MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 6083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012791	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012791	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012791	TTC	2	6	5442	5447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012791	CAG	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012791	CCG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012791	GCC	2	6	6714	6719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012791	GGC	2	6	6734	6739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012791	CTG	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012791	TTC	2	6	7060	7065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012791	GCG	2	6	7132	7137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012791	GAG	2	6	7159	7164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012791	TCC	2	6	7851	7856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012791	GAA	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012791	GGC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012791	GCG	2	6	8492	8497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012791	CGC	2	6	8510	8515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012791	TGC	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012791	CAA	2	6	10426	10431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012791	ATT	2	6	10518	10523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012791	TCT	2	6	10526	10531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012791	ATT	2	6	10540	10545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012791	AAC	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012791	CAC	2	6	13380	13385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012791	CGG	2	6	14159	14164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012791	CTT	2	6	14243	14248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012791	GCC	2	6	14250	14255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012791	CCT	2	6	14323	14328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012791	GGT	2	6	14331	14336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012791	GCA	2	6	14346	14351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012791	CGG	2	6	14361	14366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012791	TCA	3	9	14373	14381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012791	GAA	2	6	14842	14847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012791	CGG	3	9	14912	14920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012791	GAA	2	6	15518	15523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012791	CGC	2	6	15527	15532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012791	GCA	2	6	15539	15544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012791	CGG	2	6	15633	15638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012791	GGC	2	6	16742	16747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012791	TGG	2	6	17724	17729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012791	GCG	2	6	23482	23487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012791	CCG	2	6	23510	23515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012791	CGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012791	GAA	2	6	27540	27545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012791	CTT	2	6	27575	27580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012791	CTT	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012791	GCG	2	6	30543	30548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012791	TAG	4	12	30587	30598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012791	AAC	2	6	30710	30715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012791	CGG	3	9	30949	30957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012791	ATG	2	6	32639	32644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012791	ATG	2	6	32691	32696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012791	GCG	2	6	35479	35484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012791	CCG	2	6	35506	35511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012791	GTG	2	6	37949	37954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012791	CCT	2	6	38044	38049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012791	ACC	2	6	38073	38078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012791	CTG	2	6	41851	41856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012791	AGC	2	6	44600	44605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012791	GCT	2	6	44631	44636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012791	GAA	2	6	45281	45286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012791	GCA	2	6	45402	45407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012791	CGG	2	6	45434	45439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012791	CGC	2	6	45448	45453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012791	ATA	2	6	45819	45824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012791	GGT	2	6	45865	45870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012791	AGT	2	6	45961	45966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012791	CGC	2	6	48597	48602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012791	CGC	2	6	51792	51797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012791	GAG	2	6	51820	51825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012791	GCC	2	6	52783	52788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012791	CCG	2	6	55872	55877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012791	TCC	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012791	CAC	2	6	55992	55997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012791	AGG	3	9	56047	56055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012791	ACC	2	6	56147	56152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012791	TGA	2	6	57523	57528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012791	CGC	2	6	57586	57591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_012791	TCA	2	6	57676	57681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012791	CCG	2	6	58132	58137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012791	AGC	2	6	58467	58472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012791	GAA	2	6	59478	59483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012791	GAG	2	6	59490	59495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012791	GCG	2	6	59524	59529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012791	TTG	2	6	59567	59572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012791	GCG	2	6	61395	61400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012791	TGC	2	6	61425	61430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012791	CCG	2	6	61431	61436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_012791	CTT	2	6	62558	62563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012791	GTT	3	9	62575	62583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012791	GCC	2	6	64842	64847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012791	TCT	2	6	64866	64871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012791	GTT	2	6	70522	70527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012791	TCT	2	6	71476	71481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012791	TAT	2	6	71498	71503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012791	GGC	2	6	71508	71513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012791	CGA	2	6	71534	71539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012791	ACA	2	6	72332	72337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012791	GAA	2	6	74246	74251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012791	CAT	2	6	76351	76356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012791	CGG	2	6	76358	76363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012791	TGA	2	6	77431	77436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012791	TGA	2	6	77454	77459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012791	GTT	2	6	80371	80376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012791	ATC	2	6	80428	80433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012791	GCG	2	6	82884	82889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012791	GAA	2	6	84829	84834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012791	CCG	2	6	84895	84900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012791	GCG	2	6	86991	86996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012791	AAC	2	6	87063	87068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012791	GCA	2	6	91882	91887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012791	ATT	2	6	91917	91922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012791	GAA	3	9	93640	93648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012791	CAG	2	6	95158	95163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012791	AAC	2	6	95229	95234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012791	GCG	2	6	96525	96530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012791	CTT	2	6	97005	97010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012791	ACC	2	6	97632	97637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012791	CGT	2	6	97690	97695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012791	GGC	2	6	97719	97724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012791	TAA	2	6	97806	97811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012791	GAA	2	6	99188	99193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012791	AAG	2	6	109775	109780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012791	GCC	2	6	110518	110523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_012791	GCG	2	6	110530	110535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012791	GGC	2	6	115834	115839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012791	AGG	2	6	115845	115850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012791	CGG	2	6	115965	115970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012791	CGC	2	6	116842	116847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012791	CAT	2	6	116920	116925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012791	CGG	2	6	116976	116981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012791	CGC	2	6	116987	116992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012791	CAT	2	6	117440	117445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012791	GGA	2	6	118392	118397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012791	TCC	2	6	118421	118426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012791	GTT	2	6	126532	126537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012791	TGT	2	6	127556	127561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012791	TGT	2	6	127602	127607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012791	CCT	3	9	127667	127675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012791	AGG	3	9	127797	127805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012791	CGG	2	6	127845	127850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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