MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 4080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	ATC	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012582	TCT	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012582	ACA	2	6	368	373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012582	TCT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012582	GTA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012582	GCT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012582	ATT	2	6	1855	1860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012582	AAG	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012582	AGA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012582	AGT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012582	CTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012582	TTG	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012582	TGT	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012582	TTA	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012582	CAA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012582	CTC	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012582	TGT	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012582	ACT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012582	GCA	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012582	GTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012582	CAA	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012582	GTA	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012582	AAC	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012582	GGC	2	6	6685	6690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012582	GTG	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012582	ATT	2	6	6928	6933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012582	GAT	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012582	GCA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012582	TTC	2	6	7000	7005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012582	AGG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012582	ATT	2	6	7134	7139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012582	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012582	ACG	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012582	CAG	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012582	TAT	2	6	7492	7497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012582	GAT	2	6	7817	7822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012582	TGA	2	6	7834	7839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012582	AAG	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012582	AGA	2	6	7888	7893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012582	CCA	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012582	ATC	2	6	8872	8877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012582	GAA	2	6	9065	9070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012582	AAC	2	6	10673	10678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012582	TCG	2	6	12311	12316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012582	ATT	2	6	12320	12325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012582	CAA	2	6	12778	12783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012582	GTA	2	6	12816	12821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012582	CTT	2	6	14765	14770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012582	ATC	2	6	14781	14786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012582	ACG	2	6	14824	14829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012582	TAG	2	6	15967	15972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012582	TGA	2	6	16188	16193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012582	TAC	2	6	17967	17972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012582	GAT	2	6	19280	19285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012582	GCG	2	6	19578	19583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012582	GCT	2	6	19610	19615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012582	TAT	2	6	21205	21210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012582	ACC	2	6	21248	21253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012582	TCA	2	6	21261	21266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012582	CAT	2	6	21307	21312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012582	TTC	2	6	21405	21410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012582	ATT	2	6	23831	23836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012582	TGC	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012582	CAA	3	9	25099	25107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012582	TTG	2	6	25116	25121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012582	CAA	2	6	33927	33932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012582	CAG	2	6	33950	33955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012582	ATA	2	6	33979	33984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012582	GCA	2	6	34089	34094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012582	ACT	2	6	35580	35585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012582	TCA	2	6	36636	36641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012582	CAA	2	6	36671	36676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012582	ACC	2	6	36786	36791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012582	ATT	2	6	39720	39725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012582	CCG	2	6	40743	40748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012582	CAT	2	6	40765	40770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012582	GCC	2	6	41432	41437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_012582	GCT	2	6	41512	41517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012582	CCA	2	6	41565	41570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012582	ACA	2	6	41582	41587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012582	CCA	2	6	41642	41647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012582	ACA	3	9	41686	41694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012582	CAA	2	6	41812	41817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012582	AAT	2	6	41824	41829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012582	TAA	2	6	41882	41887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012582	AAC	2	6	41905	41910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012582	CAA	2	6	41915	41920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012582	TTC	2	6	42156	42161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012582	ATG	2	6	42220	42225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012582	CCT	2	6	42668	42673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012582	AGC	2	6	42696	42701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012582	GCG	2	6	42839	42844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012582	AGG	2	6	42855	42860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012582	TTC	2	6	43293	43298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012582	TAG	2	6	57418	57423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012582	TGC	2	6	57957	57962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012582	ATA	2	6	57972	57977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012582	GTT	2	6	60747	60752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012582	ATA	2	6	60783	60788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012582	TTC	2	6	60828	60833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012582	ACA	2	6	65088	65093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012582	TTG	2	6	65115	65120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012582	GGC	2	6	66588	66593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012582	CAA	2	6	66608	66613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012582	TCA	2	6	68417	68422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012582	CAA	2	6	70068	70073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012582	CAA	2	6	70087	70092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012582	CCA	2	6	70098	70103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012582	TGG	2	6	70107	70112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012582	TGC	2	6	70229	70234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012582	ATA	2	6	70301	70306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012582	GGC	2	6	70473	70478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012582	ACA	2	6	70561	70566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012582	ACA	2	6	70622	70627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012582	ATA	2	6	73897	73902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012582	TAA	3	9	74176	74184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012582	GAT	2	6	75983	75988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012582	GCA	2	6	76820	76825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012582	GCT	2	6	76994	76999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012582	TTA	2	6	77022	77027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012582	TCC	2	6	78686	78691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012582	AAC	2	6	78898	78903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012582	TGC	2	6	78905	78910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012582	ATG	2	6	81054	81059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012582	CAG	2	6	81060	81065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012582	CCG	2	6	81098	81103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012582	TCG	2	6	81121	81126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012582	CCG	2	6	81603	81608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012582	GCA	2	6	85815	85820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012582	GGA	2	6	85868	85873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012582	TTG	2	6	86617	86622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012582	CAA	2	6	86634	86639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012582	ACC	2	6	88946	88951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012582	AGC	2	6	88967	88972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012582	CAG	2	6	89032	89037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012582	TAG	2	6	90189	90194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012582	CGC	2	6	90200	90205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012582	ACA	2	6	90256	90261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012582	TCA	2	6	90262	90267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012582	CTT	2	6	90328	90333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012582	AGC	2	6	94173	94178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012582	GCG	2	6	94991	94996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012582	TTG	2	6	96605	96610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012582	GGC	2	6	98817	98822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012582	TCC	2	6	99228	99233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_012582	ATT	2	6	101862	101867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_012582	ACC	2	6	119284	119289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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