MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	TG	3	6	8366	8371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012792	GC	3	6	8431	8436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012792	GC	3	6	14206	14211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012792	TG	3	6	24679	24684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012792	CG	3	6	26524	26529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012792	AC	3	6	28972	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012792	GC	3	6	33166	33171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012792	CA	3	6	46139	46144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012792	GC	3	6	64087	64092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012792	TG	3	6	82553	82558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012792	CG	3	6	82560	82565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012792	GC	3	6	82607	82612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012792	GC	4	8	84725	84732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012792	GA	3	6	86101	86106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012792	CG	3	6	96508	96513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012792	GC	3	6	97200	97205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012792	CG	3	6	97304	97309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012792	GC	3	6	98424	98429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012792	CT	3	6	98462	98467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012792	CT	3	6	98469	98474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012792	TC	3	6	99261	99266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012792	CG	4	8	111110	111117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012792	GC	3	6	111298	111303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012792	GC	3	6	111321	111326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012792	GC	3	6	111457	111462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012792	GC	3	6	111659	111664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012792	GC	3	6	115162	115167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012792	CG	3	6	120930	120935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012792	CT	3	6	125914	125919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012792	TG	3	6	133091	133096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012792	GC	3	6	133180	133185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012792	GC	3	6	133198	133203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012792	TC	3	6	133305	133310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012792	CG	3	6	135533	135538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012792	TC	3	6	140128	140133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012792	TC	3	6	143811	143816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012792	CA	3	6	147718	147723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012792	CG	3	6	151386	151391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012792	GT	3	6	151984	151989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012792	AT	3	6	154945	154950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012792	GC	4	8	162870	162877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012792	GC	3	6	162932	162937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012792	CA	3	6	164789	164794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012792	CG	4	8	164830	164837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012792	GC	3	6	166584	166589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012792	CG	3	6	176083	176088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012792	CA	3	6	186256	186261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012792	CG	3	6	193788	193793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012792	GC	3	6	194859	194864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012792	GC	3	6	197818	197823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012792	GT	3	6	217942	217947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012792	TC	3	6	219587	219592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012792	GC	3	6	221892	221897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012792	GC	3	6	222023	222028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012792	AG	3	6	224924	224929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012792	TG	3	6	224938	224943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012792	GA	3	6	241326	241331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012792	GC	3	6	241393	241398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012792	GC	3	6	241402	241407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012792	AC	3	6	242693	242698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012792	CG	3	6	243566	243571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012792	GC	3	6	247865	247870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012792	GC	3	6	260673	260678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012792	GC	3	6	263527	263532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012792	CG	3	6	272025	272030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012792	CA	3	6	272244	272249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012792	GA	3	6	274026	274031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012792	CG	3	6	274311	274316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012792	CG	3	6	274388	274393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012792	TA	3	6	276708	276713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012792	TA	3	6	276718	276723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012792	CG	3	6	278468	278473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012792	GC	3	6	278488	278493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012792	CG	4	8	278494	278501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012792	CG	3	6	278564	278569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012792	CG	4	8	284223	284230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012792	CG	4	8	284282	284289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012792	GC	3	6	284335	284340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012792	GC	3	6	284473	284478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012792	CG	3	6	285718	285723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012792	AG	3	6	289793	289798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012792	CG	3	6	293865	293870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012792	CT	3	6	293927	293932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012792	TC	3	6	295187	295192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012792	CG	3	6	298300	298305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012792	CG	3	6	298419	298424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012792	CG	3	6	303548	303553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012792	CG	3	6	315453	315458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012792	TC	3	6	315640	315645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012792	TA	3	6	325243	325248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012792	CG	3	6	325908	325913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012792	CA	3	6	332120	332125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012792	GC	3	6	336302	336307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012792	CT	3	6	337206	337211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012792	CA	3	6	337352	337357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012792	GC	3	6	353264	353269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012792	CG	3	6	358119	358124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012792	GA	3	6	362819	362824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012792	GC	3	6	365622	365627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012792	GC	3	6	366765	366770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012792	GC	3	6	366846	366851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012792	GC	3	6	366916	366921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012792	GC	3	6	367292	367297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012792	AC	3	6	371292	371297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012792	CG	3	6	372077	372082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012792	AC	3	6	383919	383924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012792	GC	3	6	386867	386872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012792	CA	4	8	386994	387001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012792	GA	3	6	390065	390070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012792	GA	3	6	395750	395755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012792	AC	3	6	396307	396312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012792	GC	3	6	396670	396675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012792	GC	3	6	402294	402299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012792	GC	4	8	402319	402326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012792	CG	3	6	404489	404494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012792	CA	3	6	404654	404659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012792	GC	3	6	404680	404685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012792	CG	3	6	411353	411358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012792	GT	3	6	413146	413151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012792	TC	3	6	418961	418966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012792	AT	3	6	427250	427255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012792	GT	3	6	435195	435200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012792	GT	3	6	438332	438337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012792	TG	3	6	440795	440800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012792	CG	3	6	441240	441245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012792	CG	3	6	443198	443203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012792	CG	3	6	444954	444959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012792	CG	3	6	454991	454996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012792	CG	3	6	461905	461910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012792	GC	3	6	466125	466130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012792	AG	3	6	486505	486510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012792	GC	3	6	486548	486553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012792	GC	4	8	494537	494544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012792	CG	3	6	494648	494653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012792	GC	3	6	494656	494661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012792	CT	3	6	505831	505836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012792	CG	3	6	506202	506207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012792	GT	4	8	514108	514115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012792	CG	3	6	518563	518568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012792	AC	3	6	518746	518751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012792	GC	3	6	523477	523482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012792	CA	3	6	530767	530772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012792	CG	3	6	532207	532212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012792	GC	3	6	534621	534626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012792	GC	3	6	534811	534816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012792	GA	3	6	535076	535081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012792	CG	3	6	535213	535218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012792	GC	3	6	536131	536136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012792	CG	4	8	536869	536876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012792	CG	3	6	537129	537134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012792	AG	3	6	537385	537390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012792	GC	3	6	538026	538031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012792	GC	3	6	538684	538689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_012792	GC	3	6	540796	540801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.