MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio sp. Ex25 chromosome 2

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013457	ACAGT	2	10	1695	1704	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013457	TCGTG	2	10	6464	6473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013457	AATTA	2	10	30006	30015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013457	ATTAA	2	10	39156	39165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013457	TGAAG	2	10	49475	49484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013457	AACGC	2	10	59905	59914	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013457	GTTAT	2	10	61287	61296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013457	TTTAA	2	10	68727	68736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013457	TTGCT	2	10	69065	69074	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013457	CGAAA	2	10	73014	73023	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013457	ACTCA	2	10	83152	83161	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013457	AGTAT	2	10	97414	97423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013457	AATTA	2	10	111168	111177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013457	TGTTT	2	10	115576	115585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013457	GGTTA	2	10	139131	139140	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013457	ATTAA	2	10	139267	139276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013457	TAGAG	2	10	140411	140420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013457	AATTA	2	10	148230	148239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013457	AAATC	2	10	148313	148322	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013457	ATCAT	2	10	155335	155344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013457	TAAAA	2	10	162540	162549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013457	TGATG	2	10	165224	165233	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013457	GTCTG	2	10	165276	165285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013457	TTTCA	2	10	171328	171337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013457	GTTTA	2	10	172659	172668	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013457	TAAAA	2	10	179106	179115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013457	TCTTA	2	10	192855	192864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013457	CAAAA	2	10	193770	193779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013457	ACATT	2	10	196004	196013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013457	ATTAT	2	10	201455	201464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013457	TTGCT	2	10	219344	219353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013457	TTTTG	2	10	222195	222204	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013457	TAGGC	2	10	239887	239896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013457	AATAA	2	10	271882	271891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013457	AAAGC	2	10	299985	299994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013457	TTTCC	2	10	302340	302349	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013457	GAAAT	2	10	307032	307041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013457	GCTAA	2	10	313087	313096	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013457	GCTTC	2	10	315074	315083	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013457	TTGAT	2	10	321723	321732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013457	AAATA	2	10	339690	339699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013457	CTTCT	2	10	382086	382095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013457	GATTC	2	10	392534	392543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013457	ATGAA	2	10	392844	392853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013457	CTTTT	2	10	393872	393881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013457	GAGAT	2	10	401734	401743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013457	TCAGC	2	10	402024	402033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013457	ACTCT	2	10	408756	408765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013457	TTATT	2	10	418449	418458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013457	AGTAC	2	10	482352	482361	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013457	TTATT	2	10	482940	482949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013457	TAATT	2	10	493243	493252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013457	TGTTT	2	10	514218	514227	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013457	ATTAT	2	10	537949	537958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013457	ATTTA	2	10	558341	558350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013457	CATTT	2	10	558631	558640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013457	TTTTA	2	10	565202	565211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013457	CTTAA	2	10	565260	565269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013457	ATAGT	2	10	566876	566885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013457	TTAAA	2	10	571724	571733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013457	CGTTT	2	10	575936	575945	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013457	CAAAA	2	10	579414	579423	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013457	AACGT	2	10	581478	581487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013457	GCTCC	2	10	588060	588069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013457	GTTTG	2	10	588462	588471	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013457	GCTTG	2	10	589076	589085	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013457	TTTTA	2	10	622464	622473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013457	TTTTA	2	10	622952	622961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013457	CGAGT	2	10	627735	627744	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013457	ACTCG	2	10	627751	627760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013457	ACTAG	2	10	645590	645599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013457	CATTA	2	10	658733	658742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013457	AAATC	2	10	659876	659885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013457	TTTTC	2	10	661504	661513	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013457	ATAAA	2	10	664770	664779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013457	CCAAA	2	10	664817	664826	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013457	TTTTC	2	10	664845	664854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013457	GGGCG	2	10	672199	672208	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013457	TGTTT	2	10	674288	674297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013457	TCATT	2	10	675302	675311	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013457	CGCCT	2	10	675810	675819	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013457	CTTTT	2	10	684179	684188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013457	TTTCT	2	10	689909	689918	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013457	ATCTT	2	10	691276	691285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013457	CAATT	2	10	691613	691622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013457	ATTTA	2	10	691714	691723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013457	GTTAG	2	10	693689	693698	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013457	TGTTA	2	10	705888	705897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013457	TATAA	2	10	705919	705928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013457	AGCAC	2	10	709434	709443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_013457	TCTTT	2	10	712114	712123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013457	GTTAC	2	10	763484	763493	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013457	TCACT	2	10	802341	802350	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013457	CTTCA	2	10	821500	821509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013457	AGACT	2	10	827709	827718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013457	ATTGA	2	10	838088	838097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013457	AACAT	2	10	838845	838854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013457	TAAAA	2	10	839635	839644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013457	AGGTA	2	10	858598	858607	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013457	CGCTT	2	10	858800	858809	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013457	CAATA	2	10	859688	859697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013457	CGTTG	2	10	869649	869658	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013457	GTTTT	2	10	874447	874456	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013457	ATTTA	2	10	893128	893137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013457	TAAGG	2	10	896097	896106	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013457	TGCTC	2	10	900147	900156	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013457	TAAAA	2	10	905820	905829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013457	TAAAA	2	10	905904	905913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013457	TATTG	2	10	905950	905959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013457	GGTCC	2	10	922061	922070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013457	GAAGA	2	10	934048	934057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013457	CGTGC	2	10	948995	949004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013457	AGCCC	2	10	957483	957492	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_013457	ATTTA	2	10	967596	967605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013457	GCTAA	2	10	977884	977893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013457	CCTAA	2	10	980350	980359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013457	GCTAT	2	10	981665	981674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013457	TAAAC	2	10	984267	984276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013457	TCGGT	2	10	986958	986967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013457	TCCCT	2	10	990955	990964	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_013457	AAAAC	2	10	1000651	1000660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013457	AAACA	2	10	1020412	1020421	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013457	TATTT	2	10	1029241	1029250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013457	AAAGA	2	10	1033793	1033802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013457	CAAAA	2	10	1043955	1043964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013457	ATTTT	2	10	1048978	1048987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013457	CACGC	2	10	1049716	1049725	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_013457	GCACT	2	10	1050578	1050587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013457	CTTAC	2	10	1061572	1061581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_013457	ACATA	2	10	1064128	1064137	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013457	AAGAA	2	10	1066300	1066309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013457	TGCAA	2	10	1083991	1084000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013457	GTTTT	2	10	1090953	1090962	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013457	GTTTG	2	10	1091448	1091457	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013457	TGTTA	2	10	1094057	1094066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013457	AGCGA	2	10	1099734	1099743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013457	CAAAT	2	10	1100781	1100790	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013457	CAAAA	2	10	1103148	1103157	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013457	TCACT	2	10	1118441	1118450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_013457	ACGCC	2	10	1121050	1121059	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_013457	AATAA	2	10	1142221	1142230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013457	AAAAG	2	10	1148666	1148675	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013457	GAGAA	2	10	1163075	1163084	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013457	AAAAC	2	10	1165065	1165074	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013457	AATTA	2	10	1167697	1167706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013457	ACTCT	2	10	1176121	1176130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.