MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	TCATG	2	10	4372	4381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011186	AACGA	2	10	8669	8678	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011186	TTTAA	2	10	8784	8793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011186	TATTT	2	10	50468	50477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011186	AATTA	3	15	51160	51174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011186	AACAT	2	10	62327	62336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011186	GTAAT	2	10	64483	64492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011186	TGCTG	2	10	84309	84318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011186	TACAA	2	10	91291	91300	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011186	ATAAA	2	10	97626	97635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011186	TGAAG	2	10	127323	127332	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011186	AAACA	2	10	144541	144550	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011186	AATGA	2	10	149033	149042	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011186	TTTTA	2	10	155535	155544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011186	CTTAT	2	10	159881	159890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011186	ATTTG	2	10	163083	163092	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011186	TTGAT	2	10	166626	166635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011186	TTTTA	2	10	167861	167870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011186	AATAG	2	10	171584	171593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011186	AAAAT	2	10	173403	173412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011186	ATTAA	2	10	176138	176147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011186	AGGAT	2	10	198793	198802	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011186	TAAAA	2	10	200282	200291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011186	TATCT	2	10	206498	206507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011186	TTACT	2	10	207655	207664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011186	TCTAT	2	10	209684	209693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011186	TTTTA	2	10	234764	234773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011186	ATTTA	2	10	236352	236361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011186	TTTTA	2	10	236405	236414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011186	TATTT	3	15	238496	238510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011186	ATTGA	2	10	240255	240264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011186	CAATA	2	10	246066	246075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011186	TGTGT	2	10	246614	246623	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011186	AATTC	2	10	246629	246638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011186	CAATA	2	10	267385	267394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011186	GTTAA	2	10	271277	271286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011186	GAAAA	2	10	284633	284642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011186	AAAAT	2	10	284684	284693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011186	ATCAA	2	10	288034	288043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011186	ATTAT	2	10	288106	288115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011186	TGTTT	2	10	299269	299278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011186	AGTTA	2	10	306866	306875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011186	TAACT	2	10	309815	309824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011186	TTAAA	2	10	313151	313160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011186	TAAAA	2	10	325685	325694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011186	AGCTT	2	10	331629	331638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011186	AGTAA	2	10	338404	338413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011186	TTTAG	2	10	342638	342647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011186	TATAA	2	10	344174	344183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011186	GCGGA	2	10	350397	350406	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011186	GCGGA	2	10	350603	350612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011186	GCGGA	2	10	350809	350818	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011186	TTTTA	2	10	369203	369212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011186	AATAA	2	10	404329	404338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011186	TGATT	2	10	419324	419333	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011186	GTCTA	2	10	421050	421059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011186	TGTAT	2	10	422939	422948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011186	TTTGA	2	10	439754	439763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011186	TTTAT	2	10	448841	448850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011186	ATGAA	2	10	453877	453886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011186	TGATT	2	10	468365	468374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011186	ACTGA	2	10	476438	476447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011186	TTTTG	2	10	476938	476947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011186	CCTGT	2	10	479233	479242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011186	TAAAA	2	10	481258	481267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011186	ATTAA	2	10	494124	494133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011186	ACGTT	2	10	494156	494165	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011186	TGATA	2	10	497121	497130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011186	TATGT	2	10	502795	502804	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011186	AAAAG	2	10	508473	508482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011186	TAATG	2	10	517722	517731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011186	ATTTT	2	10	525902	525911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011186	TAGCG	2	10	526195	526204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011186	TTAGG	2	10	564358	564367	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011186	ATTTT	2	10	569938	569947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011186	ATTTT	2	10	575629	575638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011186	ATGAA	2	10	576822	576831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011186	GAAAT	2	10	576839	576848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011186	CAATA	2	10	591065	591074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011186	ATAAA	2	10	594875	594884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011186	GTAAG	2	10	595653	595662	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011186	AATCA	2	10	596101	596110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011186	ATTTT	2	10	599979	599988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011186	ATATC	2	10	613234	613243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011186	TTTTA	2	10	618024	618033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011186	TGATT	2	10	628282	628291	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011186	AGATA	2	10	634011	634020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011186	ATTTA	2	10	640911	640920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011186	AATTA	2	10	641927	641936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011186	AAACA	2	10	642022	642031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011186	TATTC	2	10	698819	698828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011186	GAGAA	2	10	701946	701955	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011186	AATAG	2	10	709342	709351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011186	CTTTT	2	10	711554	711563	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011186	TAAAA	2	10	713800	713809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011186	CGCTT	2	10	718364	718373	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011186	ACTTC	2	10	721048	721057	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011186	GAAAC	2	10	721335	721344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011186	AAATG	2	10	721551	721560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011186	CTGCC	2	10	722813	722822	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011186	ACAAA	2	10	724679	724688	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011186	CTGCC	2	10	725169	725178	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_011186	CGCTT	2	10	727426	727435	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011186	GAAAC	2	10	727537	727546	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011186	GTTTC	2	10	730658	730667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011186	AGAAA	2	10	733759	733768	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011186	CTGCC	2	10	733936	733945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_011186	GGTTT	2	10	734061	734070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011186	CTGCC	2	10	737806	737815	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_011186	ACCAA	2	10	748102	748111	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011186	CTGAA	2	10	748593	748602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011186	GAAAC	2	10	750935	750944	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011186	CGAAA	2	10	752139	752148	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011186	CGCTT	2	10	752590	752599	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011186	CTGCC	2	10	758041	758050	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011186	GGTTT	2	10	758166	758175	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011186	CTGCC	2	10	758619	758628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011186	TATTT	2	10	759257	759266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011186	TATTT	2	10	761180	761189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011186	ACATC	2	10	761199	761208	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011186	CTGCC	2	10	767799	767808	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_011186	ACCAA	2	10	774578	774587	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011186	CTGCC	2	10	774683	774692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_011186	CGCTT	2	10	777759	777768	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011186	AAACA	2	10	777871	777880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011186	ATGAA	2	10	778087	778096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011186	CGCTT	2	10	778878	778887	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011186	GCTTT	2	10	783186	783195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011186	TTTAA	2	10	795927	795936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011186	AACTA	2	10	795943	795952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011186	GAAAC	2	10	796307	796316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011186	GTTTC	2	10	801549	801558	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011186	ACCAA	2	10	805515	805524	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011186	GAAAC	2	10	805708	805717	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011186	CTGAA	2	10	806005	806014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011186	GAAAC	2	10	808470	808479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011186	CTGAA	2	10	808767	808776	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011186	GAAAC	2	10	809032	809041	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011186	CTGCC	2	10	809506	809515	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_011186	CGCTT	2	10	815875	815884	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011186	CGAAA	2	10	815985	815994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011186	AAATG	2	10	816202	816211	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011186	GAAGC	2	10	831407	831416	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011186	ATTTT	2	10	843532	843541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011186	AATAA	2	10	849713	849722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011186	AATGT	2	10	851813	851822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011186	TTTTA	2	10	851859	851868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011186	TAAAA	2	10	1316527	1316536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_011186	ATTTT	2	10	1322727	1322736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_011186	ACTTT	2	10	1349699	1349708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_011186	GTAAT	2	10	1365577	1365586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011186	TTACA	2	10	1366079	1366088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
195	NC_011186	GATAT	2	10	1372787	1372796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.