MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 10452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012791	TGGC	2	8	2401348	2401355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_012791	CGC	2	6	2401455	2401460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_012791	ACG	2	6	2401499	2401504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_012791	GCC	2	6	2401557	2401562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_012791	CAG	2	6	2401573	2401578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_012791	GCAA	2	8	2401601	2401608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_012791	GGA	2	6	2401656	2401661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_012791	GT	3	6	2401682	2401687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_012791	GC	3	6	2401713	2401718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_012791	GGCC	2	8	2401737	2401744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_012791	GC	3	6	2401786	2401791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_012791	CAC	2	6	2401840	2401845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_012791	TGC	2	6	2401853	2401858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_012791	GGT	2	6	2401872	2401877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_012791	CAC	2	6	2401888	2401893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_012791	GC	3	6	2401947	2401952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_012791	ACG	2	6	2401963	2401968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_012791	GTG	2	6	2402002	2402007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_012791	CGA	2	6	2402085	2402090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_012791	ACC	2	6	2402147	2402152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_012791	CCG	2	6	2402160	2402165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_012791	AAG	2	6	2402240	2402245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012791	GCC	2	6	2402261	2402266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_012791	CCG	2	6	2402277	2402282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_012791	CTT	2	6	2402433	2402438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012791	AGC	2	6	2402573	2402578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_012791	GCC	2	6	2402632	2402637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_012791	GCA	2	6	2402644	2402649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012791	CG	4	8	2402687	2402694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_012791	GCA	2	6	2402713	2402718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_012791	GC	3	6	2402763	2402768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_012791	CGG	2	6	2402840	2402845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_012791	CGT	2	6	2402857	2402862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_012791	CCAT	2	8	2402864	2402871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_012791	AGCC	2	8	2402933	2402940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_012791	CGG	2	6	2403059	2403064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_012791	CGG	2	6	2403104	2403109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_012791	GAT	2	6	2403150	2403155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012791	CGC	2	6	2403188	2403193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_012791	TGC	2	6	2403194	2403199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_012791	TGA	2	6	2403285	2403290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_012791	GTG	2	6	2404414	2404419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_012791	A	6	6	2404481	2404486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012791	GAG	2	6	2404502	2404507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012791	A	6	6	2404546	2404551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012791	T	6	6	2404569	2404574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012791	G	6	6	2404676	2404681	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_012791	GAT	2	6	2404708	2404713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_012791	TGCAAT	2	12	2404976	2404987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4550	NC_012791	TGGC	2	8	2405026	2405033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_012791	CGC	2	6	2409779	2409784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_012791	ACC	2	6	2413423	2413428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_012791	TCG	2	6	2425027	2425032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012791	TTC	2	6	2425048	2425053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_012791	GCT	2	6	2425897	2425902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_012791	GT	3	6	2427703	2427708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012791	TCC	2	6	2427737	2427742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_012791	TCG	2	6	2428340	2428345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_012791	GGC	2	6	2428423	2428428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012791	TCAT	2	8	2428545	2428552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_012791	AGGC	2	8	2428556	2428563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_012791	C	6	6	2431659	2431664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4563	NC_012791	GC	3	6	2431687	2431692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_012791	CGCGG	2	10	2431745	2431754	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4565	NC_012791	GTT	2	6	2432579	2432584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_012791	GGC	2	6	2432618	2432623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012791	GAGCA	2	10	2432643	2432652	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_012791	CATC	2	8	2432698	2432705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_012791	GGCA	2	8	2432714	2432721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_012791	GTT	2	6	2432778	2432783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_012791	GGCC	2	8	2432794	2432801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_012791	CGG	2	6	2432853	2432858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_012791	AAT	2	6	2451709	2451714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012791	AAT	2	6	2451718	2451723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_012791	GGCG	2	8	2451783	2451790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4576	NC_012791	GGC	2	6	2451828	2451833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_012791	TGA	2	6	2451879	2451884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_012791	GAA	2	6	2451919	2451924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012791	AGG	2	6	2451980	2451985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_012791	AAT	2	6	2452046	2452051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012791	ATCTG	2	10	2452095	2452104	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4582	NC_012791	GCG	2	6	2452188	2452193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_012791	GCA	2	6	2452210	2452215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_012791	AAC	3	9	2452260	2452268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_012791	CTGT	2	8	2452296	2452303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_012791	GCC	2	6	2452395	2452400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_012791	GCG	2	6	2452414	2452419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_012791	TGG	2	6	2452565	2452570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012791	GAC	2	6	2452629	2452634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_012791	ACG	2	6	2452642	2452647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_012791	GGC	2	6	2452727	2452732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_012791	TGA	2	6	2453466	2453471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_012791	GGT	2	6	2453572	2453577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012791	CGAG	2	8	2453602	2453609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_012791	A	6	6	2453636	2453641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_012791	TCGA	2	8	2453698	2453705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_012791	GC	4	8	2454262	2454269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_012791	CGA	2	6	2454277	2454282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_012791	GCG	2	6	2454688	2454693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_012791	ACG	2	6	2454730	2454735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_012791	GC	3	6	2454750	2454755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_012791	GCA	2	6	2455800	2455805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_012791	TGA	2	6	2455832	2455837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012791	GCA	2	6	2455847	2455852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_012791	CAC	2	6	2457880	2457885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_012791	CTT	2	6	2457916	2457921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012791	TGC	2	6	2457930	2457935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_012791	GC	3	6	2460344	2460349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_012791	GCG	2	6	2460402	2460407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_012791	GC	3	6	2460428	2460433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_012791	GGC	2	6	2460441	2460446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_012791	GTA	2	6	2460532	2460537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_012791	TGA	2	6	2460559	2460564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012791	CAA	2	6	2460637	2460642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_012791	TTCTA	2	10	2460758	2460767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4616	NC_012791	GTT	2	6	2461505	2461510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_012791	AGGC	2	8	2461529	2461536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_012791	CAG	2	6	2463401	2463406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_012791	GAC	2	6	2466603	2466608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_012791	GCGG	2	8	2468114	2468121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4621	NC_012791	GGC	2	6	2469052	2469057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_012791	GAA	2	6	2470591	2470596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_012791	GGCG	2	8	2470624	2470631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_012791	CG	3	6	2470630	2470635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_012791	GCG	2	6	2470676	2470681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_012791	TG	3	6	2470691	2470696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_012791	CAG	2	6	2470743	2470748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_012791	CA	3	6	2470765	2470770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_012791	ACT	2	6	2470804	2470809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_012791	AAG	3	9	2473866	2473874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_012791	AGCG	2	8	2475384	2475391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4754	NC_012791	CG	3	6	2560081	2560086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4755	NC_012791	CCCCG	2	10	2560088	2560097	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4756	NC_012791	GGAAG	2	10	2560108	2560117	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4759	NC_012791	GCC	2	6	2562384	2562389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4760	NC_012791	TCAG	2	8	2562418	2562425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4761	NC_012791	CT	3	6	2562437	2562442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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