10	1305036	1305045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014537	TTCAC	2	10	1311425	1311434	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_014537	TGGTT	2	10	1361379	1361388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014537	AAATT	2	10	1375136	1375145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014537	TTTAA	2	10	1390243	1390252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_014537	GAAAA	2	10	1391730	1391739	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_014537	TATAA	2	10	1450278	1450287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014537	AATTC	2	10	1504022	1504031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_014537	TAGTA	2	10	1573419	1573428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014537	GCACG	2	10	1602822	1602831	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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255	NC_014537	TTAAA	2	10	2301212	2301221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_014537	CGATG	2	10	2339856	2339865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_014537	ACTCA	2	10	2350635	2350644	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_014537	GGTGT	2	10	2350703	2350712	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
263	NC_014537	ACTCG	2	10	2350942	2350951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_014537	TCCAG	2	10	2354265	2354274	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_014537	ACCCC	2	10	2356458	2356467	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
266	NC_014537	CTTTG	2	10	2356655	2356664	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014537	ACGCA	2	10	2360105	2360114	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.