MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 10452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012791	AGGAC	2	10	2713235	2713244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5002	NC_012791	AT	3	6	2714842	2714847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012791	CGC	3	9	2714878	2714886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_012791	ACC	2	6	2716374	2716379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_012791	CCT	3	9	2717979	2717987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_012791	GGC	2	6	2722380	2722385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_012791	GCCG	2	8	2722399	2722406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_012791	GC	3	6	2725059	2725064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_012791	TCC	2	6	2725067	2725072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_012791	TGGGC	2	10	2725073	2725082	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_012791	TCGC	2	8	2725960	2725967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_012791	CGG	2	6	2725991	2725996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_012791	GCG	2	6	2726390	2726395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_012791	TG	3	6	2726401	2726406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012791	CTT	2	6	2727160	2727165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_012791	CGA	2	6	2727969	2727974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_012791	GAC	2	6	2727993	2727998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_012791	GCT	2	6	2731246	2731251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_012791	CAC	2	6	2731293	2731298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_012791	TGG	2	6	2731306	2731311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012791	ACC	2	6	2731368	2731373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_012791	TGT	3	9	2731454	2731462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012791	TGA	2	6	2731513	2731518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_012791	GCG	2	6	2731885	2731890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_012791	AG	4	8	2733989	2733996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012791	GGC	2	6	2734000	2734005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_012791	GGC	2	6	2734090	2734095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_012791	AGG	2	6	2734107	2734112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012791	GAAAAG	2	12	2734404	2734415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012791	TTC	3	9	2734471	2734479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_012791	CGAG	2	8	2734489	2734496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_012791	AGG	2	6	2734505	2734510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012791	AAC	2	6	2734517	2734522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012791	TCAAA	2	10	2734593	2734602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5035	NC_012791	GTT	2	6	2735024	2735029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012791	GCC	2	6	2735030	2735035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_012791	CCG	2	6	2735519	2735524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_012791	CTG	2	6	2735533	2735538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_012791	TCG	2	6	2735644	2735649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_012791	TGG	2	6	2735666	2735671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012791	CTT	2	6	2735679	2735684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_012791	TGC	2	6	2735696	2735701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_012791	GCC	2	6	2735745	2735750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_012791	ACG	2	6	2735786	2735791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_012791	CA	3	6	2735808	2735813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_012791	GAAAA	2	10	2735886	2735895	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_012791	A	6	6	2735892	2735897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012791	GAT	2	6	2735910	2735915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012791	GTG	2	6	2735941	2735946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012791	AGA	2	6	2735950	2735955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012791	AG	3	6	2736068	2736073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012791	AAT	2	6	2736086	2736091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012791	CTG	2	6	2736107	2736112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_012791	CGA	2	6	2736169	2736174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_012791	ATCT	2	8	2736188	2736195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_012791	TGC	2	6	2736219	2736224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_012791	GC	3	6	2736242	2736247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_012791	GTG	2	6	2736248	2736253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012791	GGT	2	6	2736286	2736291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012791	TCG	2	6	2736297	2736302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_012791	AGC	2	6	2736312	2736317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012791	ATC	2	6	2736320	2736325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_012791	GCC	2	6	2736327	2736332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_012791	TGC	2	6	2736333	2736338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_012791	GGC	2	6	2736344	2736349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_012791	TCG	2	6	2736357	2736362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_012791	GGT	2	6	2736436	2736441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012791	GTG	2	6	2736443	2736448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012791	GCC	2	6	2736460	2736465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_012791	GAAG	2	8	2736496	2736503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012791	CGA	2	6	2736517	2736522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_012791	GCCT	2	8	2736584	2736591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_012791	AAG	2	6	2736635	2736640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012791	CG	4	8	2736691	2736698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_012791	CGA	2	6	2736703	2736708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_012791	CTG	2	6	2736758	2736763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_012791	CATCGA	2	12	2736808	2736819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_012791	CG	3	6	2736830	2736835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_012791	CCGCG	2	10	2736851	2736860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5080	NC_012791	TGC	2	6	2736870	2736875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_012791	GCTC	2	8	2736900	2736907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_012791	GCC	2	6	2736953	2736958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_012791	GC	3	6	2737010	2737015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_012791	GCC	2	6	2737034	2737039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_012791	CG	3	6	2737053	2737058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_012791	CTG	2	6	2737097	2737102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5089	NC_012791	GCGCG	2	10	2737147	2737156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5090	NC_012791	ACC	2	6	2737169	2737174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_012791	ATC	2	6	2737184	2737189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_012791	GAA	2	6	2737256	2737261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_012791	GAA	2	6	2737354	2737359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_012791	CGA	2	6	2737411	2737416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_012791	CCA	2	6	2737452	2737457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_012791	GCA	2	6	2737474	2737479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_012791	TGC	3	9	2737491	2737499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_012791	GCA	2	6	2737507	2737512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_012791	CTG	2	6	2737604	2737609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_012791	TGC	2	6	2737662	2737667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_012791	GGCT	2	8	2737704	2737711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_012791	CG	3	6	2737713	2737718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_012791	ACC	2	6	2737730	2737735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_012791	CGGC	2	8	2737788	2737795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_012791	GCGCC	2	10	2737816	2737825	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5107	NC_012791	AGCC	2	8	2737831	2737838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_012791	CGG	2	6	2737897	2737902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_012791	CGT	2	6	2737903	2737908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_012791	CCA	2	6	2737917	2737922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_012791	CGATG	2	10	2737945	2737954	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_012791	CGG	2	6	2737987	2737992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_012791	CGA	2	6	2738008	2738013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5115	NC_012791	CAC	2	6	2738149	2738154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_012791	GC	3	6	2738155	2738160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_012791	CGGC	2	8	2738184	2738191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_012791	AGC	2	6	2738250	2738255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_012791	AGCGC	2	10	2738262	2738271	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5120	NC_012791	CGG	3	9	2738280	2738288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_012791	GC	3	6	2738365	2738370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_012791	ATG	2	6	2738371	2738376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_012791	CATCC	2	10	2738392	2738401	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5127	NC_012791	GCTGCG	2	12	2740687	2740698	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_012791	GCC	2	6	2740701	2740706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_012791	AAG	2	6	2741981	2741986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_012791	GA	3	6	2743403	2743408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5258	NC_012791	CCT	2	6	2839211	2839216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5261	NC_012791	GCGCA	2	10	2839341	2839350	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5262	NC_012791	TCA	2	6	2839487	2839492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5264	NC_012791	GCC	2	6	2839700	2839705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_012791	CTC	3	9	2839743	2839751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5266	NC_012791	CAGC	2	8	2839758	2839765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5267	NC_012791	G	6	6	2839847	2839852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_012791	GCT	2	6	2840045	2840050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5272	NC_012791	CTG	2	6	2840193	2840198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5274	NC_012791	TCGC	2	8	2840271	2840278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5275	NC_012791	CTC	2	6	2840718	2840723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5282	NC_012791	CT	3	6	2842353	2842358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5283	NC_012791	TCC	2	6	2842363	2842368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5291	NC_012791	GTT	2	6	2842862	2842867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5292	NC_012791	CATA	2	8	2842924	2842931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5293	NC_012791	ATC	2	6	2842947	2842952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5304	NC_012791	GAGGC	2	10	2843467	2843476	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5323	NC_012791	GGCA	2	8	2845799	2845806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5324	NC_012791	AAG	2	6	2845809	2845814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5332	NC_012791	CGG	3	9	2848532	2848540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5334	NC_012791	GCG	2	6	2848734	2848739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5336	NC_012791	TGGG	2	8	2849056	2849063	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5338	NC_012791	A	7	7	2850064	2850070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5339	NC_012791	TGC	2	6	2850092	2850097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5341	NC_012791	GGCG	2	8	2850131	2850138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5342	NC_012791	GGGGA	2	10	2850152	2850161	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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5345	NC_012791	TCC	2	6	2850458	2850463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5346	NC_012791	AATCG	2	10	2850588	2850597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5347	NC_012791	TCC	2	6	2850630	2850635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5365	NC_012791	GTGAA	2	10	2853348	2853357	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5373	NC_012791	T	6	6	2853884	2853889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_012791	GTT	2	6	2854213	2854218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_012791	CGGT	2	8	2854289	2854296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5388	NC_012791	CGGG	2	8	2854995	2855002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5389	NC_012791	GAA	2	6	2855184	2855189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_012791	GAG	2	6	2855281	2855286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_012791	CAG	2	6	2855321	2855326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5394	NC_012791	ATTGG	2	10	2855690	2855699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5397	NC_012791	GGC	2	6	2855776	2855781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5409	NC_012791	CG	3	6	2857165	2857170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5422	NC_012791	GCT	2	6	2858295	2858300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5424	NC_012791	TTCG	2	8	2858327	2858334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5425	NC_012791	TGGCC	2	10	2858343	2858352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5426	NC_012791	CGA	2	6	2858406	2858411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5432	NC_012791	TGC	2	6	2861004	2861009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5433	NC_012791	GCG	2	6	2861016	2861021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5434	NC_012791	GCGG	2	8	2861030	2861037	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5435	NC_012791	GCTT	2	8	2861959	2861966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5436	NC_012791	CGGCG	2	10	2861976	2861985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5444	NC_012791	GGC	2	6	2868576	2868581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5445	NC_012791	GCG	2	6	2868602	2868607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5447	NC_012791	TGCC	2	8	2868654	2868661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5452	NC_012791	CGG	2	6	2872864	2872869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5454	NC_012791	TGC	2	6	2875128	2875133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5471	NC_012791	CGAT	2	8	2887429	2887436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5483	NC_012791	A	7	7	2906825	2906831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_012791	GCG	2	6	2908684	2908689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5500	NC_012791	TCAA	2	8	2923465	2923472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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