MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	GAAC	2	8	298	305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011185	AGAC	2	8	458	465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011185	AGAC	2	8	492	499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011185	TAAC	2	8	1136	1143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011185	ATTG	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011185	AGAA	2	8	1267	1274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011185	TTAC	2	8	1411	1418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011185	TTAT	2	8	1434	1441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011185	TGTT	2	8	1517	1524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011185	ATTT	2	8	12957	12964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011185	GTCC	2	8	19209	19216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011185	ATCA	3	12	20467	20478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011185	TAGT	2	8	24717	24724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011185	TGTT	2	8	26550	26557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011185	TTTG	2	8	26958	26965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011185	ACTC	2	8	28073	28080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011185	TTTA	2	8	31878	31885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011185	TGAT	2	8	32520	32527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011185	TGCT	2	8	35503	35510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011185	TTGT	2	8	35529	35536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011185	TTAA	2	8	36495	36502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011185	TTGG	2	8	37853	37860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011185	ATTA	2	8	37862	37869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011185	CATT	2	8	42943	42950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011185	GATT	2	8	44345	44352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011185	TTTA	2	8	44588	44595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011185	GTTT	2	8	51064	51071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011185	CTAT	2	8	54672	54679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011185	GCTT	2	8	54966	54973	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011185	AGAT	2	8	55927	55934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011185	CTTA	2	8	57147	57154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011185	AGTT	2	8	58270	58277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011185	AATT	2	8	58416	58423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011185	ATTT	2	8	58911	58918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011185	CTAA	2	8	58940	58947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011185	ATAA	2	8	59495	59502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011185	AATT	2	8	61445	61452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011185	TTGA	2	8	62652	62659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011185	ATGA	2	8	62685	62692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011185	ATTT	2	8	62759	62766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011185	TTAT	2	8	62828	62835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011185	TTTA	2	8	62944	62951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011185	TAAA	2	8	62983	62990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011185	ATTT	2	8	63611	63618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011185	CTAT	2	8	63717	63724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011185	GTAA	2	8	63725	63732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011185	AAAC	2	8	64943	64950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011185	TAAA	2	8	66501	66508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011185	ACTT	2	8	66522	66529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011185	TTGA	2	8	66881	66888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011185	ACTG	2	8	68412	68419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011185	CTTC	2	8	68456	68463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011185	AGTT	2	8	70552	70559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011185	TTCA	2	8	72435	72442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011185	CATT	2	8	73454	73461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011185	TAAA	2	8	74437	74444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011185	GATA	2	8	76127	76134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011185	TACT	2	8	76145	76152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011185	TCTA	2	8	87626	87633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011185	TAAA	2	8	112284	112291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011185	AAAG	2	8	113190	113197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011185	CATA	2	8	123186	123193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011185	CAAT	2	8	141141	141148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011185	ATCA	2	8	141323	141330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011185	TGAA	2	8	141366	141373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011185	TGTT	2	8	145194	145201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011185	AAGT	2	8	145349	145356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011185	AATG	2	8	145390	145397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011185	TAAG	2	8	147956	147963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011185	TTAA	2	8	148052	148059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011185	AAAG	2	8	156997	157004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011185	TTAT	2	8	157008	157015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011185	CTTT	2	8	160572	160579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011185	AATT	2	8	160587	160594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011185	ATAC	2	8	163612	163619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011185	AATA	2	8	163633	163640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011185	CTAA	2	8	163693	163700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011185	ATTA	2	8	166546	166553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011185	AAGG	2	8	166766	166773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011185	TTTA	2	8	167177	167184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011185	ACTT	2	8	168711	168718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011185	TGAA	2	8	169193	169200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011185	TTAA	2	8	169236	169243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011185	CAGT	2	8	169326	169333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011185	AAAT	2	8	169557	169564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011185	ATTT	2	8	169649	169656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011185	ATGA	2	8	169666	169673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011185	TTTA	2	8	169745	169752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011185	TAAG	2	8	169760	169767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011185	GATT	2	8	169782	169789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011185	AGTA	2	8	171251	171258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011185	ATGG	2	8	172382	172389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011185	GTTA	2	8	175216	175223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011185	TCCT	2	8	179265	179272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011185	GTTT	2	8	179277	179284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011185	AATA	2	8	179380	179387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.