MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012582	ACT	2	6	172021	172026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012582	ATT	2	6	172190	172195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012582	TTGA	2	8	174407	174414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012582	TAA	2	6	174416	174421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012582	GGC	2	6	174425	174430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012582	GCT	2	6	174452	174457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012582	TTG	2	6	176575	176580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012582	TAG	2	6	176619	176624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012582	TAA	2	6	176628	176633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012582	TA	3	6	176643	176648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012582	TA	4	8	176655	176662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012582	CCT	2	6	176672	176677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_012582	A	6	6	176684	176689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012582	ACA	2	6	180095	180100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_012582	CCA	2	6	185371	185376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_012582	AAAC	2	8	186270	186277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_012582	AGG	2	6	187707	187712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012582	T	6	6	188181	188186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012582	GT	3	6	188215	188220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012582	T	6	6	188235	188240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012582	TAA	2	6	188262	188267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012582	AAT	2	6	188289	188294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012582	CTT	2	6	188299	188304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012582	ACG	2	6	188354	188359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012582	A	6	6	189760	189765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012582	T	7	7	191042	191048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012582	TGA	2	6	191106	191111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012582	A	7	7	191143	191149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012582	TAGG	2	8	191154	191161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012582	TAA	2	6	192076	192081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012582	ACG	2	6	192108	192113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012582	TG	3	6	195531	195536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012582	AG	3	6	195537	195542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012582	T	6	6	195615	195620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012582	AGTCG	2	10	195647	195656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
536	NC_012582	T	6	6	195690	195695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012582	ATA	2	6	197823	197828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012582	GA	3	6	197834	197839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012582	TAG	2	6	198510	198515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012582	A	6	6	198566	198571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012582	ACA	2	6	198581	198586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012582	GCC	2	6	198605	198610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_012582	TCT	2	6	198611	198616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012582	AAG	2	6	198630	198635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012582	CAAT	2	8	198658	198665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_012582	TG	3	6	198667	198672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012582	TGA	2	6	198682	198687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012582	A	6	6	198693	198698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012582	GGC	2	6	198851	198856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012582	GCA	2	6	198882	198887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012582	GCG	2	6	198915	198920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_012582	CGA	2	6	199090	199095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012582	GAT	2	6	199115	199120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012582	GCA	2	6	199164	199169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_012582	GAA	2	6	199223	199228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012582	GGT	2	6	199266	199271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012582	AGA	2	6	199306	199311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012582	CAG	2	6	199332	199337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012582	GGT	2	6	199397	199402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012582	G	6	6	199479	199484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012582	GGC	2	6	199543	199548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012582	GAA	2	6	199786	199791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012582	TGC	2	6	199862	199867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_012582	GTC	2	6	199874	199879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012582	TGG	2	6	199952	199957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012582	GGA	2	6	199988	199993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012582	GAC	2	6	200001	200006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012582	TCA	2	6	200013	200018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012582	AC	3	6	200039	200044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_012582	CGT	2	6	200107	200112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012582	AC	3	6	200208	200213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_012582	AAG	2	6	200244	200249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012582	GGA	2	6	200268	200273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012582	CCT	2	6	200349	200354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_012582	TGA	2	6	200371	200376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012582	CA	3	6	200382	200387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_012582	GATT	2	8	200388	200395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012582	AGA	2	6	200409	200414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012582	CGG	2	6	200463	200468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012582	TCCT	2	8	200597	200604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_012582	CAC	2	6	200696	200701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_012582	ACC	2	6	200732	200737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_012582	GCC	2	6	200762	200767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_012582	AAG	2	6	200798	200803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012582	ACA	2	6	200839	200844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_012582	TTG	2	6	200850	200855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012582	CAA	2	6	200893	200898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012582	GTT	2	6	201004	201009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012582	GAG	2	6	201252	201257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012582	GTA	2	6	201279	201284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012582	GCG	2	6	201285	201290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012582	G	6	6	201437	201442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012582	TCC	2	6	201447	201452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_012582	CTGA	2	8	201467	201474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_012582	GTAC	2	8	201551	201558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_012582	GTG	2	6	201578	201583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012582	GGA	2	6	201755	201760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012582	TAC	2	6	201878	201883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012582	AGTA	2	8	201953	201960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012582	AC	3	6	201972	201977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_012582	CGTC	2	8	201990	201997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_012582	AAC	2	6	202009	202014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012582	AGC	2	6	202098	202103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012582	CAT	2	6	202104	202109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012582	AAAG	2	8	202112	202119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012582	AGTCG	2	10	202134	202143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
607	NC_012582	CCT	2	6	202314	202319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_012582	G	6	6	202446	202451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012582	CT	4	8	202527	202534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_012582	ACG	2	6	202546	202551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_012582	GCT	2	6	202556	202561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012582	GGT	2	6	202646	202651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012582	GA	3	6	202676	202681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012582	TTA	2	6	202803	202808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012582	CGG	2	6	202927	202932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012582	ATG	2	6	203003	203008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012582	TGAAAT	2	12	203036	203047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012582	TAC	2	6	203101	203106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012582	ACC	2	6	203198	203203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_012582	TGG	2	6	203258	203263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012582	TCC	2	6	203284	203289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_012582	GGA	2	6	203301	203306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012582	GGT	2	6	203421	203426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012582	CGG	2	6	203508	203513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012582	TCA	2	6	203536	203541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012582	CGT	2	6	203616	203621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012582	GCT	2	6	203670	203675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012582	GTT	2	6	203838	203843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012582	GT	3	6	203869	203874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012582	ACA	2	6	203930	203935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_012582	TG	4	8	203979	203986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012582	TTG	2	6	204010	204015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012582	T	7	7	204024	204030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012582	GAAAC	2	10	204114	204123	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
635	NC_012582	CAC	2	6	204198	204203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_012582	CA	3	6	204212	204217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_012582	GA	3	6	204225	204230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012582	TC	3	6	204304	204309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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