MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 10452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012791	GGC	2	6	654488	654493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012791	AC	3	6	654505	654510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_012791	ACA	2	6	654530	654535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_012791	AGC	2	6	654536	654541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012791	AGC	2	6	655288	655293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012791	GGT	2	6	655314	655319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012791	CCA	2	6	655336	655341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_012791	AGT	2	6	655361	655366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012791	TGG	2	6	655402	655407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012791	CGA	2	6	655507	655512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012791	GGC	2	6	655547	655552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012791	CGA	2	6	655677	655682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012791	GGC	2	6	655721	655726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012791	GGCGC	2	10	655765	655774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_012791	TTC	2	6	656105	656110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012791	CTA	2	6	656126	656131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012791	GCT	3	9	656286	656294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012791	ATG	2	6	656302	656307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012791	G	6	6	656705	656710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012791	GGA	2	6	656753	656758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012791	GC	3	6	656760	656765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_012791	CTG	2	6	656768	656773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012791	TGCG	2	8	656791	656798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_012791	CCTT	2	8	657289	657296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_012791	TCA	2	6	658374	658379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_012791	GCC	2	6	658381	658386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_012791	T	6	6	658397	658402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012791	CTT	2	6	658413	658418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012791	C	6	6	658421	658426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1030	NC_012791	CGCC	2	8	658449	658456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1031	NC_012791	CGG	2	6	658462	658467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012791	CT	3	6	658484	658489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_012791	TCCA	2	8	658920	658927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_012791	CCATC	2	10	658930	658939	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_012791	TCG	2	6	659007	659012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012791	CCA	2	6	659015	659020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_012791	CTT	2	6	659530	659535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012791	AAGA	2	8	659545	659552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012791	C	6	6	659553	659558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_012791	TC	3	6	660623	660628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_012791	GA	3	6	660671	660676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012791	GC	3	6	661435	661440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_012791	CCA	2	6	661453	661458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_012791	GCG	2	6	661459	661464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012791	GC	3	6	661475	661480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_012791	TCG	3	9	661649	661657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012791	TCGT	2	8	661758	661765	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_012791	TCA	2	6	661871	661876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012791	CGC	2	6	661895	661900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_012791	TTTCTC	2	12	663074	663085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012791	TCC	2	6	663123	663128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_012791	GAG	2	6	663146	663151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012791	GGC	2	6	663152	663157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012791	GTC	2	6	663159	663164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_012791	GCG	2	6	663175	663180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012791	CTT	2	6	663181	663186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_012791	CGGT	2	8	663225	663232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_012791	CAC	2	6	663260	663265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012791	CAC	3	9	663341	663349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_012791	GCT	2	6	663394	663399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_012791	GAG	2	6	663468	663473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012791	TGC	2	6	663475	663480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_012791	GGC	2	6	663514	663519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_012791	CCAC	2	8	663633	663640	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1065	NC_012791	CCGG	2	8	663650	663657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_012791	CAG	2	6	663663	663668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012791	GC	3	6	663700	663705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_012791	GCCG	2	8	663767	663774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_012791	CGT	3	9	663812	663820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_012791	GT	3	6	663819	663824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012791	TCGCG	2	10	663881	663890	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_012791	AAG	2	6	663924	663929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012791	GGT	2	6	663934	663939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012791	GAA	2	6	665181	665186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012791	AT	3	6	665726	665731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012791	AGG	2	6	665735	665740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012791	CAGC	2	8	665996	666003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_012791	CAG	2	6	666045	666050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012791	CGT	2	6	666068	666073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_012791	TTG	2	6	667377	667382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012791	GCA	2	6	667424	667429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012791	GTC	2	6	667504	667509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_012791	GAT	2	6	668499	668504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012791	CTT	2	6	668505	668510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_012791	AGC	2	6	671051	671056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012791	GCG	2	6	671106	671111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_012791	TGG	2	6	671175	671180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012791	GC	3	6	671198	671203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_012791	TCCA	2	8	671252	671259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_012791	CG	3	6	671343	671348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_012791	GCGGG	2	10	671349	671358	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_012791	GCA	2	6	671374	671379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012791	GGT	2	6	671413	671418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012791	CCT	2	6	671428	671433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_012791	GCGA	2	8	671535	671542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_012791	A	6	6	671564	671569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012791	CTC	2	6	671617	671622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_012791	GCA	2	6	671649	671654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012791	GC	4	8	671671	671678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_012791	CGT	2	6	671682	671687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_012791	GGT	2	6	671705	671710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012791	CGG	2	6	671823	671828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012791	CGGGC	2	10	671859	671868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_012791	CG	3	6	671896	671901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_012791	GTGAA	2	10	675129	675138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012791	CTC	2	6	678248	678253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_012791	CGT	2	6	678288	678293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_012791	AT	3	6	678323	678328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012791	TCAA	2	8	678340	678347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_012791	GCCG	2	8	681773	681780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_012791	GGC	2	6	682464	682469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012791	CAAGG	2	10	682480	682489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_012791	CCG	2	6	682491	682496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_012791	GGT	2	6	682503	682508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012791	AT	3	6	682521	682526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012791	CA	3	6	682527	682532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_012791	GC	3	6	683544	683549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_012791	TCG	2	6	685331	685336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012791	CGC	2	6	685354	685359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_012791	GC	3	6	685358	685363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_012791	A	6	6	685406	685411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012791	CGG	2	6	685456	685461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_012791	CGG	2	6	685471	685476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012791	GC	3	6	685508	685513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_012791	GT	3	6	685571	685576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012791	CCGG	2	8	686646	686653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_012791	GC	3	6	686669	686674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_012791	GGC	2	6	686701	686706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_012791	GCCC	2	8	686765	686772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1130	NC_012791	GCG	2	6	686787	686792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012791	TGCC	2	8	686797	686804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_012791	CGC	2	6	687914	687919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_012791	A	7	7	687925	687931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012791	G	6	6	687962	687967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012791	GC	3	6	687977	687982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1137	NC_012791	AAGGG	2	10	689224	689233	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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