MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012578	AAG	2	6	159229	159234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012578	CTTT	2	8	159255	159262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_012578	ATA	2	6	159619	159624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012578	A	6	6	159624	159629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012578	TGA	2	6	159651	159656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012578	GTT	2	6	164522	164527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012578	TTG	2	6	164597	164602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012578	ATT	3	9	164621	164629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012578	GGC	2	6	164630	164635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012578	TAAA	2	8	164636	164643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012578	CTT	2	6	166703	166708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012578	TAT	2	6	166709	166714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012578	TGC	2	6	167177	167182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_012578	TAT	2	6	167188	167193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012578	GTT	2	6	167270	167275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012578	ACA	2	6	167283	167288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012578	CGG	2	6	167302	167307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012578	TAG	2	6	167332	167337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012578	TGA	2	6	167346	167351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012578	A	7	7	167369	167375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012578	A	7	7	167378	167384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012578	TAT	2	6	167412	167417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012578	CCG	2	6	167424	167429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_012578	GC	3	6	167508	167513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_012578	GTG	2	6	167548	167553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012578	AG	3	6	167662	167667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012578	TTA	2	6	167817	167822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012578	GTG	2	6	167832	167837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012578	ATTT	2	8	167910	167917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012578	AAGA	2	8	167945	167952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012578	TCA	2	6	168159	168164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012578	GTT	2	6	168169	168174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012578	TC	3	6	168184	168189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_012578	T	6	6	168322	168327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012578	TGT	2	6	168372	168377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012578	GTTG	2	8	168448	168455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012578	CGT	2	6	168478	168483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012578	TGC	2	6	168755	168760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012578	CAG	2	6	168763	168768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012578	CTCTG	2	10	172158	172167	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
541	NC_012578	GATT	2	8	174229	174236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012578	T	7	7	174285	174291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012578	ATTT	2	8	174294	174301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012578	A	6	6	175364	175369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012578	GCG	2	6	175390	175395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012578	CTTT	2	8	175403	175410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_012578	AGGGCG	2	12	176854	176865	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
548	NC_012578	TA	3	6	177825	177830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012578	GC	3	6	177846	177851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_012578	T	6	6	177867	177872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012578	GAGT	2	8	177889	177896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012578	GCG	2	6	182379	182384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012578	C	6	6	182393	182398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
554	NC_012578	GAA	2	6	182416	182421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012578	GAG	2	6	182469	182474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012578	GTG	2	6	182479	182484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012578	A	6	6	182500	182505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012578	GCA	2	6	182548	182553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012578	CTA	2	6	182560	182565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012578	CAT	2	6	182716	182721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012578	TTC	3	9	182853	182861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012578	CGA	2	6	182912	182917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_012578	CTGAG	2	10	182929	182938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
564	NC_012578	AGCGA	2	10	182955	182964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
565	NC_012578	AAT	2	6	182980	182985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012578	TTTA	2	8	183000	183007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012578	ATT	2	6	183014	183019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012578	GTT	2	6	183023	183028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012578	T	6	6	183039	183044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012578	ATT	2	6	183796	183801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012578	CG	3	6	183814	183819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_012578	GAG	2	6	183828	183833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012578	CAG	2	6	184963	184968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012578	TTGA	2	8	185018	185025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012578	ATATCC	2	12	185037	185048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012578	AAT	2	6	185087	185092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012578	GGTT	2	8	185127	185134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012578	GGC	2	6	185206	185211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012578	GTT	2	6	185249	185254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012578	CAA	2	6	185273	185278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012578	TCGA	2	8	185298	185305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_012578	GGT	2	6	185306	185311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012578	CAA	2	6	185338	185343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_012578	ATG	2	6	185402	185407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012578	CTG	2	6	185422	185427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_012578	GC	3	6	185466	185471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_012578	GC	3	6	185605	185610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_012578	GAGC	2	8	185775	185782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_012578	GAT	2	6	185818	185823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012578	GGC	2	6	185887	185892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012578	TGG	2	6	185961	185966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012578	TCT	2	6	185993	185998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012578	CGAGG	2	10	186012	186021	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
594	NC_012578	TCAA	2	8	186062	186069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_012578	GC	3	6	186070	186075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_012578	CCG	2	6	186149	186154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_012578	TAT	2	6	186189	186194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012578	T	6	6	186259	186264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012578	GAT	2	6	186308	186313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012578	GTC	2	6	186344	186349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_012578	TCGC	2	8	186401	186408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_012578	GCC	2	6	186419	186424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_012578	GTT	2	6	186596	186601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012578	TTG	2	6	186648	186653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012578	GAT	2	6	186662	186667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012578	GCA	2	6	186672	186677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_012578	TGA	2	6	187677	187682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012578	GGC	2	6	187690	187695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_012578	AGC	2	6	187699	187704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012578	TTG	2	6	187782	187787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012578	GTT	2	6	189966	189971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012578	CG	3	6	189976	189981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012578	T	6	6	192390	192395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012578	TTAA	2	8	192400	192407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012578	TTG	2	6	194589	194594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012578	ATT	2	6	199303	199308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012578	CAG	2	6	200415	200420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012578	AG	3	6	200419	200424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012578	ACGG	2	8	201910	201917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_012578	G	6	6	201916	201921	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012578	CTTT	2	8	201948	201955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_012578	AAG	2	6	202493	202498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012578	TAAA	2	8	202508	202515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012578	TAG	2	6	203451	203456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012578	T	7	7	204315	204321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012578	CTC	2	6	204422	204427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_012578	TTG	2	6	204476	204481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012578	AGGGG	2	10	204512	204521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012578	AAG	2	6	204540	204545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012578	G	6	6	204545	204550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012578	C	6	6	204563	204568	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
632	NC_012578	AAGT	2	8	204618	204625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012578	AG	4	8	204642	204649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012578	A	6	6	205325	205330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012578	ATG	2	6	205397	205402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012578	CTT	2	6	205525	205530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_012578	TAACG	2	10	205578	205587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
638	NC_012578	TGT	2	6	205599	205604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012578	TAC	2	6	205621	205626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_012578	CCA	2	6	205811	205816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_012578	T	6	6	229205	229210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_012578	CGG	2	6	313384	313389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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