MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012583	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012583	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012583	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012583	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012583	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012583	AATC	2	8	11912	11919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012583	TCAC	2	8	12133	12140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012583	CAAG	2	8	19600	19607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012583	TCAT	2	8	19739	19746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012583	GGAA	2	8	20412	20419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012583	AATC	2	8	32793	32800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012583	TGAT	2	8	37552	37559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012583	AAGT	2	8	45446	45453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012583	TGAG	2	8	48366	48373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012583	ATCT	2	8	50931	50938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012583	AGTG	2	8	51292	51299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012583	AATT	2	8	66908	66915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012583	CGTT	2	8	67010	67017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012583	GATG	2	8	67093	67100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012583	CTAT	2	8	67215	67222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012583	CTTG	2	8	77343	77350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012583	AAAT	2	8	79137	79144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012583	ATTT	2	8	86357	86364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012583	AATT	2	8	86379	86386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012583	TATT	2	8	86420	86427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012583	TGAC	2	8	88394	88401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012583	TTAT	2	8	93532	93539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012583	TTGG	2	8	93542	93549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012583	ATTT	2	8	93555	93562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012583	CACT	2	8	100027	100034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012583	AGTG	2	8	100568	100575	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012583	ACCA	2	8	100604	100611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012583	TCAC	2	8	102193	102200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012583	TTTA	2	8	102229	102236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012583	ATTT	2	8	102341	102348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012583	TTTA	2	8	102417	102424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012583	TCAC	2	8	105303	105310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012583	GCTG	2	8	105398	105405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012583	TCAC	2	8	110032	110039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012583	TTTA	2	8	114552	114559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012583	ACTT	2	8	114575	114582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012583	TAAT	2	8	114664	114671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012583	TAAT	2	8	114835	114842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012583	ATTT	2	8	116714	116721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012583	TTGA	2	8	116812	116819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012583	TCAA	2	8	116826	116833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012583	GAAG	2	8	116886	116893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012583	GAGC	2	8	117081	117088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012583	CTGA	2	8	117118	117125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012583	TTGA	2	8	117223	117230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012583	TATT	2	8	124099	124106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012583	GAGC	2	8	124248	124255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012583	GAGC	2	8	124695	124702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012583	TGGC	2	8	132622	132629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012583	TAAA	2	8	132847	132854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012583	TGAT	2	8	133025	133032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012583	CTTT	2	8	133328	133335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012583	GCGA	2	8	133588	133595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012583	TACC	2	8	133658	133665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012583	GTCT	2	8	133700	133707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012583	TCAA	2	8	134198	134205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012583	CTAT	2	8	135224	135231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012583	CAAG	2	8	135315	135322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012583	GCTG	2	8	135384	135391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012583	GAAG	2	8	137348	137355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012583	AATG	2	8	141041	141048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012583	TTAA	2	8	141070	141077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012583	CTCA	2	8	149283	149290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012583	TGAG	2	8	149310	149317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012583	ATTT	2	8	152802	152809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012583	CGTT	2	8	157446	157453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012583	ACTC	2	8	157489	157496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012583	GGTT	2	8	160792	160799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012583	TCTG	2	8	160820	160827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012583	ATTG	2	8	163813	163820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012583	CTGG	2	8	170031	170038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012583	GATT	2	8	180002	180009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012583	TAGA	2	8	180143	180150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012583	CGTT	2	8	180220	180227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012583	AAAC	2	8	181499	181506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012583	GCTG	2	8	181756	181763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012583	ATTG	2	8	181828	181835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012583	AAAT	2	8	184064	184071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012583	GATT	2	8	184491	184498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012583	CATT	2	8	184615	184622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012583	CAGC	2	8	192630	192637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012583	AATG	2	8	192695	192702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012583	ATAG	2	8	195162	195169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012583	GAAC	2	8	195185	195192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012583	AGCC	2	8	203397	203404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012583	GGCT	2	8	203411	203418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012583	ACGG	2	8	203734	203741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012583	CCAA	2	8	203753	203760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012583	AATG	2	8	204582	204589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012583	AGGT	2	8	204611	204618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012583	TTAA	2	8	205013	205020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012583	GTCA	2	8	217826	217833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012583	CTAT	2	8	225316	225323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012583	TGCT	2	8	230720	230727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012583	CCAA	2	8	248108	248115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012583	TGCA	2	8	248153	248160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012583	CCCA	2	8	248185	248192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_012583	CCCG	2	8	248260	248267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_012583	GCTT	2	8	249213	249220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012583	CTTA	2	8	255152	255159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012583	CTTT	2	8	255279	255286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012583	GCAA	2	8	259610	259617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012583	CCTT	2	8	264093	264100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012583	GGAT	2	8	270203	270210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012583	AATT	2	8	271841	271848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012583	AGTA	2	8	272026	272033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012583	GAAC	2	8	272132	272139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012583	TTTG	2	8	272407	272414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012583	TCAG	2	8	272712	272719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012583	GGGT	2	8	272775	272782	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012583	CGCT	2	8	272890	272897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012583	TACC	2	8	273620	273627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012583	ACAA	2	8	274186	274193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012583	TTGG	2	8	274404	274411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012583	TTGG	2	8	274643	274650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012583	TTTA	2	8	274757	274764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012583	AAGC	2	8	276639	276646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012583	TTAA	2	8	276855	276862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012583	TGGC	2	8	282001	282008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012583	GTTA	2	8	282175	282182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012583	TAAA	2	8	282190	282197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012583	AATA	2	8	282211	282218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012583	TCTA	2	8	283379	283386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012583	TCAA	2	8	292723	292730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012583	CCTT	2	8	293369	293376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012583	TCAC	2	8	303070	303077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012583	ATGA	2	8	304262	304269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012583	TAAC	2	8	304996	305003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012583	TTGA	2	8	307544	307551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012583	CAAG	2	8	307883	307890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012583	AGCT	2	8	307929	307936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012583	TTGA	2	8	307982	307989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012583	CCAG	2	8	313676	313683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012583	TGAA	2	8	315150	315157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012583	TACT	2	8	317134	317141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012583	ATGA	2	8	318459	318466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012583	TGAC	2	8	323529	323536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012583	TGCT	2	8	323651	323658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012583	GCTC	2	8	325393	325400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012583	TCAA	2	8	326097	326104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012583	CTTA	2	8	327581	327588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012583	GTGA	2	8	330697	330704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012583	CAAT	2	8	332720	332727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_012583	CCTT	2	8	334915	334922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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