MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011753	AGGCAA	2	12	34862	34873	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011753	TGAAAT	2	12	48607	48618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011753	ATCCCT	2	12	49870	49881	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011753	TCTTTT	2	12	85516	85527	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011753	CAGGAA	2	12	147856	147867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011753	CATGTT	2	12	295258	295269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011753	TGAAAT	2	12	299228	299239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011753	TTTAGA	2	12	354465	354476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011753	GTTTTG	2	12	381458	381469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011753	GGAATT	2	12	402475	402486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011753	GTTTTT	2	12	522472	522483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011753	ATAAAT	2	12	522715	522726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011753	AGAGTG	2	12	582614	582625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011753	CATGTT	2	12	590900	590911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011753	TGAAAT	2	12	595068	595079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011753	TTTAGA	2	12	737042	737053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011753	GGATAA	2	12	782216	782227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011753	CGAAAC	2	12	813561	813572	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011753	GATACA	8	48	816258	816305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011753	TTTTCT	2	12	819971	819982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011753	TTTCTA	2	12	832999	833010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011753	GAAAAC	2	12	841275	841286	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011753	GTTACT	2	12	893748	893759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011753	AGGGAT	2	12	973091	973102	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011753	AGGGAT	2	12	975824	975835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011753	TGTTTA	2	12	979231	979242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011753	TTTATT	2	12	990479	990490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011753	TTTTTG	2	12	1017071	1017082	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011753	ACCAAG	2	12	1074734	1074745	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011753	CCTAGA	7	42	1128843	1128884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011753	GGTGAG	5	30	1157997	1158026	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011753	AGAGCA	2	12	1183001	1183012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011753	TATCTC	8	48	1197982	1198029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011753	AAATTA	2	12	1213079	1213090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011753	AGAAAC	2	12	1242914	1242925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011753	GAAATT	2	12	1256528	1256539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011753	CTTACG	2	12	1266795	1266806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011753	GTTGTA	6	36	1294461	1294496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011753	CTTACG	2	12	1303664	1303675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011753	GTCATT	2	12	1303772	1303783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011753	TCCTTC	2	12	1307227	1307238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011753	TGAACA	3	18	1344283	1344300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011753	GAGATA	2	12	1371915	1371926	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011753	TCTATT	3	18	1385261	1385278	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011753	AGTATC	7	42	1390464	1390505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011753	TGGTTT	2	12	1402418	1402429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011753	ATTAAA	2	12	1408025	1408036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011753	CTAAAG	2	12	1461908	1461919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011753	TAAGGT	3	18	1471819	1471836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011753	ATACTC	2	12	1534548	1534559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011753	ACTGAT	2	12	1571303	1571314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011753	TCATGA	2	12	1584720	1584731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011753	TTTATT	2	12	1611019	1611030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011753	ATATAA	2	12	1653475	1653486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011753	TTGAGC	2	12	1711432	1711443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011753	TATGAA	2	12	1720446	1720457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011753	CTTATT	2	12	1755614	1755625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011753	GGTAAG	2	12	1793304	1793315	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011753	TTTCTG	2	12	1825475	1825486	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011753	TTCTAT	4	24	1825488	1825511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011753	CTATCA	2	12	1870791	1870802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011753	AAAACC	2	12	1893906	1893917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011753	TTAGCT	2	12	1917793	1917804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011753	TGCTTT	2	12	1923945	1923956	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011753	TAGCGC	2	12	1941095	1941106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011753	ACAAAA	2	12	1981889	1981900	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011753	CAATAG	2	12	1989303	1989314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011753	GGATTC	2	12	2013490	2013501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011753	ATTTCG	2	12	2014133	2014144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011753	ATGCCG	2	12	2026338	2026349	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011753	TTTAAT	2	12	2082599	2082610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011753	TTGAGT	2	12	2088310	2088321	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011753	CAAAAT	2	12	2091487	2091498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011753	AAGATA	2	12	2100728	2100739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011753	ATAAAG	2	12	2108832	2108843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011753	TTTTAA	2	12	2169527	2169538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011753	CTAAAA	2	12	2172961	2172972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011753	GTTTTG	2	12	2193966	2193977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011753	CCAAGA	2	12	2239575	2239586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011753	TAGCAA	2	12	2276437	2276448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011753	CTCTTT	2	12	2400055	2400066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011753	GCGTTT	2	12	2440251	2440262	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011753	TAATTA	2	12	2440339	2440350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011753	TATAAA	2	12	2442440	2442451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011753	AAACTT	2	12	2450853	2450864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011753	GATAAG	2	12	2519830	2519841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011753	TGTGTT	2	12	2531042	2531053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011753	TAGAAA	2	12	2544651	2544662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011753	TAAAAA	2	12	2590346	2590357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011753	CAAAAA	2	12	2635197	2635208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011753	TAGAAA	2	12	2661553	2661564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011753	GCTGCA	2	12	2707235	2707246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011753	TCATCG	2	12	2729977	2729988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011753	ACTAAA	2	12	2798701	2798712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011753	CAAGTA	2	12	2872124	2872135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011753	ATTTCA	2	12	2887816	2887827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011753	AGTGTC	2	12	2890970	2890981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011753	AAATCA	2	12	2905748	2905759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011753	TTTTTG	2	12	2928083	2928094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011753	TCAATA	2	12	2928118	2928129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011753	TCATTA	2	12	2933916	2933927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011753	AGCATA	2	12	2984280	2984291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011753	GCTCTA	2	12	2991846	2991857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011753	TTTCCT	2	12	2996920	2996931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011753	TTTTTG	2	12	3031897	3031908	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011753	GCAGAA	5	30	3055547	3055576	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011753	TTCTTG	2	12	3065459	3065470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011753	CATTAT	2	12	3069605	3069616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011753	TGATCT	2	12	3102451	3102462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011753	TAAGGC	2	12	3102482	3102493	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011753	ATTTCA	2	12	3141859	3141870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011753	AGTGTC	2	12	3145200	3145211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011753	ATTTAG	2	12	3163852	3163863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011753	AGCTTA	2	12	3171212	3171223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011753	ATTTCA	2	12	3206138	3206149	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011753	AGTGTC	2	12	3209292	3209303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011753	CAAACG	2	12	3220328	3220339	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011753	ATTTCA	2	12	3248369	3248380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011753	AGTGTC	2	12	3251927	3251938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.