MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012582	AGCTC	2	10	2446695	2446704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6002	NC_012582	A	7	7	2446724	2446730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012582	GTT	2	6	2446754	2446759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012582	CTTC	2	8	2448915	2448922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_012582	CAAAA	2	10	2448961	2448970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6006	NC_012582	CGA	2	6	2449021	2449026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012582	CAT	2	6	2449088	2449093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012582	TAA	2	6	2449103	2449108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_012582	CAAAT	2	10	2449113	2449122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6010	NC_012582	TAGA	2	8	2449160	2449167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012582	AG	3	6	2449188	2449193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012582	AG	3	6	2449254	2449259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012582	A	6	6	2450000	2450005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_012582	TGA	2	6	2450040	2450045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_012582	T	6	6	2451031	2451036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012582	ATT	2	6	2451044	2451049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_012582	AAAAAG	2	12	2451146	2451157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_012582	TTA	2	6	2451168	2451173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012582	ATA	2	6	2451261	2451266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012582	A	6	6	2451266	2451271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012582	GGCTTT	2	12	2451289	2451300	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6022	NC_012582	ACCTT	2	10	2452886	2452895	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6023	NC_012582	AAGGTT	2	12	2452896	2452907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012582	CTT	2	6	2456118	2456123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_012582	A	6	6	2456179	2456184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_012582	AAAAG	2	10	2456188	2456197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012582	CAA	2	6	2459246	2459251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_012582	CGG	2	6	2460253	2460258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012582	TTCT	2	8	2460485	2460492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_012582	TC	3	6	2460531	2460536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_012582	CAG	2	6	2460549	2460554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_012582	A	6	6	2460565	2460570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_012582	TGC	2	6	2460636	2460641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_012582	GGA	2	6	2460684	2460689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_012582	T	6	6	2460900	2460905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_012582	TA	3	6	2460974	2460979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_012582	CTAGC	2	10	2462674	2462683	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6038	NC_012582	AGAA	2	8	2464325	2464332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_012582	CTTA	2	8	2467987	2467994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_012582	TC	3	6	2468617	2468622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_012582	ATT	2	6	2468628	2468633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_012582	CG	3	6	2468647	2468652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_012582	CTC	2	6	2468729	2468734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_012582	AAG	2	6	2468755	2468760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012582	AG	3	6	2468771	2468776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_012582	CAC	2	6	2471393	2471398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_012582	TTCA	2	8	2471461	2471468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_012582	AAC	2	6	2471479	2471484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_012582	TCA	2	6	2474878	2474883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_012582	TAT	2	6	2475696	2475701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_012582	CAG	2	6	2475702	2475707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012582	GAA	2	6	2475712	2475717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012582	CAAA	2	8	2478205	2478212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_012582	TTA	3	9	2478231	2478239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012582	CAA	2	6	2478651	2478656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_012582	TCA	2	6	2478734	2478739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_012582	CTC	2	6	2479289	2479294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_012582	AATG	2	8	2479377	2479384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_012582	CAA	2	6	2479406	2479411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_012582	CAAA	2	8	2479507	2479514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_012582	ATA	2	6	2479517	2479522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_012582	GAAC	2	8	2479609	2479616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_012582	TG	3	6	2480004	2480009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_012582	AAT	2	6	2481460	2481465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_012582	TCT	2	6	2486638	2486643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_012582	TCC	2	6	2487802	2487807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_012582	TCA	2	6	2487813	2487818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_012582	GGT	2	6	2487852	2487857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_012582	CAG	2	6	2487912	2487917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_012582	CTCA	2	8	2487941	2487948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_012582	TTC	2	6	2493297	2493302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_012582	AGC	2	6	2495933	2495938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_012582	A	7	7	2497600	2497606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_012582	TGC	2	6	2497612	2497617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012582	TTTCG	2	10	2498228	2498237	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6076	NC_012582	TTCG	2	8	2498245	2498252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_012582	AG	3	6	2499010	2499015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012582	TCA	2	6	2499065	2499070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_012582	TG	4	8	2500965	2500972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012582	GC	3	6	2501041	2501046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_012582	TG	3	6	2501067	2501072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_012582	A	6	6	2501078	2501083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_012582	TCG	2	6	2501085	2501090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_012582	GAC	2	6	2501136	2501141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_012582	TG	3	6	2501193	2501198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_012582	CTG	2	6	2502090	2502095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_012582	T	7	7	2502106	2502112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_012582	CAAC	2	8	2504865	2504872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_012582	GAAC	2	8	2504990	2504997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_012582	A	6	6	2507030	2507035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_012582	CTG	2	6	2507045	2507050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_012582	TGG	2	6	2507057	2507062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_012582	TAGG	2	8	2508203	2508210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_012582	ACATC	2	10	2511740	2511749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6095	NC_012582	TC	3	6	2513016	2513021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_012582	TTC	2	6	2514248	2514253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_012582	AGC	2	6	2514682	2514687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_012582	CGG	2	6	2514725	2514730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_012582	TGA	2	6	2514781	2514786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012582	AGT	2	6	2516089	2516094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012582	A	9	9	2516095	2516103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012582	TCT	2	6	2516640	2516645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_012582	A	6	6	2517959	2517964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012582	GGC	2	6	2517987	2517992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_012582	A	6	6	2518008	2518013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_012582	AGA	2	6	2518077	2518082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_012582	T	6	6	2518138	2518143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_012582	A	7	7	2518150	2518156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_012582	GTC	2	6	2518202	2518207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012582	ACC	2	6	2518468	2518473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_012582	AAATT	2	10	2518477	2518486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_012582	ACA	2	6	2518487	2518492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_012582	T	6	6	2518543	2518548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012582	TAATT	2	10	2518551	2518560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_012582	TTA	2	6	2518567	2518572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_012582	TCT	2	6	2518630	2518635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_012582	GAT	2	6	2518656	2518661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_012582	AAG	2	6	2520295	2520300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012582	T	6	6	2520319	2520324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_012582	T	8	8	2520332	2520339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012582	GCT	2	6	2520383	2520388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_012582	CT	3	6	2520429	2520434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_012582	GTT	2	6	2520460	2520465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_012582	TGC	2	6	2520473	2520478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_012582	TCA	2	6	2522946	2522951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_012582	ACG	2	6	2524342	2524347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_012582	AC	3	6	2524361	2524366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_012582	ATA	2	6	2526027	2526032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_012582	AATC	2	8	2526853	2526860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_012582	TGA	2	6	2526862	2526867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_012582	TAC	2	6	2526869	2526874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_012582	TCA	2	6	2526923	2526928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_012582	C	8	8	2526932	2526939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6134	NC_012582	CT	4	8	2526963	2526970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6135	NC_012582	CATT	2	8	2526971	2526978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6136	NC_012582	AACA	2	8	2526996	2527003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6137	NC_012582	CGA	2	6	2527030	2527035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_012582	ATG	2	6	2527065	2527070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6141	NC_012582	TAA	3	9	2528207	2528215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_012582	GAGC	2	8	2528256	2528263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6143	NC_012582	AGCC	2	8	2529654	2529661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6147	NC_012582	ATC	2	6	2535846	2535851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_012582	TGAC	2	8	2535905	2535912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6149	NC_012582	TAA	2	6	2535972	2535977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_012582	TTG	2	6	2536350	2536355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_012582	ACA	2	6	2536371	2536376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6152	NC_012582	ATC	2	6	2538830	2538835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6155	NC_012582	TCG	2	6	2542319	2542324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6167	NC_012582	A	6	6	2560799	2560804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6168	NC_012582	AT	3	6	2560823	2560828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6174	NC_012582	TAA	2	6	2561951	2561956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6176	NC_012582	T	8	8	2563402	2563409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6259	NC_012582	A	6	6	2598342	2598347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6267	NC_012582	GCG	2	6	2600467	2600472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6268	NC_012582	CTT	2	6	2600523	2600528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6269	NC_012582	ATG	2	6	2600547	2600552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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