MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio sp. Ex25 chromosome 1

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013456	AATTTT	2	12	22037	22048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013456	GAAAGA	2	12	50281	50292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013456	AAAACA	2	12	74341	74352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013456	AAGTCT	2	12	95862	95873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013456	AAACAC	2	12	138876	138887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013456	TCAAAA	2	12	140647	140658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013456	TATTTA	2	12	160895	160906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013456	CAACAG	2	12	178483	178494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013456	CAAAAA	2	12	215088	215099	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013456	ATTAAA	2	12	285648	285659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013456	AAAATA	2	12	314511	314522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013456	CACTCA	2	12	315813	315824	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013456	TTTTTC	2	12	357224	357235	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013456	TTTTTC	2	12	357584	357595	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013456	AGAAAG	2	12	375993	376004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013456	TGAAAT	2	12	377069	377080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013456	ATTTCA	2	12	389962	389973	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013456	TTTTTG	2	12	425467	425478	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013456	TGAAAT	2	12	480870	480881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013456	TGAAAT	2	12	522647	522658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013456	GTTTTT	2	12	548250	548261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013456	GAAAAT	2	12	577351	577362	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013456	TGAAAT	2	12	581868	581879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013456	TCTCTA	14	84	616158	616241	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013456	TGAAAT	2	12	624958	624969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013456	ACACTT	2	12	628018	628029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013456	TGAAAT	2	12	630658	630669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013456	GCAAAA	2	12	640668	640679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013456	CTTTTT	2	12	683088	683099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013456	TCGATC	2	12	719119	719130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013456	CAACGC	2	12	730737	730748	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013456	TAAAAA	2	12	754668	754679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013456	TGATAC	2	12	791017	791028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013456	AGGTTA	2	12	791158	791169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013456	TGAAAT	2	12	809036	809047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013456	TGAAAT	2	12	814544	814555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013456	TTTTGT	2	12	862882	862893	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013456	CATTTT	2	12	899714	899725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013456	TAAAAA	2	12	906989	907000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013456	AAATAT	2	12	908928	908939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013456	TGAAAT	2	12	919827	919838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013456	AAGACT	2	12	921525	921536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013456	TAAAAT	2	12	924227	924238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013456	AGCATG	2	12	972181	972192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013456	AGAGAA	2	12	1088599	1088610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013456	GCATTG	2	12	1114134	1114145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013456	ATAACT	2	12	1131492	1131503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013456	GCAGCG	2	12	1183151	1183162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013456	ATTGAT	2	12	1269840	1269851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013456	TAAAGA	2	12	1303567	1303578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013456	TTGCGC	2	12	1307144	1307155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013456	TCTATT	2	12	1331101	1331112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013456	TTTTAG	2	12	1340335	1340346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013456	TTTTTG	2	12	1420056	1420067	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013456	CTTTTT	2	12	1477030	1477041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013456	TAGGAG	2	12	1505604	1505615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013456	AGTATA	2	12	1559612	1559623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013456	TAACTT	2	12	1573219	1573230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013456	AGTTTA	2	12	1666604	1666615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013456	TTAATA	2	12	1687082	1687093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013456	GTTAAA	2	12	1749355	1749366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013456	ATAAAG	2	12	1750813	1750824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013456	GAGCAT	2	12	1765558	1765569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013456	TCTTTC	2	12	1815738	1815749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013456	GAGCAT	2	12	1842680	1842691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013456	AGGTTG	3	18	1849519	1849536	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013456	AAGTTA	2	12	1857739	1857750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013456	CAAGGT	2	12	1889154	1889165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013456	CTTTTA	2	12	1977350	1977361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013456	ACACTT	2	12	2070351	2070362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013456	CATAAA	2	12	2070503	2070514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013456	GCTTTT	2	12	2086180	2086191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013456	CTAAAC	2	12	2099859	2099870	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013456	GCAAGT	2	12	2104211	2104222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013456	TAACAT	2	12	2109496	2109507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013456	CAAATA	2	12	2118143	2118154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013456	TCATTA	2	12	2168261	2168272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013456	ACCGAA	2	12	2201192	2201203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013456	TTTTCA	2	12	2269481	2269492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013456	AAAAAC	2	12	2269550	2269561	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013456	AAAAAC	2	12	2273186	2273197	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013456	TTTTTG	2	12	2312455	2312466	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013456	TAGCGT	2	12	2313687	2313698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013456	GAATAA	2	12	2415220	2415231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013456	TAACAA	2	12	2415683	2415694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013456	GTTAAT	2	12	2435544	2435555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013456	TAAAGT	2	12	2467148	2467159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013456	ATGGAA	2	12	2467168	2467179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013456	ATTTAA	2	12	2479786	2479797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013456	AAAGAA	2	12	2479849	2479860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013456	CTCTAT	2	12	2483522	2483533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013456	ATTCAT	2	12	2497030	2497041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013456	ACTAAA	2	12	2516220	2516231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013456	GTTTCC	2	12	2568677	2568688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013456	CTTTTT	2	12	2577383	2577394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013456	AAAAAT	2	12	2597844	2597855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013456	ATTTAA	2	12	2618149	2618160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013456	ATCACA	2	12	2655943	2655954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013456	CAAGGT	2	12	2658522	2658533	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013456	AATAAA	2	12	2668825	2668836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013456	AAGCCA	2	12	2813500	2813511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013456	ATACTG	2	12	2813779	2813790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013456	AAACCA	2	12	2814246	2814257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013456	CATCTC	2	12	2848376	2848387	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013456	TTAAAT	2	12	2858967	2858978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013456	AAATAG	2	12	2866411	2866422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013456	ATTGCA	2	12	2908287	2908298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013456	CAAAAA	2	12	2932227	2932238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013456	ACGTAA	2	12	2966346	2966357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013456	ATACAT	2	12	2996980	2996991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013456	CAAAAA	2	12	3031528	3031539	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013456	CTAATA	2	12	3068034	3068045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013456	TTGTAT	2	12	3068955	3068966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013456	ATTTCA	2	12	3090448	3090459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013456	AACAAA	2	12	3107268	3107279	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013456	TGGTAT	2	12	3143602	3143613	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013456	AAAGGT	2	12	3159524	3159535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013456	TTTTGT	2	12	3159755	3159766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013456	TGAGTA	2	12	3159808	3159819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013456	GCTCTC	2	12	3203486	3203497	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013456	ACGTCA	2	12	3225083	3225094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.