MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 3627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	CCA	2	6	21	26	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012667	CG	3	6	450	455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012667	TCAA	2	8	466	473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012667	AGCT	2	8	519	526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012667	CAT	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012667	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012667	CG	3	6	888	893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012667	TCAA	2	8	904	911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012667	GTG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012667	A	6	6	1672	1677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012667	TAA	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012667	GCG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012667	CA	3	6	1783	1788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012667	ACA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012667	T	6	6	1870	1875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012667	TTC	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012667	ATG	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012667	AG	3	6	1977	1982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012667	GTTA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012667	ATA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012667	TGT	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012667	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012667	CCA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012667	TGG	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012667	TCAT	2	8	4186	4193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012667	AAC	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012667	T	7	7	5359	5365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012667	AGTG	2	8	5377	5384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012667	A	6	6	6163	6168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012667	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012667	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012667	AAT	2	6	6385	6390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012667	CAC	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012667	AAC	2	6	6492	6497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012667	CT	3	6	8297	8302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012667	AAG	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012667	AGG	2	6	11058	11063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012667	CAG	2	6	11984	11989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012667	TCT	2	6	14828	14833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012667	ACT	2	6	14848	14853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012667	TCCATC	2	12	14881	14892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012667	AC	3	6	14900	14905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012667	AAGG	2	8	15079	15086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012667	GATT	2	8	15723	15730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012667	TCG	2	6	16145	16150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012667	ATT	2	6	17415	17420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012667	AAT	2	6	17422	17427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012667	T	6	6	17454	17459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012667	T	7	7	17474	17480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012667	AAG	2	6	17494	17499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012667	TCA	2	6	17534	17539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012667	GAT	2	6	17605	17610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012667	CTG	2	6	21118	21123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012667	CTC	2	6	23809	23814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012667	AG	3	6	24798	24803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012667	TG	3	6	24840	24845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012667	GGC	2	6	24970	24975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012667	AGTG	2	8	24977	24984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012667	ATAG	2	8	25068	25075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012667	A	6	6	25913	25918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012667	TCG	2	6	26030	26035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012667	GCG	2	6	26070	26075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012667	CAC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012667	ATT	2	6	26161	26166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012667	TTTAT	2	10	26171	26180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012667	AT	3	6	26206	26211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012667	ATT	2	6	26235	26240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012667	TTTA	2	8	26258	26265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012667	CTAA	2	8	26272	26279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012667	TTA	2	6	26348	26353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012667	TGA	2	6	26368	26373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012667	AAT	2	6	26420	26425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012667	GCCA	2	8	26447	26454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012667	TTC	2	6	29606	29611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012667	T	6	6	29650	29655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012667	TTAA	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012667	AGA	2	6	31604	31609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012667	TAA	2	6	31664	31669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012667	A	6	6	31721	31726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012667	A	6	6	31740	31745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012667	TCA	2	6	31788	31793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012667	TGCT	2	8	31808	31815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012667	TGA	2	6	33468	33473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012667	A	6	6	33498	33503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012667	CTG	2	6	33508	33513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012667	AGT	2	6	33640	33645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012667	ATT	2	6	33654	33659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012667	TAAA	2	8	33691	33698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012667	TTA	2	6	36033	36038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012667	AG	3	6	36041	36046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012667	CAAA	2	8	36052	36059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012667	ACT	2	6	36075	36080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012667	A	6	6	36082	36087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012667	AT	3	6	36094	36099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012667	TAA	2	6	36123	36128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012667	CT	3	6	36130	36135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012667	TGAGT	2	10	36146	36155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012667	CTT	2	6	36294	36299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012667	CGTT	2	8	36326	36333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012667	CA	3	6	36343	36348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012667	CT	3	6	36374	36379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012667	GCC	2	6	36381	36386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012667	TA	3	6	36412	36417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012667	CCA	2	6	36425	36430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_012667	TACT	2	8	36433	36440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012667	AAT	2	6	36539	36544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012667	ATT	2	6	36576	36581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012667	TAATT	2	10	36591	36600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012667	AATT	2	8	36618	36625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012667	AAT	2	6	36652	36657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012667	A	7	7	36660	36666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012667	AAG	3	9	36812	36820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012667	TCA	2	6	36833	36838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012667	AAG	2	6	36959	36964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012667	ATCC	2	8	38256	38263	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012667	A	6	6	38325	38330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012667	TGA	2	6	38331	38336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012667	GTC	2	6	41220	41225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012667	CGT	2	6	41247	41252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012667	GT	3	6	41251	41256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012667	GC	3	6	41308	41313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012667	GAT	2	6	41346	41351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012667	TCA	2	6	41390	41395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012667	GT	3	6	41438	41443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012667	AAG	2	6	41471	41476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012667	T	6	6	41497	41502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012667	CTG	2	6	41506	41511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012667	TTCT	2	8	43128	43135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012667	ACA	2	6	43168	43173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012667	GAAG	2	8	44365	44372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012667	ATA	2	6	44422	44427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012667	CTT	2	6	48002	48007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012667	TG	4	8	48076	48083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012667	CAT	2	6	48091	48096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012667	CG	3	6	48132	48137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012667	GCA	2	6	48175	48180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012667	ATGA	2	8	48183	48190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012667	CAAGC	2	10	49720	49729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_012667	GCTTG	2	10	49735	49744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012667	CAA	2	6	49772	49777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012667	A	6	6	49787	49792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012667	GAC	2	6	51332	51337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012667	CT	4	8	51349	51356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012667	CTA	2	6	51390	51395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012667	AAG	2	6	52841	52846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012667	AGT	2	6	52857	52862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012667	CTT	2	6	53026	53031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012667	AAAG	2	8	53180	53187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012667	ACC	2	6	53222	53227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_012667	A	6	6	69908	69913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_012667	TGC	2	6	98956	98961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_012667	ATA	2	6	157090	157095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_012667	TGA	2	6	158819	158824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_012667	TGT	2	6	158917	158922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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