MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	TGCAAA	2	12	3822	3833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012792	GCAGGG	2	12	8452	8463	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012792	CTGCCA	2	12	8564	8575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012792	TTTCAA	2	12	116373	116384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012792	CAGCGG	2	12	151861	151872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012792	GGCGCC	2	12	173161	173172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012792	CGACCG	2	12	221965	221976	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012792	TGCGCG	2	12	250376	250387	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012792	CTCGGC	2	12	263426	263437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012792	GTATAC	2	12	310393	310404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012792	ACCGAG	2	12	354508	354519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012792	CGGTAT	2	12	395595	395606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012792	GGTCCG	2	12	431307	431318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012792	GGATTG	2	12	452764	452775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012792	CCGCGG	2	12	495260	495271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012792	CACGGG	2	12	534594	534605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012792	CCGAAG	2	12	538664	538675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012792	CTCAAC	2	12	604856	604867	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012792	GCGACC	2	12	621028	621039	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012792	GGTCCT	2	12	635567	635578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012792	TTCACT	2	12	661757	661768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012792	CTGGTG	2	12	686275	686286	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012792	GTGCCG	2	12	705001	705012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012792	ATCAAG	2	12	714939	714950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012792	GACATC	2	12	726190	726201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012792	GCAACC	2	12	764212	764223	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012792	GCGACG	2	12	764450	764461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012792	GTCGCC	2	12	778600	778611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012792	GCATGC	2	12	778664	778675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012792	CCTTCC	2	12	856727	856738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012792	GCGGTT	2	12	928822	928833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012792	ATGCCC	2	12	953733	953744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012792	ATGCGG	2	12	953776	953787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012792	ATAGCC	2	12	955053	955064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012792	GGGGCC	2	12	955898	955909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012792	ACGCGC	2	12	1018065	1018076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012792	CCGGCG	2	12	1067697	1067708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012792	CGAGTG	2	12	1078713	1078724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012792	AGATGG	2	12	1082623	1082634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012792	GAATTG	2	12	1082800	1082811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012792	CATCCG	2	12	1082873	1082884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.