MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio sp. Ex25 chromosome 2

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013457	AGAAAA	2	12	2828	2839	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013457	ATCAAA	2	12	49965	49976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013457	AAGCTT	2	12	56526	56537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013457	TTCATA	2	12	72759	72770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013457	TCTTTC	2	12	72900	72911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013457	AAAACC	2	12	107972	107983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013457	AAATTA	2	12	148155	148166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013457	TCACAC	2	12	206947	206958	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013457	CCAATT	2	12	218265	218276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013457	TTATCT	2	12	224232	224243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013457	TTTTTG	2	12	258310	258321	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013457	TAATTT	2	12	269421	269432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013457	AAAAAC	2	12	269580	269591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013457	AATTTA	2	12	320062	320073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013457	GTTTTT	2	12	342816	342827	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013457	ACTTAG	2	12	389278	389289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013457	AACCAA	2	12	392949	392960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013457	TTAACG	2	12	426621	426632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013457	CAAAGC	2	12	482920	482931	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013457	ATTCTA	2	12	484031	484042	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013457	AAATTA	2	12	558297	558308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013457	AATCTG	2	12	564724	564735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013457	ATATGT	2	12	568005	568016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013457	GCTTTG	2	12	587951	587962	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013457	ATTTTT	2	12	595555	595566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013457	TACTTC	2	12	598085	598096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013457	TTTATA	2	12	622832	622843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013457	TGTTCA	2	12	647787	647798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013457	AGAATA	2	12	672319	672330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013457	CAAATT	2	12	686484	686495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013457	ATAAAA	2	12	691702	691713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013457	ATAACG	2	12	787661	787672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013457	TAAAGT	2	12	827739	827750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013457	CTCTTC	2	12	831547	831558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013457	AAAAAT	2	12	834359	834370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013457	AAACGA	2	12	835620	835631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013457	AACCAT	2	12	891329	891340	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013457	TAAAAT	2	12	913423	913434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013457	CCAATC	2	12	918813	918824	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013457	GAAAAA	2	12	921920	921931	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013457	ATAAAA	2	12	924874	924885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013457	TTTGCA	2	12	975644	975655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013457	ATCGTT	2	12	980508	980519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013457	ATTTCA	2	12	985678	985689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013457	AATAAA	2	12	1052640	1052651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013457	AATACC	2	12	1095487	1095498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013457	TGATAA	2	12	1118488	1118499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013457	TTTAAG	2	12	1124105	1124116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013457	ATCTTT	2	12	1153257	1153268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013457	TATCTT	2	12	1229624	1229635	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013457	TAGTTT	2	12	1255374	1255385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013457	ATGCAA	2	12	1259617	1259628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013457	AGAAAA	2	12	1321829	1321840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013457	TATTGG	2	12	1382170	1382181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013457	TATGAA	2	12	1390612	1390623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013457	TTCGTT	2	12	1416245	1416256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013457	AGAGTG	2	12	1524041	1524052	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013457	TTTTTA	2	12	1528479	1528490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013457	GTTTAT	2	12	1557482	1557493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013457	GAAAAA	2	12	1558439	1558450	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013457	TCAATA	2	12	1561172	1561183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013457	TTTTGG	2	12	1577219	1577230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013457	AAAAGC	2	12	1657887	1657898	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013457	ATTGAA	2	12	1676608	1676619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013457	ATTTAG	2	12	1676632	1676643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013457	CATTAA	2	12	1683735	1683746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013457	AAACGG	2	12	1698353	1698364	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013457	CCAATG	2	12	1770175	1770186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013457	AAAAGA	2	12	1810591	1810602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.