MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012578	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012578	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012578	CATT	2	8	13774	13781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012578	GTTC	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012578	ACAA	2	8	20205	20212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012578	TGAC	2	8	21863	21870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012578	TTTC	2	8	21997	22004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012578	ATGG	2	8	23062	23069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012578	CTAT	2	8	23102	23109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012578	TATC	2	8	29658	29665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012578	GTCT	2	8	29705	29712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012578	TCAA	2	8	35857	35864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012578	ACTT	2	8	36083	36090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012578	ATTT	2	8	36902	36909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012578	TTTG	2	8	41947	41954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012578	CCAT	2	8	43309	43316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012578	GGTA	2	8	53332	53339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012578	CAAT	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012578	GATT	2	8	55354	55361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012578	CTGA	2	8	56172	56179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012578	GTAC	2	8	56256	56263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012578	AGTA	2	8	56658	56665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012578	CGTC	2	8	56695	56702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012578	AAAG	2	8	56817	56824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012578	GCAA	2	8	57599	57606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012578	TAAT	2	8	59137	59144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012578	CCAG	2	8	66280	66287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012578	ATCT	2	8	86361	86368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012578	CAGA	2	8	95016	95023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012578	TTGA	2	8	99530	99537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012578	TTAC	2	8	103038	103045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012578	GATT	2	8	107308	107315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012578	TGCG	2	8	114703	114710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012578	TATT	2	8	134635	134642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012578	TTGT	2	8	134667	134674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012578	GTTT	2	8	134712	134719	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012578	GTTG	2	8	134867	134874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012578	TTTG	2	8	134986	134993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012578	TCTA	2	8	140896	140903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012578	CGTT	2	8	140942	140949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012578	CTTG	2	8	142567	142574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012578	CCAA	2	8	142686	142693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012578	ATTG	2	8	145024	145031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012578	TTCA	2	8	145081	145088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012578	AACG	2	8	145198	145205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012578	GAAA	2	8	149046	149053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012578	CAAT	2	8	150866	150873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012578	GATT	2	8	152597	152604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012578	TCCT	2	8	152806	152813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012578	GCCT	2	8	152940	152947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012578	CTGA	2	8	153702	153709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012578	GTAC	2	8	153786	153793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012578	AGTA	2	8	154188	154195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012578	CGTC	2	8	154225	154232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012578	AAAG	2	8	154347	154354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012578	CTTT	2	8	159255	159262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012578	TAAA	2	8	164636	164643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012578	ATTT	2	8	167910	167917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012578	AAGA	2	8	167945	167952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012578	GTTG	2	8	168448	168455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012578	GATT	2	8	174229	174236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012578	ATTT	2	8	174294	174301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012578	CTTT	2	8	175403	175410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012578	GAGT	2	8	177889	177896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012578	TTTA	2	8	183000	183007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012578	TTGA	2	8	185018	185025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012578	GGTT	2	8	185127	185134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012578	TCGA	2	8	185298	185305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012578	GAGC	2	8	185775	185782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012578	TCAA	2	8	186062	186069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012578	TCGC	2	8	186401	186408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012578	TTAA	2	8	192400	192407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012578	ACGG	2	8	201910	201917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012578	CTTT	2	8	201948	201955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012578	TAAA	2	8	202508	202515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012578	AAGT	2	8	204618	204625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012578	GATA	2	8	215952	215959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012578	TCAC	2	8	229609	229616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012578	TCAA	2	8	230068	230075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012578	GCTT	2	8	230181	230188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012578	GGCA	2	8	230687	230694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012578	GTGA	2	8	230720	230727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012578	TAAG	2	8	246521	246528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012578	TCAA	2	8	246790	246797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012578	TAAG	2	8	247880	247887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012578	ATCA	2	8	255240	255247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012578	TCCC	2	8	255265	255272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_012578	AATC	2	8	256675	256682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012578	TAGG	2	8	259146	259153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012578	CTTA	2	8	265565	265572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012578	TGAT	2	8	267918	267925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012578	CTGA	2	8	269832	269839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012578	GATG	2	8	269973	269980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012578	CCTC	2	8	270052	270059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_012578	TATT	2	8	278738	278745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012578	TGAT	2	8	287098	287105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012578	GCAA	2	8	289789	289796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012578	TCAG	2	8	291883	291890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012578	AGTA	2	8	299524	299531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012578	TTAA	2	8	302927	302934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012578	ACTA	2	8	303001	303008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012578	TTTG	2	8	304320	304327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012578	GAAC	2	8	304360	304367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012578	TAGA	2	8	308361	308368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012578	ATAA	2	8	308435	308442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012578	CAAT	2	8	308690	308697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012578	GATT	2	8	310440	310447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012578	GCCT	2	8	310581	310588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012578	CTGA	2	8	311343	311350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012578	GTAC	2	8	311427	311434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012578	AGTA	2	8	311829	311836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012578	CGTC	2	8	311866	311873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012578	AAAG	2	8	311988	311995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012578	GTAG	2	8	319559	319566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012578	TAAA	2	8	324458	324465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012578	GTAA	2	8	335028	335035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012578	CCAG	2	8	337115	337122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012578	TACT	2	8	345769	345776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012578	TCAT	2	8	347839	347846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012578	TGCT	2	8	348043	348050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012578	GCTA	2	8	354831	354838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012578	GTTG	2	8	360258	360265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012578	TAAG	2	8	363633	363640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012578	AGGA	2	8	366471	366478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012578	ATGA	2	8	367952	367959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012578	AAGA	2	8	369857	369864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012578	CATG	2	8	373872	373879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012578	CGGT	2	8	374412	374419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012578	ATTA	2	8	374480	374487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012578	AATG	2	8	380176	380183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012578	TTCT	2	8	381559	381566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012578	ATAA	2	8	386059	386066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012578	CAAT	2	8	386314	386321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012578	GATT	2	8	388045	388052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012578	GCCT	2	8	388186	388193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012578	CTGA	2	8	388948	388955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012578	GTAC	2	8	389032	389039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012578	AGTA	2	8	389434	389441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012578	CGTC	2	8	389471	389478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012578	AAAG	2	8	389593	389600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012578	TCCA	2	8	397456	397463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012578	GCAA	2	8	405261	405268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012578	CACT	2	8	406364	406371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012578	ACGA	2	8	426869	426876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012578	TCCT	2	8	438897	438904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012578	GTAG	2	8	438931	438938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012578	CGTT	2	8	438979	438986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012578	TATT	2	8	439313	439320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012578	AAAG	2	8	439493	439500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_012578	GTCA	2	8	1233721	1233728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_012578	TTTC	2	8	1235268	1235275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_012578	TCCA	2	8	1239207	1239214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_012578	GTGC	2	8	1242197	1242204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
449	NC_012578	TTGA	2	8	1242265	1242272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_012578	ATTT	2	8	1263471	1263478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_012578	AAGC	2	8	1267616	1267623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_012578	TCTG	2	8	1276659	1276666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_012578	CTGG	2	8	1279184	1279191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_012578	TACT	2	8	1286341	1286348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
472	NC_012578	ATTG	2	8	1286366	1286373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_012578	GACT	2	8	1287559	1287566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_012578	GTGG	2	8	1291552	1291559	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
476	NC_012578	TGAA	2	8	1294317	1294324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
477	NC_012578	TTGC	2	8	1300324	1300331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_012578	GGTA	2	8	1302179	1302186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012578	TGCC	2	8	1302771	1302778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
482	NC_012578	CTTA	2	8	1310726	1310733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_012578	GATG	2	8	1310807	1310814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_012578	AATG	2	8	1310951	1310958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
485	NC_012578	ATCA	2	8	1312707	1312714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_012578	ATTT	2	8	1314311	1314318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012578	ATTA	2	8	1314705	1314712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_012578	TGCG	2	8	1320072	1320079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_012578	CAAA	2	8	1320417	1320424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_012578	CCTT	2	8	1321092	1321099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_012578	AATC	2	8	1321211	1321218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
492	NC_012578	ACCA	2	8	1321808	1321815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
493	NC_012578	TCGT	2	8	1328594	1328601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_012578	TCTA	2	8	1328786	1328793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_012578	CGTT	2	8	1328830	1328837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_012578	CCTC	2	8	1330232	1330239	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_012578	GAAA	2	8	1330263	1330270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_012578	AGTG	2	8	1332048	1332055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_012578	CGTT	2	8	1332278	1332285	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_012578	CGTT	2	8	1336788	1336795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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