MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 3327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012583	ATC	2	6	423114	423119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_012583	CTT	2	6	423130	423135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_012583	CAA	2	6	423251	423256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_012583	GTT	2	6	423273	423278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012583	AGC	2	6	423313	423318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_012583	CTTT	2	8	423337	423344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_012583	GT	3	6	423426	423431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012583	GGT	2	6	423568	423573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012583	GTT	2	6	423578	423583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012583	GTTTGG	2	12	423586	423597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012583	GGCG	2	8	423622	423629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_012583	TTG	2	6	423766	423771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_012583	TGT	2	6	423824	423829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012583	AGT	2	6	423833	423838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012583	CAA	2	6	423840	423845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012583	TAGCT	2	10	423874	423883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_012583	CG	3	6	424048	424053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_012583	GGT	2	6	424078	424083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012583	GTT	2	6	424088	424093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012583	GGCG	2	8	424132	424139	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_012583	GTT	2	6	424899	424904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012583	GGCG	2	8	424942	424949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_012583	GGT	2	6	425475	425480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012583	GTT	2	6	425485	425490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012583	GGCG	2	8	425528	425535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_012583	TAT	2	6	425539	425544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012583	ATAA	2	8	425564	425571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012583	GTT	2	6	427272	427277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012583	GGCG	2	8	427315	427322	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_012583	GTA	2	6	428526	428531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012583	AGT	2	6	428583	428588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012583	CG	3	6	429073	429078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_012583	GGT	2	6	429103	429108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012583	GTT	2	6	429113	429118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012583	GGCG	2	8	429156	429163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_012583	A	7	7	429179	429185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012583	AATTA	2	10	429198	429207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012583	CAA	2	6	429785	429790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012583	GGT	2	6	429843	429848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012583	GTT	2	6	429853	429858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012583	GGCG	2	8	429897	429904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_012583	GGT	2	6	430418	430423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012583	GTT	2	6	430428	430433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012583	GGCG	2	8	430471	430478	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_012583	TCTA	2	8	430485	430492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_012583	A	6	6	430494	430499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012583	TCA	2	6	430500	430505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_012583	AAT	2	6	430527	430532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012583	CAA	2	6	430636	430641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_012583	TGT	2	6	430657	430662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012583	CAAA	2	8	430846	430853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_012583	A	6	6	430860	430865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012583	GTT	2	6	430962	430967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012583	TGG	2	6	430979	430984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_012583	GTAA	2	8	430995	431002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012583	CCA	2	6	431067	431072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_012583	TA	3	6	433471	433476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012583	TAT	2	6	433522	433527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012583	TAGGG	2	10	433575	433584	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012583	TGC	2	6	433589	433594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_012583	CAT	2	6	433601	433606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_012583	T	6	6	433611	433616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012583	TCA	2	6	433624	433629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_012583	TTCC	2	8	433641	433648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_012583	T	6	6	433737	433742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012583	TA	3	6	433754	433759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012583	TAA	2	6	433773	433778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012583	TA	3	6	433823	433828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012583	AC	3	6	433857	433862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_012583	AC	3	6	433870	433875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_012583	TTA	2	6	433901	433906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012583	TAGG	2	8	434324	434331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012583	GGTC	2	8	434479	434486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_012583	TTA	2	6	435199	435204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012583	TTAG	2	8	435972	435979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_012583	GTA	3	9	436096	436104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012583	TGT	2	6	436138	436143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012583	CA	3	6	436178	436183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_012583	ATT	4	12	437689	437700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012583	TTG	2	6	437703	437708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012583	GAA	2	6	437851	437856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012583	ACC	2	6	437861	437866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_012583	TTA	2	6	437868	437873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_012583	TAT	2	6	437999	438004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012583	TCC	2	6	438048	438053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_012583	ATTA	2	8	438061	438068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012583	CAA	2	6	438092	438097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_012583	TAA	2	6	438427	438432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012583	ATT	2	6	438785	438790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012583	TTA	3	9	438795	438803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012583	TTG	2	6	438804	438809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012583	TAG	2	6	438813	438818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012583	AGA	2	6	438880	438885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012583	TGC	2	6	438891	438896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_012583	TCCTT	2	10	438924	438933	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1599	NC_012583	TTG	2	6	438935	438940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012583	TGT	2	6	438944	438949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012583	TG	3	6	438982	438987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012583	TCA	2	6	438993	438998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_012583	T	6	6	439007	439012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012583	ATA	2	6	439062	439067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_012583	ATT	2	6	439095	439100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012583	TCA	2	6	439194	439199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012583	TGGT	2	8	439201	439208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012583	GCGCT	2	10	439247	439256	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1609	NC_012583	GGC	2	6	439292	439297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_012583	TTG	2	6	439322	439327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012583	TA	3	6	439352	439357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012583	GT	3	6	439416	439421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012583	TTGT	2	8	439422	439429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012583	TG	3	6	439442	439447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012583	GCG	2	6	439457	439462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_012583	TTG	2	6	440399	440404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012583	AC	3	6	441266	441271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_012583	TGTT	3	12	441395	441406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012583	TTA	2	6	441463	441468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012583	CTT	2	6	441482	441487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_012583	GCAA	2	8	441919	441926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_012583	TTA	2	6	442002	442007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012583	ATTA	2	8	442016	442023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012583	T	6	6	442064	442069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012583	ATT	2	6	442076	442081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012583	T	6	6	442147	442152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012583	TTA	2	6	442232	442237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012583	CTC	2	6	442971	442976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_012583	TTG	2	6	442982	442987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012583	TTA	2	6	442988	442993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012583	ACA	2	6	443018	443023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_012583	GAT	2	6	443039	443044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012583	CAA	2	6	443060	443065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_012583	ACCAA	2	10	443097	443106	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1635	NC_012583	GTAAC	2	10	443134	443143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1637	NC_012583	GGA	2	6	443256	443261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_012583	CGTT	2	8	564759	564766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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