MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	TCAA	2	8	466	473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012667	AGCT	2	8	519	526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012667	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012667	TCAA	2	8	904	911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012667	GTTA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012667	TCAT	2	8	4186	4193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012667	AGTG	2	8	5377	5384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012667	AAGG	2	8	15079	15086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012667	GATT	2	8	15723	15730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012667	AGTG	2	8	24977	24984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012667	ATAG	2	8	25068	25075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012667	TTTA	2	8	26258	26265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012667	CTAA	2	8	26272	26279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012667	GCCA	2	8	26447	26454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012667	TTAA	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012667	TGCT	2	8	31808	31815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012667	TAAA	2	8	33691	33698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012667	CAAA	2	8	36052	36059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012667	CGTT	2	8	36326	36333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012667	TACT	2	8	36433	36440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012667	AATT	2	8	36618	36625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012667	ATCC	2	8	38256	38263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012667	TTCT	2	8	43128	43135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012667	GAAG	2	8	44365	44372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012667	ATGA	2	8	48183	48190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012667	AAAG	2	8	53180	53187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012667	TAAG	2	8	53307	53314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012667	AAGC	2	8	59246	59253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012667	TTAA	2	8	68563	68570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012667	ACCT	2	8	68965	68972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012667	CATT	2	8	68994	69001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012667	TTGG	2	8	69823	69830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012667	CCGT	2	8	69842	69849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012667	AGCC	2	8	70165	70172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012667	GGCT	2	8	70179	70186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012667	TCAC	2	8	77559	77566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012667	CGTT	2	8	78405	78412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012667	TCTA	2	8	78428	78435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012667	CATT	2	8	80897	80904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012667	GCTG	2	8	80962	80969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012667	TCAA	2	8	88027	88034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012667	CATT	2	8	88928	88935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012667	AATC	2	8	89038	89045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012667	ATTT	2	8	89465	89472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012667	CAAT	2	8	91701	91708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012667	CAGC	2	8	91773	91780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012667	CCGA	2	8	91907	91914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012667	AGAA	2	8	91998	92005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012667	GTTT	2	8	92029	92036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012667	CTTG	2	8	93204	93211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012667	GAAC	2	8	93307	93314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012667	TCTA	2	8	93385	93392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012667	AATA	2	8	93435	93442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012667	AATC	2	8	93525	93532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012667	TGGG	2	8	97978	97985	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012667	ATCT	2	8	98606	98613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012667	CCAC	2	8	99163	99170	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_012667	CCAG	2	8	103496	103503	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012667	CTTT	2	8	113256	113263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012667	AGTG	2	8	116037	116044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012667	ATAG	2	8	116058	116065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012667	AACG	2	8	116083	116090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012667	GCTT	2	8	119779	119786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012667	ATCA	2	8	120672	120679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012667	CGAA	2	8	120720	120727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012667	CTCA	2	8	124219	124226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012667	TGAG	2	8	124246	124253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012667	ATGC	2	8	125400	125407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012667	TTAA	2	8	132459	132466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012667	CATT	2	8	132488	132495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012667	TGCT	2	8	132671	132678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012667	CTTC	2	8	136181	136188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012667	TTGA	2	8	156720	156727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012667	TCAA	2	8	156734	156741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012667	AAAT	2	8	156832	156839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012667	AATA	2	8	156986	156993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012667	ATTA	2	8	158711	158718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012667	ATTA	2	8	158882	158889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012667	AAGT	2	8	158971	158978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012667	ATAA	2	8	158993	159000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012667	AGTG	2	8	163513	163520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012667	CAGC	2	8	168148	168155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012667	GTGA	2	8	168243	168250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012667	TAAA	2	8	171129	171136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012667	TAAA	2	8	171204	171211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012667	ATAA	2	8	171316	171323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012667	AGTG	2	8	171352	171359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012667	TAGT	2	8	171819	171826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012667	TGGT	2	8	172942	172949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012667	TCAC	2	8	172977	172984	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012667	GAGT	2	8	173518	173525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012667	AAAT	2	8	179990	179997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012667	CCAA	2	8	180003	180010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012667	AATA	2	8	180012	180019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012667	TTAT	2	8	180923	180930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012667	TCAA	2	8	182995	183002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012667	TAAT	2	8	185002	185009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012667	GTCA	2	8	185110	185117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012667	AATA	2	8	187083	187090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012667	AATT	2	8	187124	187131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012667	AAAT	2	8	187146	187153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012667	ATTT	2	8	194366	194373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012667	CAAG	2	8	196160	196167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012667	TTGA	2	8	204815	204822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012667	CGAA	2	8	206490	206497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012667	AATT	2	8	206594	206601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012667	ACCA	2	8	211276	211283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012667	AACG	2	8	218681	218688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012667	TCAC	2	8	222215	222222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012667	GATA	2	8	222574	222581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012667	TTAC	2	8	228074	228081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012667	ATCA	2	8	235970	235977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012667	TGAG	2	8	237662	237669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012667	GATT	2	8	240721	240728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012667	TTCC	2	8	253102	253109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012667	AATG	2	8	253774	253781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012667	CTTG	2	8	253914	253921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012667	AGTG	2	8	261380	261387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012667	CACT	2	8	265032	265039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012667	GCAA	2	8	265116	265123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012667	TAAG	2	8	269118	269125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012667	GAGC	2	8	270242	270249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012667	ATAA	2	8	272453	272460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012667	TCCT	2	8	272781	272788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012667	CTTG	2	8	273269	273276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012667	TATT	2	8	273359	273366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012667	TAAA	2	8	273568	273575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012667	TGGC	2	8	279236	279243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012667	AAAC	2	8	287739	287746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012667	ATGA	2	8	287771	287778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012667	TTAA	2	8	292451	292458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012667	ATTA	2	8	292476	292483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012667	GCAG	2	8	292575	292582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012667	TCTG	2	8	306320	306327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012667	CAAT	2	8	313396	313403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012667	CTGC	2	8	318916	318923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012667	CTTG	2	8	318995	319002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012667	GCCA	2	8	319101	319108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012667	CTTT	2	8	324600	324607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012667	GCTG	2	8	325041	325048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012667	TACT	2	8	325148	325155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012667	AGCC	2	8	329536	329543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012667	ACCT	2	8	329656	329663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012667	TAAA	2	8	329893	329900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012667	CTTT	2	8	330121	330128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012667	ATTT	2	8	330407	330414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012667	ATAG	2	8	337788	337795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012667	CTGA	2	8	338068	338075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012667	ACTA	2	8	341358	341365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012667	TCGC	2	8	341396	341403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012667	GTGC	2	8	342149	342156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_012667	GTGA	2	8	342700	342707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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