MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012582	TCG	2	6	1959870	1959875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_012582	TC	3	6	1959913	1959918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_012582	A	6	6	1959982	1959987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012582	TCAA	2	8	1959989	1959996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_012582	TGA	2	6	1960016	1960021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012582	TATTT	2	10	1960038	1960047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012582	GCA	2	6	1963127	1963132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_012582	A	7	7	1963151	1963157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012582	AAT	2	6	1963164	1963169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012582	GCT	2	6	1963285	1963290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_012582	TTA	2	6	1963300	1963305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012582	ATCA	2	8	1967040	1967047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_012582	CTG	2	6	1967088	1967093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_012582	CAA	2	6	1971090	1971095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_012582	CGG	2	6	1971143	1971148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_012582	CAC	2	6	1971177	1971182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_012582	GCT	2	6	1971215	1971220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_012582	TTGAT	2	10	1971269	1971278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012582	TTG	2	6	1971300	1971305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_012582	TTGA	2	8	1971345	1971352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012582	CT	3	6	1971357	1971362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_012582	TCT	2	6	1971368	1971373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_012582	ACT	2	6	1971399	1971404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_012582	CCAA	2	8	1971408	1971415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_012582	AG	3	6	1971483	1971488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012582	GTT	2	6	1971575	1971580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012582	CGA	2	6	1971596	1971601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_012582	T	6	6	1971620	1971625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012582	T	7	7	1971664	1971670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012582	TTGC	2	8	1971710	1971717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_012582	AT	3	6	1971742	1971747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012582	AGT	3	9	1971810	1971818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012582	ATAA	2	8	1972120	1972127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_012582	ATG	2	6	1975735	1975740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_012582	TGG	2	6	1975759	1975764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012582	TGCC	2	8	1975771	1975778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_012582	GAG	2	6	1975853	1975858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_012582	AC	3	6	1975861	1975866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_012582	CCAA	2	8	1980036	1980043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_012582	TTA	2	6	1980063	1980068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012582	T	7	7	1980146	1980152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012582	GT	3	6	1980263	1980268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_012582	TC	3	6	1980295	1980300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_012582	T	6	6	1980342	1980347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012582	TAG	2	6	1980385	1980390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_012582	AGT	2	6	1980548	1980553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012582	T	6	6	1980576	1980581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012582	AGT	2	6	1981864	1981869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012582	AC	3	6	1981871	1981876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_012582	ATTG	2	8	1981914	1981921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012582	GA	3	6	1981949	1981954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012582	A	7	7	1981958	1981964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012582	AG	3	6	1981967	1981972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012582	ATTTT	2	10	1982043	1982052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012582	TAGT	2	8	1982136	1982143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012582	CGCT	2	8	1982153	1982160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_012582	TAG	2	6	1982202	1982207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012582	GCC	2	6	1982210	1982215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_012582	TGA	2	6	1982227	1982232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012582	ACT	2	6	1982265	1982270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012582	ATG	2	6	1982288	1982293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012582	TGG	2	6	1982297	1982302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_012582	AGA	2	6	1982314	1982319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_012582	GCC	2	6	1982321	1982326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_012582	GCT	2	6	1982417	1982422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_012582	TAA	2	6	1990283	1990288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012582	TTC	2	6	1990294	1990299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_012582	GTT	2	6	1993381	1993386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012582	TGA	2	6	1993392	1993397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012582	TCT	2	6	2000537	2000542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_012582	AAT	2	6	2000571	2000576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_012582	GAT	2	6	2000580	2000585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012582	TAG	2	6	2000614	2000619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012582	CATT	2	8	2007288	2007295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5079	NC_012582	TAA	2	6	2009669	2009674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012582	A	7	7	2009704	2009710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012582	CAT	3	9	2010651	2010659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_012582	TCT	2	6	2010677	2010682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012582	GGA	2	6	2010688	2010693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_012582	TCC	2	6	2010701	2010706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_012582	ACCCT	2	10	2013505	2013514	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5087	NC_012582	A	6	6	2017495	2017500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_012582	CCT	2	6	2017558	2017563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_012582	AC	3	6	2017575	2017580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_012582	ACA	2	6	2017628	2017633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_012582	CA	3	6	2017632	2017637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_012582	ATT	2	6	2017653	2017658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_012582	T	8	8	2017657	2017664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_012582	GAA	2	6	2017680	2017685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_012582	T	6	6	2017690	2017695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_012582	AGC	2	6	2020178	2020183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_012582	ATG	2	6	2020213	2020218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_012582	A	6	6	2020548	2020553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_012582	AT	3	6	2020595	2020600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_012582	TCA	2	6	2020602	2020607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_012582	ATAA	2	8	2021285	2021292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012582	CTG	2	6	2024312	2024317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_012582	TGA	2	6	2024361	2024366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_012582	ATA	2	6	2025257	2025262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012582	TA	3	6	2026565	2026570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012582	GAA	2	6	2026577	2026582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012582	AAT	2	6	2026696	2026701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_012582	TAA	2	6	2026713	2026718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012582	TAA	2	6	2026741	2026746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_012582	TA	4	8	2026770	2026777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_012582	GATT	2	8	2026828	2026835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012582	T	6	6	2026841	2026846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012582	AGAA	2	8	2026897	2026904	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012582	CAG	2	6	2027340	2027345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_012582	TGA	2	6	2027354	2027359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_012582	CT	3	6	2031667	2031672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_012582	AAT	2	6	2031899	2031904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_012582	T	8	8	2032012	2032019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_012582	CTT	2	6	2032050	2032055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_012582	TTG	2	6	2032214	2032219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_012582	TAT	2	6	2032225	2032230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_012582	TTA	2	6	2032549	2032554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_012582	CAT	2	6	2032574	2032579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_012582	AT	3	6	2032588	2032593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_012582	AGT	2	6	2032614	2032619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_012582	CAT	2	6	2033122	2033127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_012582	TG	3	6	2033137	2033142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_012582	TTAA	2	8	2033156	2033163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_012582	TAC	2	6	2033175	2033180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_012582	TG	3	6	2033220	2033225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_012582	GATC	2	8	2033250	2033257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_012582	ATT	2	6	2033313	2033318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_012582	TTC	2	6	2033647	2033652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_012582	AGG	2	6	2033674	2033679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_012582	ATC	2	6	2034172	2034177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_012582	G	7	7	2034185	2034191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_012582	TCA	2	6	2034206	2034211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_012582	GA	3	6	2035277	2035282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_012582	T	6	6	2035283	2035288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_012582	TAA	2	6	2035391	2035396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5146	NC_012582	TTA	2	6	2035535	2035540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5148	NC_012582	GAA	2	6	2035667	2035672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5150	NC_012582	A	6	6	2035846	2035851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_012582	AGA	2	6	2035930	2035935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_012582	AAC	2	6	2036174	2036179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5156	NC_012582	TCAA	2	8	2037105	2037112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5160	NC_012582	AGAT	2	8	2037492	2037499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_012582	T	6	6	2037881	2037886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_012582	A	8	8	2078431	2078438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_012582	A	7	7	2078444	2078450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_012582	ATTT	2	8	2078479	2078486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_012582	T	7	7	2078492	2078498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_012582	TAA	2	6	2078604	2078609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_012582	T	6	6	2078639	2078644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_012582	AAAT	2	8	2078653	2078660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_012582	CTTA	2	8	2085610	2085617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5267	NC_012582	T	6	6	2085644	2085649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_012582	TGT	2	6	2088026	2088031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_012582	TAA	2	6	2089374	2089379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5384	NC_012582	TCC	2	6	2142419	2142424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5389	NC_012582	A	8	8	2146122	2146129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_012582	A	6	6	2147714	2147719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_012582	GTT	2	6	2148063	2148068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_012582	CAA	2	6	2148100	2148105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_012582	ACT	2	6	2148209	2148214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5395	NC_012582	CAC	2	6	2148255	2148260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5396	NC_012582	GGT	2	6	2148270	2148275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_012582	ACA	2	6	2148285	2148290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_012582	A	6	6	2148290	2148295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_012582	AAT	2	6	2150019	2150024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_012582	TTA	2	6	2150056	2150061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_012582	TCA	2	6	2150072	2150077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5402	NC_012582	CGAC	2	8	2150084	2150091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5403	NC_012582	T	6	6	2150804	2150809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_012582	GAA	2	6	2150850	2150855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5407	NC_012582	TTA	2	6	2150949	2150954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5411	NC_012582	CTA	2	6	2153284	2153289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5412	NC_012582	AATG	2	8	2153324	2153331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_012582	ATA	2	6	2153337	2153342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5420	NC_012582	CTAA	2	8	2156294	2156301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5421	NC_012582	A	8	8	2156321	2156328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_012582	CCT	2	6	2156343	2156348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5424	NC_012582	TCAA	2	8	2157700	2157707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5425	NC_012582	T	7	7	2158338	2158344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_012582	AAAT	2	8	2158373	2158380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_012582	GAT	2	6	2158387	2158392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5428	NC_012582	GAT	2	6	2158419	2158424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5430	NC_012582	TTGTG	2	10	2159835	2159844	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5431	NC_012582	A	7	7	2163452	2163458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_012582	TTGG	2	8	2166629	2166636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5433	NC_012582	CAT	2	6	2166648	2166653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5435	NC_012582	CATT	2	8	2166689	2166696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5436	NC_012582	CATA	2	8	2166834	2166841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5437	NC_012582	TTC	2	6	2168438	2168443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5463	NC_012582	GC	3	6	2177916	2177921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5473	NC_012582	AATTCC	2	12	2182743	2182754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5480	NC_012582	A	6	6	2188630	2188635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5481	NC_012582	AACG	2	8	2188681	2188688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5499	NC_012582	TATT	2	8	2197532	2197539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_012582	CA	4	8	2197575	2197582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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